Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10588
• Subject: NR_002319.2
• Aligned Length: 3776
• Identities: 2583
• Gaps: 1190

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGCCGGGTTGGGCGATTAACAGGCGGTGGCTAGGGAGGACGGAGAGGGGGCGTTTGCTCCTCTGGGACTTTTCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGCCTCGTTTTTTTTTTCAGATGTGGCTTGGTCTGGACGCAAGGTCCCAGCAGCCAGCTTAAGCTTACTCTTCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GTGAAAGGGGAAAGTATCCCCTGTGGAAAGCAGTTAAACTTGTGGAGGGGGTGCGAGACGTGAGTTCTCCCCCA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGCCAGGCGAATGGTGTGGACTTGAGCTGGTCCAGCAGCCGGCTCGACTTGTCTGAGGGAGCCCTGGAGGGGGC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GGGGAGGGGGCCCACAGAACGTGGGTTCTATAAAGAGACATTGGGAAGATTCGATTCCGAGAAGAGGAAGAGCC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  GGATTGAAAGAGAGCCAGGCCCTTGAGGGGGAGGGGGCTGCCAAGATGGCGTCGGCCTCCTCCGGGCCGTTGTC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  TTCGGTCGGTTTTTCTCCGTTGATCCCGCGGTCCCTTCCTGTACCTCGTCCTCAGCATCTGGAATCAAGAGTCC  518

Query    1  -ATGGCATCTGAGGTGCCTTATGCCTCTGGCATGCCCATCAAGAAAATAGGCCATAGAAGTGTTGATTCCTCAG  73
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATGGCATCTGAGGTGCCTTATGCCTCTGGCATGCCCATCAAGAAAATAGGCCATAGAAGTGTTGATTCCTCAG  592

Query   74  GAGGGACAACCTCATCAGCCTTGAAAGGTGCCATCCAGTTAGGCATTACCCACACTGTGGGGAGCCTGAGTACC  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGGGACAACCTCATCAGCCTTGAAAGGTGCCATCCAGTTAGGCATTACCCACACTGTGGGGAGCCTGAGTACC  666

Query  148  AAACCAGAGAGTGATGTCCTCATGCAAGATTTCCACATGGTGGAGAGTATCTTCTTTCCCAGTGAAGGGAGCAA  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAACCAGAGAGTGATGTCCTCATGCAAGATTTCCACATGGTGGAGAGTATCTTCTTTCCCAGTGAAGGGAGCAA  740

Query  222  CCTGACCCCTGCTCATCACTACAATGCCTTTCGTTTCAAGACCTATGCACCTGTTGCCTTCCGCTACTTCTGGG  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGACCCCTGCTCATCACTACAATGCCTTTCGTTTCAAGACCTATGCACCTGTTGCCTTCCGCTACTTCTGGG  814

Query  296  AGCTATTTGGTATCCGGCCCGATGATTACTTGTATTCCCTCTGCAGTGAGCCGCTGATTGAACTCTGTAGCTCT  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCTATTTGGTATCCGGCCCGATGATTACTTGTATTCCCTCTGCAGTGAGCCGCTGATTGAACTCTGTAGCTCT  888

Query  370  GGAGCTAGTGGTTCCCTGTTCTATGTGTCCAGCGACGATGAGTTCATTGTTAAGACAGTCCGACATAAAGAAGC  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAGCTAGTGGTTCCCTGTTCTATGTGTCCAGCGACGATGAGTTCATTGTTAAGACAGTCCGACATAAAGAAGC  962

Query  444  GGAGTTTCTGCAGAAGCTGCTTCCAGGATACTACATAAACCTCAACCAGAACCCTCGGACTTTGCTGCCTAAAT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGTTTCTGCAGAAGCTGCTTCCAGGATACTACATAAACCTCAACCAGAACCCTCGGACTTTGCTGCCTAAAT  1036

Query  518  TCTATGGACTGTACTGTGTGCAGACAGGTGGCAAGAACATTCGGATTGTGGTGATGAACAATCTTTTACCAAGA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTATGGACTGTACTGTGTGCAGACAGGTGGCAAGAACATTCGGATTGTGGTGATGAACAATCTTTTACCAAGA  1110

Query  592  TCGGTAAAAATGCATATCAAATATGACCTCAAAGGCTCAACCTACAGGCGGCGGGCTTCCCAGAAAGAGCGAGA  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCGGTAAAAATGCATATCAAATATGACCTCAAAGGCTCAACCTACAGGCGGCGGGCTTCCCAGAAAGAGCGAGA  1184

Query  666  GAAGCCTCTTCCCACATTTAAAGACCTAGACTTCTTACAAGACATCCCTGATGGTCTTTTTTTGGATGCTGACG  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCCTCTTCCCACATTTAAAGACCTAGACTTCTTACAAGACATCCCTGATGGTCTTTTTTTGGATGCTGACG  1258

Query  740  TGCACAACGCTCTCTGTAAGACCCTGCAGCGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGATTATAGC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCACAACGCTCTCTGTAAGACCCTGCAGCGTGACTGTTTGGTGCTGCAGAGCTTCAAGATAATGGATTATAGC  1332

