Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10145
• Subject: XM_011525175.2
• Aligned Length: 1830
• Identities: 1493
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGGACGTGGTAGAGGTCGCGGGCAGTTGGTGGGCACAAGAGCGAGAGGACATCATTATGAAATACGAAAAGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGTGGTAGAGGTCGCGGGCAGTTGGTGGGCACAAGAGCGAGAGGACATCATTATGAAATACGAAAAGGG  74

Query   75  ACACCGAGCTGGGCTGCCAGAGGACAAGGGGCCTAAGCCTTTTCGAAGCTACAACAACAACGTCGATCATTTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACACCGAGCTGGGCTGCCAGAGGACAAGGGGCCTAAGCCTTTTCGAAGCTACAACAACAACGTCGATCATTTGG  148

Query  149  GGATTGTACA----------------------------------------------------------------  158
            ||||||||||                                                                
Sbjct  149  GGATTGTACAGTCCTGCCCCTCCTGGGAATCAGCCCCACAGGAAGGCCCTTGTCCTCCCTTCCCTGTGCCTTCT  222

Query  159  --------------------------------------------------------------------------  158
                                                                                      
Sbjct  223  CCTGGGCTGAGCCCTGAGCTGGAAAGGGACAGAGCCAGTCCTTTCTGGGGGTCGGCACCCAGGCTGGGGCCGCT  296

Query  159  ---------------------------------------------TGAGACGGAGCTGCCTCCTCTGACTGCGC  187
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGGCCCCGTGCAGTTCCTCAGCTCTGCCTGGGTTGCCTTACAGTGAGACGGAGCTGCCTCCTCTGACTGCGC  370

Query  188  GGGAGGCGAAGCAAATTCGGCGGGAGATCAGCCGAAAGAGCAAGTGGGTGGATATGCTGGGAGACTGGGAGAAA  261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAGGCGAAGCAAATTCGGCGGGAGATCAGCCGAAAGAGCAAGTGGGTGGATATGCTGGGAGACTGGGAGAAA  444

Query  262  TACAAAAGCAGCAGAAAGCTCATAGATCGAGCGTACAAGGGAATGCCCATGAACATCCGGGGCCCGATGTGGTC  335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACAAAAGCAGCAGAAAGCTCATAGATCGAGCGTACAAGGGAATGCCCATGAACATCCGGGGCCCGATGTGGTC  518

Query  336  AGTCCTCCTGAACATTGAGGAAATGAAGTTGAAAAACCCCGGAAGATACCAGATCATGAAGGAGAAGGGCAAGA  409
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTCCTCCTGAACACTGAGGAAATGAAGTTGAAAAACCCCGGAAGATACCAGATCATGAAGGAGAAGGGCAAGA  592

Query  410  GGTCATCTGAGCACATCCAGCGCATCGACCGGGACATAAGCGGGACATTAAGGAAGCATATGTTCTTCAGGGAT  483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGTCATCTGAGCACATCCAGCGCATCGACCGGGACATAAGCGGGACATTAAGGAAGCATATGTTCTTCAGGGAT  666

Query  484  CGATACGGAACCAAGCAGCGGGAACTACTCCACATCCTCCTGGCATATGAGGAGTATAACCCGGAGGTGGGCTA  557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGATACGGAACCAAGCAGCGGGAACTACTCCACATCCTCCTGGCATATGAGGAGTATAACCCGGAGGTGGGCTA  740

Query  558  CTGCAGGGACCTGAGCCACATCGCCGCCTTGTTCCTCCTCTATCTTCCTGAGGAGGATGCATTCTGGGCACTGG  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGCAGGGACCTGAGCCACATCGCCGCCTTGTTCCTCCTCTATCTTCCTGAGGAGGATGCATTCTGGGCACTGG  814

Query  632  TGCAGCTGCTGGCCAGTGAGAGGCACTCCCTGCAGGGATTTCACAGCCCAAATGGCGGGACCGTCCAGGGGCTC  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCAGCTGCTGGCCAGTGAGAGGCACTCCCTGCAGGGATTTCACAGCCCAAATGGCGGGACCGTCCAGGGGCTC  888

Query  706  CAAGACCAACAGGAGCATGTGGTAGCCACGTCACAACCCAAGACCATGGGGCATCAGGACAAGAAAGATCTATG  779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGACCAACAGGAGCATGTGGTAGCCACGTCACAACCCAAGACCATGGGGCATCAGGACAAGAAAGATCTATG  962

