Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10499
• Subject: XM_006526769.2
• Aligned Length: 1107
• Identities: 767
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATATTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAAGCATAAAAACCATTACAAGATACACAATCTTTGTGCTGAAAGACATTATGACACCGCCAAATCTAATTACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAGTTGCGCAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGAACTTATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACTGTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTAT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AATGATTTATGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCACAAGAGGCCCTAGATTTCTATGGGGAAG  370
             |||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct    1  -ATGATTTGTGCATATTTATTGCATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCACAAGAGGCCCTAGATTTTTATGGGGAAG  73

Query  371  TAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCGCTATGTGTATTACTATAGCTACCTGGTA  444
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||
Sbjct   74  TAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTCACAATTCCCAGTCAGAGGCGCTATGTATATTATTATAGCTACCTGCTA  147

Query  445  AAGAATCATGTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGATGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAG  518
            ||.|||||..|||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  AAAAATCACCTGGATTACAGACCCGTGGCACTGCTGTTTCACAAGATGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAG  221

Query  519  TGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTGAAGATGTATTCCTCCAATTCAGGACCCA  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  TGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTGAAGATATATTCCTCCAATTCAGGACCCA  295

Query  593  CACGATGGGAGGACAAGTTCATGTATTTTGAGTTCCCTCAGCCGTTACCTGTGTGTGGTGGTATCAAAGTAGAG  666
            |.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  296  CGCGGCGGGAGGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAGCCATTGCCTGTGTGTGGTGATATCAAAGTAGAG  369

Query  667  TTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAAGGACAAAATGTTTCACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACC  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  370  TTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTCAAAAAGGACAAAATGTTTCACTTTTGGGTAAATACGTTCTTCATACC  443

Query  741  AGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGTGATCAAGAAATTGATAGCATTTGCAGTA  814
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  444  AGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTGGAAAATGGAAGTCTTTGTGATCAGGAAATCGATAGCATTTGCAGTA  517

Query  815  TAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAGTATCTAGTACTTACTTTAACAAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  518  TAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAGTATCTTGTACTCACCCTAACAAAAAACGATCTTGACAAAGCAAACAAA  591

Query  889  GACAAAGCCAACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGTACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCGTC  962
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  592  GACAAGGCCAACCGATACTTCTCTCCAAATTTTAAGGTGAAACTATACTTTACAAAAACAGTAGAGGAGCCATC  665

Query  963  AAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGTGACAATGAACCTGATCATTATAGATATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  AAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTGACTCCAGATGTTAGTGACAATGAACCTGATCATTATAGATATT  739

Query 1037  CTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGATCAGCATACACAAATTACAAAAGTC  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  740  CTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGATCAGCATTCACAAATTACAAAAGTC  810