Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10476
• Subject: XM_006526288.2
• Aligned Length: 1351
• Identities: 1093
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ---ATGGAAGAGAGTGGAATAGAGACAACACCACCTGGGACTCCTCCACCAAATCCTGCAGGGCTGGCTGCTAC  71
               ||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||.|...||||||||||..|||||||  |
Sbjct    1  ATGATGGAAGAAAGTGGAATCGAGACCACGCCGCCTGGAACCCCTCCCCTGCATCCTGCAGGCTTGGCTGC--C  72

Query   72  -TGCTATGTCTTCTACCCCTGTTCCATTAGCGGCAACCAGTTCTTTTTCTTCTCCAAATGTATCCTCCATGGAG  144
             |||     |.||.||....|.||..|.|||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||....||||||
Sbjct   73  GTGC-----CCTCCACTGAAGCTCACTCAGCTGCAACCAGTTCCTTCTCGTCTCCCAACGTGTCGGGAATGGAG  141

Query  145  TC-CTTCCCACCACTCGCATACTCTACTCCTCAGCCGCCCCTTCCTCCTGTGAGGCCTTCAGCACCATTACCTT  217
            || ||.||| ||||.||..||.||.||.||||||||..||||.||.||||||..|||.||.||.|||...||.|
Sbjct  142  TCTCTGCCC-CCACACGTGTATTCCACGCCTCAGCCCTCCCTGCCCCCTGTGCAGCCGTCCGCGCCACCTCCCT  214

Query  218  TTGTGCCTC-----CTCCTGCAGTTCCTTCTG-TCCCACCACT---TGTTACTTCTATGCC-ACCTCCTGTTTC  281
            |||||  ||     ||||.||   ||||||.| ||||    ||   ||..||||||.|||| .||||| ||.||
Sbjct  215  TTGTG--TCGATGTCTCCGGC---TCCTTCCGTTCCC----CTGAGTGGCACTTCTGTGCCGCCCTCC-GTGTC  278

Query  282  TCCATCAACTGCTGCTGCCTTCGGTAATCCTCCTGTATCTCACTTCCCACCTTCAACTTCTGCCCCAAACACTC  355
            ||||||..||||..||||||||.|....|||||..|.||.||||||||.|||.|.||.||||||.|.....|||
Sbjct  279  TCCATCGCCTGCCACTGCCTTCAGCGGCCCTCCGATGTCCCACTTCCCGCCTGCGACCTCTGCCTCGGGTGCTC  352

Query  356  TTTTACCTGCACCCCCTTCGGGTCCTCCTATATCAGGATTTTCTGTTGGTTCAACTTATGACATTACAAGGGGA  429
            |..|..|||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  353  TCCTGTCTGCACCGCCTTCAGGGCCTCCGATATCAGGGTTTTCTGTCGGTACAACCTACGACATCACGAGGGGA  426

Query  430  CATGCTGGGAGAGCTCCCCAGACACCCCTGATGCCATCATTTTCTGCACCTTCAGGAACAGGTCTTTTGCCAAC  503
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|..||||||.|.||||||.|
Sbjct  427  CATGCTGGGAGGGCGCCCCAGACACCTCTGATGCCGTCATTTTCTGCACCTCCGGTTACAGGTATCTTGCCAGC  500

Query  504  TCCTATTACTCAGCAAGCCAGTTTGACATCTCTGGCACAGGGAACTGGAACCACATCAGCCATTACTTTCCCAG  577
            .||.|||||||||||||||||..||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  501  CCCCATTACTCAGCAAGCCAGCATGACGTCTCTGGCCCAGGGACCTGGAACCACATCAGCCATTACTTTCCCGG  574

Query  578  AGGAGCAAGAAGACCCTAGAATTACTAGAGGTCAGGATGAAGCATCTGCTGGTGGAATCTGGGGTTTTATTAAG  651
            ||||.||.|||||.||.|||||||..|||||.||||||||.||..|||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  575  AGGAACAGGAAGATCCCAGAATTAACAGAGGCCAGGATGATGCCCCTGCTGGCGGGATCTGGGGTTTTATTAAG  648

