Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10427
- Subject:
- NM_001302623.2
- Aligned Length:
- 1234
- Identities:
- 1146
- Gaps:
- 73
Alignment
Query 1 ------MAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNG 68
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Sbjct 1 MAVAVAMAGALIGSEPGPAEELAKLEYLSLVSKVCTELDNHLGINDKDLAEFVISLAEKNTTFDTFKASLVKNG 74
Query 69 AEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKE 142
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Sbjct 75 AEFTDSLISNLLRLIQTMRPPAKPSTSKDPVVKPKTEKEKLKELFPVLCQPDNPSVRTMLDEDDVKVAVDVLKE 148
Query 143 LEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRY 216
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Sbjct 149 LEALMPSAAGQEKQRDAEHRDRTKKKKRSRSRDRNRDRDRDRERNRDRDHKRRHRSRSRSRSRTRERNKVKSRY 222
Query 217 RSRSRSQSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVH 290
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Sbjct 223 RSRSRSQSPPKDRKDRDKYGERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQFGCFVQLEGLRKRWEGLVH 296
Query 291 ISELRREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRP 364
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Sbjct 297 ISELRREGRVANVADVVSKGQRVKVKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGEDLNPNRRRNLVGETNEETSMRNPDRP 370
Query 365 THLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEE 438
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Sbjct 371 THLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAANVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEE 444
Query 439 EPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEG 512
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Sbjct 445 EPPFLRGHTKQSMDMSPIKIVKNPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWVDPLPDAEG 518
Query 513 RQIAANMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGS 586
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Sbjct 519 RQIAANMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGNKASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAVHDNQILIVIGETGS 592
Query 587 GKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGML 660
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Sbjct 593 GKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCLGQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGML 666
Query 661 LRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGR 734
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Sbjct 667 LRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLFGLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGR 740
Query 735 TYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYS 808
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Sbjct 741 TYPVEILYTKEPETDYLDASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYS 814
Query 809 ALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRA 882
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Sbjct 815 ALPSEMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTPISQAQAKQRA 888
Query 883 GRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLY 956
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Sbjct 889 GRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGINDLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLY 962
Query 957 TLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFH 1030
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Sbjct 963 TLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVHLGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFH 1036
Query 1031 QTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIKARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSG 1104
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Sbjct 1037 QTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFSNPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSG 1110
Query 1105 FFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPEW----------VVYHELVLTTKEYMRE----VTTIDP 1164
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Sbjct 1111 FFRNAAKKDPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPECPKHFLPVVAVAVSLEQCLSKFEDLNKELGLVTC--- 1181
Query 1165 RWLVEFAPAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR 1214
Sbjct 1182 -------------------------------------------------- 1181