Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_10160
Subject:
NM_001004330.2
Aligned Length:
1137
Identities:
1136
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGATCTTTATGAATACACTAAGATATCTGCAAACTCATGAATATCTCCTAGATGTGGATTTATGGAGACTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATCTTTATGAATACACTAAGATATCTGCAAACTCATGAATATCTCCTAGATGTGGATTTATGGAGACTTTT  74

Query   75  TGCAAACCTGGAGGAGTTAACTCAGACAAGCCTTGGTTTTGTGAACAGTCTCTTTGGCATCATCAAGGACTATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAAACCTGGAGGAGTTAACTCAGACAAGCCTTGGTTTTGTGAACAGTCTCTTTGGCATCATCAAGGACTATG  148

Query  149  TAGACGCTTCTGAGATTTCCTCATCACTGGATTTTATTTCCGTGCTCACAAAGTATTTCCGAGGGAGTCTCTGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGACGCTTCTGAGATTTCCTCATCACTGGATTTTATTTCCGTGCTCACAAAGTATTTCCGAGGGAGTCTCTGT  222

Query  223  CAGAGCCACCAGACCTACTGCCTGAACTATTCAGCTGCTATCTTTTATCTTGAGAGCCTGAGGCAGAGAGATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGAGCCACCAGACCTACTGCCTGAACTATTCAGCTGCTATCTTTTATCTTGAGAGCCTGAGGCAGAGAGATGA  296

Query  297  CTTTGGAATTTATTTAAAATGGTGTGAGCAGAATGAACAATGCAGACGGCTCCACGTGCCAGAGCTGCTAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTTGGAATTTATTTAAAATGGTGTGAGCAGAATGAACAATGCAGACGGCTCCACGTGCCAGAGCTGCTAGTGG  370

Query  371  CCCCACTACAGAGGCTCACTCGATATCCGTTGTTGCTGAAGAATATCTGGAAAAGGAGCATGGACTCTGCTGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCCACTACAGAGGCTCACTCGATATCCGTTGTTGCTGAAGAATATCTGGAAAAGGAGCATGGACTCTGCTGAG  444

Query  445  AAAATCATGATCTACTCCATCAAGGAAAAGGTGGAAAAGTCCATCCGGGACCTTGAAGGAAAAGTGAAGTGGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAATCATGATCTACTCCATCAAGGAAAAGGTGGAAAAGTCCATCCGGGACCTTGAAGGAAAAGTGAAGTGGCT  518

Query  519  GGACAATTTCCAAAAATTTAGATATCTACAGGAGATTATAGTGTGGCCACCGCTTTGGGATAGAGATAAAAGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACAATTTCCAAAAATTTAGATATCTACAGGAGATTATAGTGTGGCCACCGCTTTGGGATAGAGATAAAAGGT  592

Query  593  TTTTCATTCCAGAGTGTTTGAAACACATTTTTAAAGAACACATGGCAGAAAACATCTTGTCACCAACCAGCAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTCATTCCAGAGTGTTTGAAACACATTTTTAAAGAACACATGGCAGAAAACATCTTGTCACCAACCAGCAGA  666

Query  667  CACCTTCTCTATGAAGGAAAATTAACTCTTGCAGAAAGCACAAGATTCCTAGATGTTTATCTGTTTCTCTTCAA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACCTTCTCTATGAAGGAAAATTAACTCTTGCAGAAAGCACGAGATTCCTAGATGTTTATCTGTTTCTCTTCAA  740

Query  741  TGATTTCCTCTTAGTTACGAAAACTAAGTGCAACAAAAAGAAACTTGGAGGCTCAGACCCTGGTTTAATGTGTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATTTCCTCTTAGTTACGAAAACTAAGTGCAACAAAAAGAAACTTGGAGGCTCAGACCCTGGTTTAATGTGTC  814

Query  815  CTTCTCTTACTCCTGAGTTGCAAGCAGTAATAAAAGAGGGTGGTTCGTGTACAGTACTCGATCAGCCTATTCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTCTCTTACTCCTGAGTTGCAAGCAGTAATAAAAGAGGGTGGTTCGTGTACAGTACTCGATCAGCCTATTCCA  888

Query  889  CTAGATAGATTGGTAGTCAAAAGTATTGAACCACTCCATGTGTCAGTCTTTGGGCTGAGAAATGCTTTTCTTAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTAGATAGATTGGTAGTCAAAAGTATTGAACCACTCCATGTGTCAGTCTTTGGGCTGAGAAATGCTTTTCTTAT  962

Query  963  ACAACACGAAAACAGATATCGACAGTGTATAGCAGCATTCTTATTACAAGCCCAAACGGAAAACATCAAAAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAACACGAAAACAGATATCGACAGTGTATAGCAGCATTCTTATTACAAGCCCAAACGGAAAACATCAAAAAAA  1036

Query 1037  CATGGATGGCACAAATAACAACTGCAATTTCTTGCTTTACCAAGAGTCAGGAAACCAAGAAAATATCTTTATTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CATGGATGGCACAAATAACAACTGCAATTTCTTGCTTTACCAAGAGTCAGGAAACCAAGAAAATATCTTTATTC  1110

Query 1111  ACATTGCCCGCAGAATCCTCTGAAATT  1137
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACATTGCCCGCAGAATCCTCTGAAATT  1137