Query  652  GGTGTGGCTGGGAATCCTATGGTGAAGTCTGTGCTTGATAAGACAAAACATTCAGTAGAAAGCATGATTACAAC  725
            ||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  649  GGCGTAGCTGGGAACCCTATGGTGAAATCTGTCCTGGATAAGACCAAGCATTCTGTAGAAAGCATGATCACCAC  722

Query  726  GCTGGACCCTGGCATGGCTCCCTATATCAAATCTGGAGGTGAACTGGATATTGTAGTGACCTCAAATAAAGAAG  799
            ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  723  GCTGGATCCTGGCATGGCTCCATATATCAAATCTGGAGGTGAACTGGATATTGTCGTAACCTCAAATAAAGAAG  796

Query  800  TAAAAGTTGCTGCTGTCCGAGATGCCTTCCAGGAGGTCTTTGGCTTAGCTGTGGTTGTAGGGGAAGCTGGACAG  873
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  797  TGAAAGTGGCTGCTGTCCGAGATGCCTTCCAGGAGGTCTTTGGCTTAGCTGTGGTTGTTGGGGAAGCTGGACAG  870

Query  874  TCCAATATTGCCCCACAACCAGTGGGCTATGCAGCTGGATTAAAAGGTGCTCAGGAACGGATAGATAGCTTG--  945
            ||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||.||  
Sbjct  871  TCCAATATCGCCCCTCAGCCAGTCGGGTATGCAGCTGGATTGAAGGGCGCCCAGGAACGCATCGACAGCCTGAG  944

Query  946  --CGTCGAACTGGGGTGATCCATGAAAAACAGACAGCTGTGTCAGTAGAAAACTTCATTGCAGAATTGCTGCCT  1017
              .||||    ||.|.||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct  945  GAGGTCG----GGAGCGATCCACGAGAAACAGACGGCGGTGTCGGTAGAAAACTTCATTGCTGAGCTGCTGCCT  1014

Query 1018  GACAAATGGTTTGACATTGGTTGTTTGGTGGTTGAAGATCCTGTCCATGGCATTCATCTAGAAACATTTACACA  1091
            |||||.|||||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||||||||.|..||.|||.|.|||||.||
Sbjct 1015  GACAAGTGGTTTGACATCGGCTGCCTGGTGGTTGAAGACCCTGTGCATGGCATCCGCCTGGAAGCCTTTACCCA  1088

Query 1092  AGCCACACCAGTGCCTTTGGAATTTGTACAGCAGGCTCAAAGTCTAACTCCCCAGGACTATAATCTGAGGTGGT  1165
            ||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1089  AGCCACGCCCGTGCCTTTGGAGTTTGTGCAGCAGGCGCAAAGCCTGACTCCCCAGGACTACAATCTGAGGTGGT  1162

Query 1166  CAGGCCTTTTGGTGACAGTGGGTGAAGTCCTGGAAAAGAGTTTACTGAATGTCAGCCGGACTGATTGGCACATG  1239
            ||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1163  CAGGCCTTCTGGTGACAGTGGGGGAAGTCCTGGAAAAGAGCTTGCTCAATGTCAGCCGGACTGATTGGCACCTG  1236

Query 1240  GCATTTACTGGGATGTCCCGTCGGCAGATGATCTACAGTGCAGCCAGAGCGATAGCAGGCATGTATAAACAGCG  1313
            ||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||..||..|.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1237  GCTTTCACTGGCATGTCTCGCCGACAGATGATCTACAGTGCAGCCAAGGCCGTGGCGGGCATGTATAAGCAGCG  1310

Query 1314  CCTGCCACCCAGGACAGTG  1332
            .||||||||||||.|..||
Sbjct 1311  GCTGCCACCCAGGCCCATG  1329