Query  814  CTCTTGATGTCAATCCATAATATAGATCATGCACAACGAGAGCCCTTAAGCAGCGAAACACAATACTCAGTTGA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCTTGATGTCAATCCATAATATAGATCATGCACAACGAGAGCCCTTAAGCAGCGAAACACAATACTCAGTTGA  1406

Query  888  TACTCGAAGACCAGCCCCCCAAAAGGCTCTGTATTCCACAGCCATGGAATCCATCCAGGGAGAGGCTCGACGGG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TACTCGAAGACCAGCCCCCCAAAAGGCTCTGTATTCCACAGCCATGGAATCCATCCAGGGAGAGGCTCGACGGG  1480

Query  962  GTGGCACCATGGAGACCGATGACCATATGGGTGGCATCCCTGCCCGGAATAGTAAAGGGGAAAGGCTTCTGCTT  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGGCACCATGGAGACCGATGACCATATGGGTGGCATCCCTGCCCGGAATAGTAAAGGGGAAAGGCTTCTGCTT  1554

Query 1036  TATATTGGCATCATTGACATTCTACAGTCTTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCCCTGAT  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATATTGGCATCATTGACATTCTACAGTCTTACAGGTTTGTTAAGAAGTTGGAGCACTCTTGGAAAGCCCTGAT  1628

Query 1110  ACATGACGGAGACACTGTCTCAGTGCATCGCCCAGGCTTCTATGCTGAATGGTTCCAGCGCTTCATGTGCAACA  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACATGACGGAGACACTGTCTCAGTGCATCGCCCAGGCTTCTATGCTGAATGGTTCCAGCGCTTCATGTGCAACA  1702

Query 1184  CGGTATTTAAGAAGATTCCCTTGAAGCCTTCTCCTTCCAAAAAACTTCGGTCTGGCTCATCTTTCTCTCAGCGA  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CGGTATTTAAGAAGATTCCCTTGAAGCCTTCTCCTTCCAAAAAACTTCGGTCTGGCTCATCTTTCTCTCAGCGA  1776

Query 1258  GCAGGCTCCAGTGGCAACTCCTGCATTACTTACAAGCCATTGGTCTCTGGGGAACACAAGGCACAAGTGACAAC  1331
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCAGGCTCCAGTGGCAACTCCTGCATTACTTACCAGCCATTGGTCTCTGGGGAACACAAGGCACAAGTGACAAC  1850

Query 1332  AAAGGCGGAAGTGGAGCCAGGTGTTCACCTTGGTTGTCCTGATGTTTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAA  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAAGGCGGAAGTGGAGCCAGGTGTTCACCTTGGTTGTCCTGATGTTTTACCTCAGACTCCACCTTTGGAGGAAA  1924

Query 1406  TCAGTGAGGGCTCACCTACTCCTGACCCCAGTTTCTCACCTCTAGTTGAAGAGACTTTGCAAATGCTAACTACA  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCAGTGAGGGCTCACCTACTCCTGACCCCAGTTTCTCACCTCTAGTTGAAGAGACTTTGCAAATGCTAACTACA  1998

Query 1480  AGCGTGGACAACAGTGAGTATATGGGGAATGGAGACTTCTTACCCACCCGGCTGCAGGCCCAGCAGGATGCTGT  1553
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGTGTGGACAACAGTGAGTATATGGGGAATGGAGACTTCTTACCCACCCGGCTGCAGGCCCAGCAGGATGCTGT  2072

Query 1554  CAACACAGTTTGTCATTCAAAGACCCGCAGCAACCCTGAGAACAACGTGGGCCTTATCACACTGGATAATGACT  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAACACAGTTTGTCATTCAAAGACCCGCAGCAACCCTGAGAACAACGTGGGCCTTATCACACTGGATAATGACT  2146

Query 1628  GTGAAGTGCTGACCACACTCACCCCAGACACTGGCCGTATCCTGTCCAAGCTACATACTGTCCAACCCAAGGGC  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTGAAGTGCTGACCACACTCACCCCAGACACTGGCCGTATCCTGTCCAAGCTACATACTGTCCAACCCAAGGGC  2220

Query 1702  AAGATCACCTTCTGCATGGGCATCCACGTGGCCCATCTGGCTCTGAAGCACCGACAAGGCAACAATCACAAGAT  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AAGATCACCTTCTGCATGGGCATCCACGTGGCCCATCTGGCTCTGAAGCACCGACAAGGCAACAATCACAAGAT  2294

Query 1776  CCGCATCATTGCCTTTGTGGGAAACCCGGTGGAGGACAATGAGAAGAATCTGGTGAAACTGGCTAAATGCCTCA  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCGCATCATTGCCTTTGTGGGAAACCCGGTGGAGGACAATGAGAAGAATCTGGTGAAACTGGCTAAATGCCTCA  2368

Query 1850  AGAAGGAGAAAGTAAATGTTGACATTATCAATTTTGGGGAAGAGGAGGTGAACACAGAAAAGCTGACAGCCTTT  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGAAGGAGAAAGTAAATGTTGACATTATCAATTTTGGGGAAGAGGAGGTGAACACAGAAAAGCTGACAGCCTTT  2442

