Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10479
• Subject: XM_011521249.2
• Aligned Length: 1104
• Identities: 1091
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ---------ATGCATCTAAGGCGAGTTAGAACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACAATGGCACCATACTC  65
                     |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAATATGCATCTAAGGCGAGTGAGAACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACCATGGCACCATACTC  74

Query   66  ATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATGAGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGC  139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATGAGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGC  148

Query  140  ACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATGCAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTG  213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATGCAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTG  222

Query  214  GCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGTGAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGT  287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGTGAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGT  296

Query  288  ACTCCAGGAGCAGATTCGTGCTCGGGACAACATTAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGC  361
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTCCAGGAGCAGATTCGTGCCCGGGACAACATTAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGC  370

Query  362  GCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGTGATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCA  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGTGATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCA  444

Query  436  GAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACAGCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAAC  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACAGCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAAC  518

Query  510  GAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAGTGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCA  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAGTGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCA  592

Query  584  CCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTTTTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTT  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTTTTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTT  666

Query  658  GAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACAGGAACAAGAACGGATAGAAAAAGAGCT  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACAGGAACAAGAACGGATAGAAAAAGAGCT  740

Query  732  TTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGA  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGA  814

Query  806  AGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAAAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACA  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAAAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACA  888

Query  880  AGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTTACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAAT  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTTACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAAT  962

Query  954  GAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAGGATCCATCAGGCAAGTTCTCGAGGCCA  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAGGATCCCTCAGGCAAGTTCTCGAGGCCA  1036

Query 1028  AGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATGCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATGCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1104