Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10479
- Subject:
- XM_005254166.2
- Aligned Length:
- 1131
- Identities:
- 1088
- Gaps:
- 36
Alignment
Query 1 ----------------------ATGCATCT--------------AAGGCGAGTTAGAACCATGCCCCGACACAG 38
.|.|.||| |||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCCAACGGAGCACTGTATTTCCTTCTCGTGTCACCAAGGAAAGGCGAGTGAGAACCATGCCCCGACACAG 74
Query 39 CCAGTCCCTGACAATGGCACCATACTCATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATG 112
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGTCCCTGACCATGGCACCATACTCATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATG 148
Query 113 AGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATG 186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATG 222
Query 187 CAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGT 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGT 296
Query 261 GAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGAGCAGATTCGTGCTCGGGACAACATTAGCTATGGAACTA 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGAGCAGATTCGTGCCCGGGACAACATTAGCTATGGAACTA 370
Query 335 ATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGT 408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGT 444
Query 409 GATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACA 482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACA 518
Query 483 GCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAG 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAG 592
Query 557 TGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTT 630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTT 666
Query 631 TTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACA 704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACA 740
Query 705 GGAACAAGAACGGATAGAAAAAGAGCTTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTG 778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAACAAGAACGGATAGAAAAAGAGCTTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTG 814
Query 779 GAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAA 852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAA 888
Query 853 AAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTT 926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTT 962
Query 927 ACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAG 1036
Query 1001 GATCCATCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATG 1074
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATCCCTCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATG 1110
Query 1075 CAGAAGCCAGAGACCCCCATG 1095
|||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGAAGCCAGAGACCCCCATG 1131