Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10424
• Subject: NM_001869.3
• Aligned Length: 1257
• Identities: 1248
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ------ATGAGGTTGATCCTGTTTTTTGGTGCCCTTTTTGGGCATATCTACTGTCTAGAAACATTTGTGGGAGA  68
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCATGAGGTTGATCCTGTTTTTTGGTGCCCTTTTTGGGCATATCTACTGTCTAGAAACATTTGTGGGAGA  74

Query   69  CCAAGTTCTTGAGATTGTACCAAGCAATGAAGAACAAATTAAAAATCTGCTACAATTGGAGGCTCAAGAACATC  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAGTTCTTGAGATTGTACCAAGCAATGAAGAACAAATTAAAAATCTGCTACAATTGGAGGCTCAAGAACATC  148

Query  143  TCCAGCTTGATTTTTGGAAATCACCCACCACCCCAGGGGAGACAGCCCACGTCCGAGTTCCCTTCGTCAACGTC  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCAGCTTGATTTTTGGAAATCACCCACCACCCCAGGGGAGACAGCCCACGTCCGAGTTCCCTTCGTCAACGTC  222

Query  217  CAGGCAGTCAAAGTGTTCTTGGGGTCCCAGGGAATTGCCTATTCCATCATGATTGAAGACGTGCAGGTCCTGTT  290
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGCAGTCAAAGTGTTCTTGGAGTCCCAGGGAATTGCCTATTCCATCATGATTGAAGACGTGCAGGTCCTGTT  296

Query  291  GGACAAAGAGAATGAAGAAATGCTTTTTAATAGGAGAAGAGAACGGAGTGGTAACTTCAATTTTGGGGCCTACC  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACAAAGAGAATGAAGAAATGCTTTTTAATAGGAGAAGAGAACGGAGTGGTAACTTCAATTTTGGGGCCTACC  370

Query  365  ATACCCTGGAAGAGATTTCCCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGCACCCCGGTCTAGTGAGCAAAGTGAAT  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATACCCTGGAAGAGATTTCCCAAGAAATGGATAACCTCGTGGCTGAGCACCCTGGTCTAGTGAGCAAAGTGAAT  444

Query  439  ATTGGCTCTTCTTTTGAGAACCGGCCTATGAACGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCTATCTG  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGGCTCTTCTTTTGAGAACCGGCCTATGAACGTGCTCAAGTTCAGCACCGGAGGAGACAAGCCAGCTATCTG  518

Query  513  GCTGGATGCTGGGATCCATGCTCGAGAGTGGGTTACACAAGCTACGGCACTTTGGACAGCAAATAAGATTGTTT  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGATGCTGGGATCCATGCTCGAGAGTGGGTTACACAAGCTACGGCACTTTGGACAGCAAATAAGATTGTTT  592

Query  587  CTGATTATGGAAAGGACCCATCCATCACTTCCATTCTGGACGCCCTGGATATCTTCCTCCTGCCAGTCACAAAC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGATTATGGAAAGGACCCATCCATCACTTCCATTCTGGATGCCCTGGATATCTTCCTCCTGCCAGTCACAAAC  666

Query  661  CCTGATGGATACGTGTTCTCTCAAACCAAAAATCGTATGTGGCGGAAGACCCGGTCCAAGGTATCTGGAAGCCT  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTGATGGATACGTGTTCTCTCAAACCAAAAATCGTATGTGGCGGAAGACCCGGTCCAAGGTATCTGGAAGCCT  740

Query  735  CTGTGTTGGTGTGGATCCTAACCGGAACTGGGATGCAGGTTTTGGAGGACCTGGAGCCAGCAGCAACCCTTGCT  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTGTTGGTGTGGATCCTAACCGGAACTGGGATGCAGGTTTTGGAGGACCTGGAGCCAGCAGCAACCCTTGCT  814

Query  809  CTGATTCATACCACGGACCCAGTGCCAACTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGTCAT  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGATTCATACCACGGACCCAGTGCCAACTCTGAAGTTGAAGTGAAATCCATAGTGGACTTCATCAAGAGTCAT  888

Query  883  GGAAAAGTCAAGGCCTTCATTACCCTCCACAGCTATTCCCAGCTGCTGATGTTCCCCTATGGGTACAAATGTAC  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAAAGTCAAGGCCTTCATTACCCTCCACAGCTATTCCCAGCTGCTGATGTTCCCCTATGGGTACAAATGTAC  962

Query  957  CAAGTTAGATGACTTTGATGAGCTGAGTGAAGTGGCCCAAAAGGCTGCCCAATCTCTGAGAAGCCTGCATGGCA  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGTTAGATGACTTTGATGAGCTGAGTGAAGTGGCCCAAAAGGCTGCCCAATCTCTGAGAAGCCTGCATGGCA  1036

Query 1031  CCAAGTACAAAGTGGGACCAATCTGCTCTGTCATCTACCAAGCCAGTGGAGGAAGCATTGACTGGTCCTATGAT  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAGTACAAAGTGGGACCAATCTGCTCTGTCATCTACCAAGCCAGTGGAGGAAGCATTGACTGGTCCTATGAT  1110

Query 1105  TATGGCATCAAGTACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGGCGCTACGGCTTCCTCTTGCCAGCCCGTCA  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATGGCATCAAGTACTCATTTGCCTTTGAACTGAGAGACACAGGGCGCTACGGCTTCCTCTTGCCAGCCCGTCA  1184

Query 1179  GATCCTGCCCACAGCCGAGGAGACCTGGCTTGGCTTGAAGGCAATCATGGAGCATGTGCGAGACCACCCCTAT  1251
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GATCCTGCCCACAGCCGAGGAGACCTGGCTTGGCTTGAAGGCAATCATGGAGCATGTGCGAGACCACCCCTAT  1257