Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10479
• Subject: XM_011521248.2
• Aligned Length: 1131
• Identities: 1088
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ----------------------ATGCATCT--------------AAGGCGAGTTAGAACCATGCCCCGACACAG  38
                                  .|.|.|||              |||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCAACGGAGCACTGTATTTCCTTCTCGTGTCACCAAGGAAAGGCGAGTGAGAACCATGCCCCGACACAG  74

Query   39  CCAGTCCCTGACAATGGCACCATACTCATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATG  112
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGTCCCTGACCATGGCACCATACTCATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATG  148

Query  113  AGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATG  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATG  222

Query  187  CAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGT  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGT  296

Query  261  GAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGAGCAGATTCGTGCTCGGGACAACATTAGCTATGGAACTA  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGAGCAGATTCGTGCCCGGGACAACATTAGCTATGGAACTA  370

Query  335  ATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGT  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGT  444

Query  409  GATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACA  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACA  518

Query  483  GCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAG  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAG  592

Query  557  TGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTT  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTT  666

Query  631  TTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACA  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACA  740

Query  705  GGAACAAGAACGGATAGAAAAAGAGCTTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTG  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAACAAGAACGGATAGAAAAAGAGCTTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTG  814

Query  779  GAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAA  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAA  888

Query  853  AAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTT  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTT  962

Query  927  ACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAG  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAG  1036

Query 1001  GATCCATCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATG  1074
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATCCCTCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATG  1110

Query 1075  CAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1095
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1131