Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10320
- Subject:
- XM_017018889.1
- Aligned Length:
- 2331
- Identities:
- 1464
- Gaps:
- 867
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGAGATAAGAAAGCTGGGTTTTCTGTTTTCTGGGCTGATGATGGCTTGGATACAGGACCCATCCTTCTTCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GAGATCATGTGATGTTGAACCCAATGATACAGTGGATGCACTTTATAATCGGTTTCTTTTTCCTGAAGGAATCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGGCCATGGTAGAAGCTGTCCAACTCATAGCTGATGGAAAAGCTCCTCGTATACCCCAGCCAGAAGAAGGGGCA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACATATGAAGGTATCCAGAAAAAGGAAAATGCTGAGATTTCTTGGGACCAGTCTGCCGAAGTTTTACATAACTG 296
Query 1 ----------------------------------------------------ATGGTCACTTTCTATGGCTCGA 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATTCGAGGTCATGATAAAGTCCCTGGAGCTTGGACAGAGATAAATGGACAGATGGTCACTTTCTATGGCTCGA 370
Query 23 CATTACTGAATAGCTCTGTGCCTCCTGGAGAACCACTGGAAATTAAAGGTGCCAAGAAGCCTGGTCTCGTTACC 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CATTACTGAATAGCTCTGTGCCTCCTGGAGAACCACTGGAAATTAAAGGTGCCAAGAAGCCTGGTCTCGTTACC 444
Query 97 AAAAATGGACTTGTTCTTTTTGGTAACGATGGAAAAGCACTGACGGTGAGAAATCTGCAGTTTGAAGATGGAAA 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAAATGGACTTGTTCTTTTTGGTAACGATGGAAAAGCACTGACGGTGAGAAATCTGCAGTTTGAAGATGGAAA 518
Query 171 AATGATCCCTGCCTCTCAGTACTTTTCAACGGGTGAGACGTCAGTGGTAGAACTGACAGCTGAAGAGGTGAAAG 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATGATCCCTGCCTCTCAGTACTTTTCAACGGGTGAGACGTCAGTGGTAGAACTGACAGCTGAAGAGGTGAAAG 592
Query 245 TGGCAGAGACCATCAAGGTCATCTGGGCTGGAATTTTAAGCAATGTCCCCATTATTGAAGACTCAACAGACTTC 318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGCAGAGACCATCAAGGTCATCTGGGCTGGAATTTTAAGCAATGTCCCCATTATTGAAGACTCAACAGACTTC 666
Query 319 TTTAAATCTGGAGCAAGCTCAATGGATGTTGCCAGGCTGGTTGAAGAGATCAGACAGAAATGTGGTGGGCTTCA 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTAAATCTGGAGCAAGCTCAATGGATGTTGCCAGGCTGGTTGAAGAGATCAGACAGAAATGTGGTGGGCTTCA 740
Query 393 GTTGCAGAATGAAGATGTCTATATGGCCACCAAGTTTGAAGGCTTTATCCAAAAGGTCGTGAGGAAACTGAGAG 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTTGCAGAATGAAGATGTCTATATGGCCACCAAGTTTGAAGGCTTTATCCAAAAGGTCGTGAGGAAACTGAGAG 814
Query 467 GAGAAGATCAAGAGGTGGAGCTGGTTGTAGATTATATTTCAAAGGAGGTCAATGAAATCATGGTAAAAATGCCA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGAAGATCAAGAGGTGGAGCTGGTTGTAGATTATATTTCAAAGGAGGTCAATGAAATCATGGTAAAAATGCCA 888
Query 541 TACCAGTGTTTCATAAATGGACAGTTCACAGATGCAGACGATGGAAAGACTTACGACACTATCAACCCAACAGA 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACCAGTGTTTCATAAATGGACAGTTCACAGATGCAGACGATGGAAAGACTTACGACACTATCAACCCAACAGA 962
Query 615 TGGATCTACAATATGCAAAGTATCCTACGCTTCTTTGGCGGATGTTGATAAAGCAGTAGCAGCAGCAAAAGATG 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGATCTACAATATGCAAAGTATCCTACGCTTCTTTGGCGGATGTTGATAAAGCAGTAGCAGCAGCAAAAGATG 1036
Query 689 CTTTTGAAAACGGTGAATGGGGAAGAATGAATGCAAGAGAAAGAGGAAGATTGATGTATAGACTTGCAGACCTA 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTTTGAAAACGGTGAATGGGGAAGAATGAATGCAAGAGAAAGAGGAAGATTGATGTATAGACTTGCAGACCTA 1110
Query 763 CTGGAAGAGAACCAAGAAGAGCTGGCAACTATTGAAGCCCTTGATTCAGGGGCTGTCTATACCTTGGCCCTGAA 836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGGAAGAGAACCAAGAAGAGCTGGCAACTATTGAAGCCCTTGATTCAGGGGCTGTCTATACCTTGGCCCTGAA 1184
Query 837 GACACACATTGGAATGTCTGTGCAAACATTCAGATATTTTGCTGGCTGGTGCGACAAAATTCAGGGTTCTACTA 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GACACACATTGGAATGTCTGTGCAAACATTCAGATATTTTGCTGGCTGGTGCGACAAAATTCAGGGTTCTACTA 1258
Query 911 TTCCAATCAACCAGGCCCGTCCAAATCGCAATCTGACCTTCACCAAGAAAGAGCCACTCGGTGTCTGTGCCATT 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTCCAATCAACCAGGCCCGTCCAAATCGCAATCTGACCTTCACCAAGAAAGAGCCACTCGGTGTCTGTGCCATT 1332
Query 985 ATTATTCCCTGGAACTACCCGCTGATGATGCTGGCATGGAAGAGTGCTGCGTGTTTGGCAGCAGGCAATACCTT 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATTATTCCCTGGAACTACCCGCTGATGATGCTGGCATGGAAGAGTGCTGCGTGTTTGGCAGCAGGCAATACCTT 1406
Query 1059 AGTGCTCAAGCCAGCACAGGTCACGCCCTTGACTGCTTTGAAGTTTGCAGAACTGTCTGTGAAAGCAGGCTTTC 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGTGCTCAAGCCAGCACAGGTCACGCCCTTGACTGCTTTGAAGTTTGCAGAACTGTCTGTGAAAGCAGGCTTTC 1480
Query 1133 CAAAGGGGGTCATCAACATCATTCCAGGCTCAGGTGGCATAGCAGGACAACGTCTGTCTGAACATCCTGACATC 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAAAGGGGGTCATCAACATCATTCCAGGCTCAGGTGGCATAGCAGGACAACGTCTGTCTGAACATCCTGACATC 1554
Query 1207 CGCAAACTTGGTTTCACTGGATCCACTCCTATTGGCAAACAGATCATGAAGAGCTGTGCTGTTAGCAACTTGAA 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGCAAACTTGGTTTCACTGGATCCACTCCTATTGGCAAACAGATCATGAAGAGCTGTGCTGTTAGCAACTTGAA 1628
Query 1281 GAAAGTTTCCCTTGAGCTTGGTGGCAAGTCTCCACTTATAATATTTAATGACTGTGAACTTGACAAGGCTGTGC 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAAAGTTTCCCTTGAGCTTGGTGGCAAGTCTCCACTTATAATATTTAATGACTGTGAACTTGACAAGGCTGTGC 1702
Query 1355 GAATGGGCATGGGAGCAGTATTTTTCAACAAAGGAGAGAACTGTATTGCTGCTGGGCGGTTGTTCGTGGAAGAA 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GAATGGGCATGGGAGCAGTATTTTTCAACAAAGGAGAGAACTGTATTGCTGCTGGGCGGTTGTTCGTGGAAGAA 1776
Query 1429 TCCATCCACGACGAATTTGTGACAAGA-------------------------------GTGATCCAC------- 1464
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct 1777 TCCATCCACGACGAATTTGTGACAAGAGTGGTAGAAGAAATTAAAAAGATGAAAATTGGTGATCCACTTGACAG 1850
Query 1465 -------------------------------------------------------------------------- 1464
Sbjct 1851 ATCCACTGATCATGGGCCCCAAAATCATAAGGCTCATCTGGAAAAGCTGCTGCAATACTGTGAAACTGGAGTGA 1924
Query 1465 -------------------------------------------------------------------------- 1464
Sbjct 1925 AAGAAGGGGCCACTTTGGTGTACGGGGGAAGACAAGTCCAAAGGCCAGGCTTTTTCATGGAGCCGACCGTGTTC 1998
Query 1465 -------------------------------------------------------------------------- 1464
Sbjct 1999 ACAGATGTGGAAGACTACATGTACCTCGCCAAAGAGGAATCCTTTGGGCCTATTATGGTCATTTCTAAATTCCA 2072
Query 1465 -------------------------------------------------------------------------- 1464
Sbjct 2073 AAATGGGGACATCGATGGAGTGTTGCAGCGAGCAAATAGTACAGAGTATGGTTTGGCCTCAGGGGTTTTTACAA 2146
Query 1465 -------------------------------------------------------------------------- 1464
Sbjct 2147 GAGACATAAACAAAGCTATGTATGTGAGTGAAAAACTGGAAGCAGGAACTGTTTTTATTAACACATACAACAAG 2220
Query 1465 -------------------------------------------------------------------------- 1464
Sbjct 2221 ACAGATGTGGCGGCCCCATTTGGCGGAGTTAAACAATCTGGCTTTGGAAAAGACTTAGGTGAGGAAGCTCTAAA 2294
Query 1465 ------------------------------------- 1464
Sbjct 2295 TGAATATCTCAAAACCAAGACGGTGACACTGGAATAT 2331