Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10431
• Subject: NM_001281512.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1375
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGACTACTATCTTGACTTACCCCTTTAAAAATCTTCCCACTGCATCAAAATGGGCCCTCAGATTTTCCATAAG  74
            |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATG---ACTATCTTGACTTACCCCTTTAAAAATCTTCCCACTGCATCAAAATGGGCCCTCAGATTTTCCATAAG  71

Query   75  ACCTCTGAGCTGTTCCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAAACGAAGAAGACGTTAGCCAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  ACCTCTGAGCTGTTCCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAAACGAAGAAGACGTTAGCCAAAC  145

Query  149  CCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTGGCACTTCATATAAAGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct  146  CCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTGGCACTT-----------  208

Query  223  CTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGTGTCCCTAAGGAAGTAGT  296
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  209  ----------------------------------CGGGTTTGTTGCATCGGACCAGTGTCCCTAAGGAAGTAGT  248

Query  297  TGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTTGGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  TGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTTGGAG  322

Query  371  CTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCAACCAAGCCATGACCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  CTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCAACCAAGCCATGACCACA  396

Query  445  GGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAGTTGATGTCCGATGTCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  GGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAGTTGATGTCCGATGTCCC  470

Query  519  TATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATCTATGGGCCAGCGACTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  TATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATCTATGGGCCAGCGACTGT  544

Query  593  CTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCATCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTGAGTTCTCCACCAGTGAG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  CTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCACCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTGAGTTCTCCACCAGTGAG  618

Query  667  ACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAACAGGATGAATATGCACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  ACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAACAGGATGAATATGCACT  692

Query  741  GCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGTACCCTTCAAAGTACCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  GCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGTACCCTTCAAAGTACCAG  766

Query  815  GAAAAGATACAGTCACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGGCCAAACTAAAACCTGCA  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  GAAAAGATACAGTTACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGGCCAAACTAAAACCTGCA  840

Query  889  TTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGTGCATCTGCAATGTTAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  TTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGTGCATCTGCAATGTTAAT  914

Query  963  CATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGATTTTATGTATGTGTCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  CATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGATTTTATGTATGTGTCTC  988

Query 1037  AGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAGAAAAGGCAGGATTGACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  AGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAGAAAAGGCAGGATTGACC  1062

Query 1111  ATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCAAATTTTAAAGCCATGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  ATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCAAATTTTAAAGCCATGGA  1136

Query 1185  TTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCCTTTGGAGAAGTTTAATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  TTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCCTTTGGAGAAGTTTAATA  1210

Query 1259  ACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGGTCATGGCTGCTGCCAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  ACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGGTCATGGCTGCTGCCAAC  1284

Query 1333  AGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGGCAGGGCCATGCTATGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  AGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGGCAGGGCCATGCTATGAT  1358

Query 1407  AGTGGAAGCTTATCCAAAA  1425
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1359  AGTGGAAGCTTATCCAAAA  1377