Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10431
• Subject: XM_011532803.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1420
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGACTACTATCTTGACTTACCCCTTTAAAAATCTTCCCACTGCATCAAAATGGGCCCTCAGATTTTCCATAAG  74
            |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATG---ACTATCTTGACTTACCCCTTTAAAAATCTTCCCACTGCATCAAAATGGGCCCTCAGATTTTCCATAAG  71

Query   75  ACCTCTGAGCTGTTCCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAAACGAAGAAGACGTTAGCCAAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  ACCTCTGAGCTGTTCCTCCCAGCTACGAGCTGCCCCAGCTGTCCAGACCAAAACGAAGAAGACGTTAGCCAAAC  145

Query  149  CCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTGGCACTTCATATAAAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  CCAATATAAGGAATGTTGTGGTGGTGGATGGTGTTCGCACTCCATTTTTGCTGTCTGGCACTTCATATAAAGAC  219

Query  223  CTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGTGTCCCTAAGGAAGTAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  CTGATGCCACATGATTTGGCTAGAGCAGCGCTTACGGGTTTGTTGCATCGGACCAGTGTCCCTAAGGAAGTAGT  293

Query  297  TGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTTGGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TGATTATATCATCTTTGGTACAGTTATTCAGGAAGTGAAAACAAGCAATGTGGCTAGAGAGGCTGCCCTTGGAG  367

Query  371  CTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCAACCAAGCCATGACCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  CTGGCTTCTCTGACAAGACTCCTGCTCACACTGTCACCATGGCTTGTATCTCTGCCAACCAAGCCATGACCACA  441

Query  445  GGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAGTTGATGTCCGATGTCCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GGTGTTGGCTTGATTGCTTCTGGCCAGTGTGATGTGATCGTGGCAGGTGGTGTTGAGTTGATGTCCGATGTCCC  515

Query  519  TATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATCTATGGGCCAGCGACTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  TATTCGTCACTCAAGGAAAATGAGAAAACTGATGCTTGATCTCAATAAGGCCAAATCTATGGGCCAGCGACTGT  589

Query  593  CTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCATCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTGAGTTCTCCACCAGTGAG  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  CTTTAATCTCTAAATTCCGATTTAATTTCCTAGCACCTGAGCTCCCTGCGGTTTCTGAGTTCTCCACCAGTGAG  663

Query  667  ACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAACAGGATGAATATGCACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  ACCATGGGCCACTCTGCAGACCGACTGGCCGCTGCCTTTGCTGTTTCTCGGCTGGAACAGGATGAATATGCACT  737

Query  741  GCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGTACCCTTCAAAGTACCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GCGCTCTCACAGTCTAGCCAAGAAGGCACAGGATGAAGGACTCCTTTCTGATGTGGTACCCTTCAAAGTACCAG  811

Query  815  GAAAAGATACAGTCACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGGCCAAACTAAAACCTGCA  888
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  GAAAAGATACAGTTACCAAAGATAATGGCATCCGTCCTTCCTCACTGGAGCAGATGGCCAAACTAAAACCTGCA  885

Query  889  TTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGTGCATCTGCAATGTTAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  TTCATCAAGCCCTACGGCACAGTGACAGCTGCAAATTCTTCTTTCTTGACTGATGGTGCATCTGCAATGTTAAT  959

Query  963  CATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGATTTTATGTATGTGTCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CATGGCGGAGGAAAAGGCTCTGGCCATGGGTTATAAGCCGAAGGCATATTTGAGGGATTTTATGTATGTGTCTC  1033

Query 1037  AGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAGAAAAGGCAGGATTGACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AGGATCCAAAAGATCAACTATTACTTGGACCAACATATGCTACTCCAAAAGTTCTAGAAAAGGCAGGATTGACC  1107

Query 1111  ATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCAAATTTTAAAGCCATGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  ATGAATGATATTGATGCTTTTGAATTTCATGAAGCTTTCTCGGGTCAGATTTTGGCAAATTTTAAAGCCATGGA  1181

Query 1185  TTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCCTTTGGAGAAGTTTAATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TTCTGATTGGTTTGCAGAAAACTACATGGGTAGAAAAACCAAGGTTGGATTGCCTCCTTTGGAGAAGTTTAATA  1255

Query 1259  ACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGGTCATGGCTGCTGCCAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  ACTGGGGTGGATCTCTGTCCCTGGGACACCCATTTGGAGCCACTGGCTGCAGGTTGGTCATGGCTGCTGCCAAC  1329

Query 1333  AGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGGCAGGGCCATGCTATGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  AGATTACGGAAAGAAGGAGGCCAGTATGGCTTAGTGGCTGCGTGTGCAGCTGGAGGGCAGGGCCATGCTATGAT  1403

Query 1407  AGTGGAAGCTTATCCAAAA  1425
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1404  AGTGGAAGCTTATCCAAAA  1422