Query 1924  GTAAACACGTTGAATGGCAAAGATGGAACCGGTTCTCATCTGGTGACAGTGCCTCCTGGGCCCAGTTTGGCTGA  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTAAACACGTTGAATGGCAAAGATGGAACCGGTTCTCATCTGGTGACAGTGCCTCCTGGGCCCAGTTTGGCTGA  2516

Query 1998  TGCTCTCATCAGTTTTCCGATTTTGGCTGGTGAAGGTGGTGCCATGATGGGTCTTGGTGCCAGTGACTTTGAAT  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGCTCTCATCAGTTTTCCGATTTTGGCTGGTGAAGGTGGTGCCATGATGGGTCTTGGTGCCAGTGACTTTGAAT  2590

Query 2072  TTGGAGTAGATCCCAGTGCTGATCCTGAGCTGGCCTTGGTCCTTCGTGTATTTATGGAAGAGCAGCGGCAGCGG  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TTGGAGTAGATCCCAGTGCTGATCCTGAGCTGGCCTTGGTCCTTCGTGTATTTATGGAAGAGCAGCGGCAGCGG  2664

Query 2146  CAGGAGGAGGAGGCCCGGCAGGCAGCTGCAGCTTCTGCTGCTGAGGCCGGGATTGCTACGACTGGGACTGAAGA  2219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAGGAGGAGGAGGCCCGGCAGGCAGCTGCAGCTTCTGCTGCTGAGGCCGGGATTGCTACGACTGGGACTGAAGA  2738

Query 2220  CTCAGACGATGCCCTGCTGAAGATGACCATCAGCCAGCAAGAGTTTGGCCACACTGGGCTTCCTGACCTAAGCA  2293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CTCAGACGATGCCCTGCTGAAGATGACCATCAGCCAGCAAGAGTTTGGCCACACTGGGCTTCCTGACCTAAGCA  2812

Query 2294  GTATGACTGAGGAAGAGAAGATTGTTTGTGCCATGCAGATGTCCCTGCAGGGAGCAGAGTTTGGCCTGGCAGAA  2367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GTATGACTGAGGAAGAGAAGATTGTTTGTGCCATGCAGATGTCCCTGCAGGGAGCAGAGTTTGGCCTGGCAGAA  2886

Query 2368  TCAGCAGACATTGATGCCAGCTCAGCCATGGACACATCTGAGCCAGCCAAGGAGGAGGATGATTACGACGTGAT  2441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TCAGCAGACATTGATGCCAGCTCAGCCATGGACACATCTGAGCCAGCCAAGGAGGAGGATGATTACGACGTGAT  2960

Query 2442  GCAAGACCCTGAGTTCCTTCAGAGTGTCCTAGAGAACCTCCCAGGTGTGGATCCCAACAATGAAGCCATTCGAA  2515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  GCAAGACCCTGAGTTCCTTCAGAGTGTCCTAGAGAACCTCCCAGGTGTGGATCCCAACAATGAAGCCATTCGAA  3034

Query 2516  ATGCTGTGGGCTCCCTGGCCTCCCAGGCCACCAAGGACAGCAAGAAGGACAAGAAGGAGGAAGACGAGAAG---  2586
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||   
Sbjct 3035  ATGCTGTGGGCTCCCTGGCCTCCCAGGCCACCAAGGACAGCAAGAAGGACAAGAAGGAGGAAGACAAGAAGTGA  3108

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3109  GACTGGAGGGAAAGGGTAGCTGAGCCTGCTCAGGGGACTGCATGGGAAGCACGGAATATAGGGTTAGATGTGTG  3182

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3183  TTATCTGTAATCATTATAGCCTAAATAAAGCTTGGCAAGATTTTTTCCTTCTTTGCTTCAAAAAAAAAAGAAAG  3256

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3257  AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAA  3330

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3331  ATCCTGATGCCTAAATCTGACCCCTTGAAATGCTGATGAGCTTCATCTGAGCTGTGTGATCTCTCATGTGCAGC  3404

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3405  TAAGGTTGAGAACCACTAACATAAAATAATTCACATTAAAATCACCAGGAAGCTTTAATAACATTTCAAATACT  3478

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3479  TGGACCCAACCCCTAAAGATTCTAATTTAATTGGCCTGGGACTCAGGTACTGATATTTTTCAAAAGCTCACAAG  3552

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3553  GTAATTCTGAAATTCAGCAAAAGTTGAGAACCACTATTCAGACTAAGTGACTTGTCCAATGTCTCTGGGTGCAT  3626

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3627  CAGACTTTACGGCCTTCCTTACACAGGGGTTGTGAATGAAATATGGCTATGGAAAGCAATTGTTGAGTAATATG  3700

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3701  TTATAAAGTATGGTGGTGATGATGATGATGACAATGATGACAATATTTCTTGAGTGCGTCCTATGCACCAGGCA  3774

Query 2587  --  2586
              
Sbjct 3775  CT  3776