Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10226
• Subject: NM_001075098.4
• Aligned Length: 1155
• Identities: 843
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCGCGGCCACTGTCCCGGATGCTGCGGCGGCTTCTGAGGTCCAGCGCCCGGAGCTGCAGCTCAGGGGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCGGTGACCCAGCCCTGCCCCGGGGAGTCCGCGCGAGCTGCCTCGGAGGAGGTGTCCAGGCGGAGGCAGTTCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCGGGAGCATGCGGCCCCCTTCTCCGCCTTCCTCACAGACAGCTTCGGCCGGCAGCACAGCTACCTGCGGATC  222

Query    1  ---------------------------------------ATGCCCGAGGAGGGGGTCCCGCTGACCCCCAAAGC  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCCTCACAGAGAAGTGCAACCTCAGATGTCAGTACTGCATGCCCGAGGAGGGGGTCCCGCTGACCCCCAAAGC  296

Query   36  CAACCTGCTGACCACAGAGGAGATCCTGACCCTCGCCCGGCTCTTTGTGAAGGAAGGCATCGACAAGATCCGGC  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAACCTGCTGACCACAGAGGAGATCCTGACCCTCGCCCGGCTCTTTGTGAAGGAAGGCATCGACAAGATCCGGC  370

Query  110  TCACAGGTGGAGAGCCGCTTATCCGGCCGGACGTGGTGGACATTGTGGCCCAGCTCCAGCGGCTGGAAGGGCTG  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCACAGGTGGAGAGCCGCTTATCCGGCCGGACGTGGTGGACATTGTGGCCCAGCTCCAGCGGCTGGAAGGGCTG  444

Query  184  AGAACCATAGGTGTTACCACCAATGGCATCAACCTGGCCCGGCTACTGCCCCAGCTTCAGAAGGCTGGTCTCAG  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAACCATAGGTGTTACCACCAATGGCATCAACCTGGCCCGGCTACTGCCCCAGCTTCAGAAGGCTGGTCTCAG  518

Query  258  TGCCATCAACATCAGCCTGGACACCCTGGTGCCTGCCAAGTTTGAGTTCATTGTCCGCAGGAAAGGCTTCCACA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCATCAACATCAGCCTGGACACCCTGGTGCCTGCCAAGTTTGAGTTCATTGTCCGCAGGAAAGGCTTCCACA  592

Query  332  AGGTCATGGAGGGCATCCACAAGGCCATCGAGCTGGGCTACAACCCTGTGAAGGTGAACTGTGTGGTGATGCGA  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGTCATGGAGGGCATCCACAAGGCCATCGAGCTGGGCTACAACCCTGTGAAGGTGAACTGTGTGGTGATGCGA  666

Query  406  GGCCTTAACGAGGATGAACTCCTGGACTTTGCGGCCTTGACTGAGGGCCTCCCCCTGGATGTGCGCTTCATAGA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCTTAACGAGGATGAACTCCTGGACTTTGCGGCCTTGACTGAGGGCCTCCCCCTGGATGTGCGCTTCATAGA  740

Query  480  GTATATGCCCTTTGATGGCAACAAGTGGAACTTCAAGAAGATGGTCAGCTATAAGGAGATGCTAGACACTGTCC  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTATATGCCCTTTGATGGCAACAAGTGGAACTTCAAGAAGATGGTCAGCTATAAGGAGATGCTAGACACTGTCC  814

Query  554  GGCAGCAGTGGCCAGAGCTGGAGAAGGTGCCAGAGGAGGAATCCAGCACAGCCAAGGCCTTTAAAATCCCTGGC  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCAGCAGTGGCCAGAGCTGGAGAAGGTGCCAGAGGAGGAATCCAGCACAGCCAAGGCCTTTAAAATCCCTGGC  888

Query  628  TTCCAAGGCCAGATCAGCTTCATCACATCCATGTCTGAGCATTTCTGTGGGACCTGCAACCGCCTGCGAATCAC  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCCAAGGCCAGATCAGCTTCATCACATCCATGTCTGAGCATTTCTGTGGGACCTGCAACCGCCTGCGAATCAC  962

Query  702  AGCTGATGGGAACCTCAAGGTCTGCCTCTTTGGAAACTCTGAGGTATCCCTGCGGGATCACCTGCGAGCTGGGG  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCTGATGGGAACCTCAAGGTCTGCCTCTTTGGAAACTCTGAGGTATCCCTGCGGGATCACCTGCGAGCTGGGG  1036

Query  776  CCTCTGAGCAGGAGCTGCTGAGAATCATTGGGGCTGCTGTGGGCAGGAAGAAGCGGCAGCATGCAG--------  841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 1037  CCTCTGAGCAGGAGCTGCTGAGAATCATTGGGGCTGCTGTGGGCAGGAAGAAGCGGCAGCATGCAGGCATGTTC  1110

Query  842  AG-------------------------------------------  843
            ||                                           
Sbjct 1111  AGTATTTCCCAGATGAAGAACCGGCCCATGATCCTCATCGGTGGG  1155