Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10499
• Subject: NM_000314.8
• Aligned Length: 1209
• Identities: 1090
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATATCAAGAGGATGGATTCGACTTAGACTT  74

Query    1  ----------------------------ATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATA  46
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACCTATATTTATCCAAACATTATTGCTATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATA  148

Query   47  TTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATACACAATCTTTGTGCTGAAAGA  120
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATATACAATCTTTGTGCTGAAAGA  222

Query  121  CATTATGACACCGCCAAATCTAATTACAGAGTTGCGCAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGA  194
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATTATGACACCGCCAAATTTAATTGCAGAGTTGCACAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGA  296

Query  195  ACTTATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACT  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTTATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACT  370

Query  269  GTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTATAATGATTTATGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCA  342
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTGTAATGATATGTGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCA  444

Query  343  CAAGAGGCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCG  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGAGGCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCG  518

Query  417  CTATGTGTATTACTATAGCTACCTGGTAAAGAATCATGTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGA  490
            ||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTATGTGTATTATTATAGCTACCTGTTAAAGAATCATCTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGA  592

Query  491  TGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTG  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTG  666

Query  565  AAGATGTATTCCTCCAATTCAGGACCCACACGATGGGAGGACAAGTTCATGTATTTTGAGTTCCCTCAGCCGTT  638
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGATATATTCCTCCAATTCAGGACCCACACGACGGGAAGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAGCCGTT  740

Query  639  ACCTGTGTGTGGTGGTATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAAGGACAAAATGTTTC  712
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCTGTGTGTGGTGATATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAAGGACAAAATGTTTC  814

Query  713  ACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGT  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGT  888

Query  787  GATCAAGAAATTGATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAGTATCTAGTACTTACTTTAAC  860
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATCAAGAAATCGATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAATATCTAGTACTTACTTTAAC  962

Query  861  AAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAAGACAAAGCCAACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGT  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAAGACAAAGCCAACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGT  1036

Query  935  ACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCGTCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCGTCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGT  1110

Query 1009  GACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGA  1184

Query 1083  TCAGCATACACAAATTACAAAAGTC  1107
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCAGCATACACAAATTACAAAAGTC  1209