Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10499
- Subject:
- NM_008960.2
- Aligned Length:
- 1209
- Identities:
- 1052
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATATCAAGAGGATGGATTCGACTTAGACTT 74
Query 1 ----------------------------ATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATA 46
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 75 GACCTATATTTATCCAAATATTATTGCTATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGTGTATACAGGAACAATA 148
Query 47 TTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATACACAATCTTTGTGCTGAAAGA 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 TTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATATACAATCTATGTGCTGAGAGA 222
Query 121 CATTATGACACCGCCAAATCTAATTACAGAGTTGCGCAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGA 194
|||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATTATGACACCGCCAAATTTAACTGCAGAGTTGCACAGTATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGA 296
Query 195 ACTTATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACT 268
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACTTATCAAACCCTTCTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACT 370
Query 269 GTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTATAATGATTTATGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCA 342
|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTAAAGCTGGAAAGGGACGGACTGGTGTAATGATTTGTGCATATTTATTGCATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCA 444
Query 343 CAAGAGGCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCG 416
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGAGGCCCTAGATTTTTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTCACAATTCCCAGTCAGAGGCG 518
Query 417 CTATGTGTATTACTATAGCTACCTGGTAAAGAATCATGTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGA 490
||||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||..|||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 519 CTATGTATATTATTATAGCTACCTGCTAAAAAATCACCTGGATTACAGACCCGTGGCACTGCTGTTTCACAAGA 592
Query 491 TGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTG 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTG 666
Query 565 AAGATGTATTCCTCCAATTCAGGACCCACACGATGGGAGGACAAGTTCATGTATTTTGAGTTCCCTCAGCCGTT 638
|||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 667 AAGATATATTCCTCCAATTCAGGACCCACGCGGCGGGAGGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAGCCATT 740
Query 639 ACCTGTGTGTGGTGGTATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAAGGACAAAATGTTTC 712
.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCTGTGTGTGGTGATATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTCAAAAAGGACAAAATGTTTC 814
Query 713 ACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGT 786
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 815 ACTTTTGGGTAAATACGTTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTGGAAAATGGAAGTCTTTGT 888
Query 787 GATCAAGAAATTGATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAGTATCTAGTACTTACTTTAAC 860
|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..||||
Sbjct 889 GATCAGGAAATCGATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAGTATCTTGTACTCACCCTAAC 962
Query 861 AAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAAGACAAAGCCAACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGT 934
||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 963 AAAAAACGATCTTGACAAAGCAAACAAAGACAAGGCCAACCGATACTTCTCTCCAAATTTTAAGGTGAAACTAT 1036
Query 935 ACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCGTCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGT 1008
||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1037 ACTTTACAAAAACAGTAGAGGAGCCATCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTGACTCCAGATGTTAGT 1110
Query 1009 GACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGA 1082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGA 1184
Query 1083 TCAGCATACACAAATTACAAAAGTC 1107
|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1185 TCAGCATTCACAAATTACAAAAGTC 1209