Query  780  TGGGCAGTGTTCCCCGTTAGGCTGCCTCATCCGGATATTGATTGACGGGATCTCTCTCGGGCTCACCCTGCGCC  853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGCAGTGTTCCCCGTTAGGCTGCCTCATCCGGATATTGATTGACGGGATCTCTCTCGGGCTCACCCTGCGCC  1036

Query  854  TGTGGGACGTGTATCTGGTAGAAGGCGAACAGGCGTTGATGCCGATAACAAGAATCGCCTTTAAGGTTCAGCAG  927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTGGGACGTGTATCTGGTAGAAGGCGAACAGGCGTTGATGCCGATAACAAGAATCGCCTTTAAGGTTCAGCAG  1110

Query  928  AAGCGCCTCACGAAGACGTCCAGGTGTGGCCCGTGGGCACGTTTTTGCAACCGGTTCGTTGATACCTGGGCCAG  1001
            |                                                                         
Sbjct 1111  A-------------------------------------------------------------------------  1111

Query 1002  GGATGAGGACACTGTGCTCAAGCATCTTAGGGCCTCTATGAAGAAACTAACAAGAAAGCAGGGGGACCTGCCAC  1075
                                                                                      
Sbjct 1112  --------------------------------------------------------------------------  1111

Query 1076  CCCCAGCCAAACCCGAGCAAGGGTCGTCGGCATCCAGGCCTGTGCCGGCTTCACGTGGCGGGAAGACCCTCTGC  1149
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112  ------CCAAACCCGAGCAAGGGTCGTCGGCATCCAGGCCTGTGCCGGCTTCACGTGGCGGGAAGACCCTCTGC  1179

Query 1150  AAGGGGGACAGGCAGGCCCCTCCAGGCCCACCAGCCCGGTTCCCGCGGCCCATTTGGTCAGCTTCCCCGCCACG  1223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  AAGGGGGACAGGCAGGCCCCTCCAGGCCCACCAGCCCGGTTCCCGCGGCCCATTTGGTCAGCTTCCCCGCCACG  1253

Query 1224  GGCACCTCGTTCTTCCACACCCTGTCCTGGTGGGGCTGTCCGGGAAGACACCTACCCTGTGGGCACTCAGGGTG  1297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  GGCACCTCGTTCTTCCACACCCTGTCCTGGTGGGGCTGTCCGGGAAGACACCTACCCTGTGGGCACTCAGGGTG  1327

Query 1298  TGCCCAGCCCGGCCCTGGCTCAGGGAGGACCTCAGGGTTCCTGGAGATTCCTGCAGTGGAACTCCATGCCCCGC  1371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  TGCCCAGCCCGGCCCTGGCTCAGGGAGGACCTCAGGGTTCCTGGAGATTCCTGCAGTGGAACTCCATGCCCCGC  1401

Query 1372  CTCCCAACGGACCTGGACGTAGAGGGCCCTTGGTTCCGCCATTATGATTTCAGACAGAGCTGCTGGGTCCGTGC  1445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402  CTCCCAACGGACCTGGACGTAGAGGGCCCTTGGTTCCGCCATTATGATTTCAGACAGAGCTGCTGGGTCCGTGC  1475

Query 1446  CATATCCCAGGAGGACCAGCTGGCCCCCTGCTGGCAGGCTGAACACCCTGCGGAGCGGGTGAGATCGGCTTTCG  1519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476  CATATCCCAGGAGGACCAGCTGGCCCCCTGCTGGCAGGCTGAACACCCTGCGGAGCGGGTGAGATCGGCTTTCG  1549

Query 1520  CTGCACCCAGCACTGATTCCGACCAGGGCACCCCCTTCAGAGCTAGGGACGAACAGCAGTGTGCTCCCACCTCA  1593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550  CTGCACCCAGCACTGATTCCGACCAGGGCACCCCCTTCAGAGCTAGGGACGAACAGCAGTGTGCTCCCACCTCA  1623

Query 1594  GGGCCTTGCCTCTGCGGCCTCCACTTGGAAAGTTCTCAGTTCCCTCCAGGCTTC  1647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624  GGGCCTTGCCTCTGCGGCCTCCACTTGGAAAGTTCTCAGTTCCCTCCAGGCTTC  1677