Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10736
- Subject:
- XM_006713490.2
- Aligned Length:
- 1536
- Identities:
- 1160
- Gaps:
- 375
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGGACAGCTCTCACAGAAAGAGACGCTGGTCACCCTGTTTGACAATCGGACGTGGGTCCGCCAGGGCCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGTGGAGGAGCTAGAACCACCCAGCACCTCACAGGCCTGGAACCCACCACGTGCCAACGTCTTCCTCACCCTGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCATCTTCATTCTCATGAAGTTCTGGATGTCTGCACTGGCCACCACCATCCCAGTTCCCTGTGGGGCCTTCATG 222
Query 1 ------------------------------------------------ATGGCTGCCTGGTTCCCAGATGGAAT 26
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTGTCTTTGTCATTGGAGCAGCATTTGGGCGTCTGGTGGGTGAAAGCATGGCTGCCTGGTTCCCAGATGGAAT 296
Query 27 TCATACGGACAGCAGCACCTACCGGATTGTGCCTGGGGGCTACGCTGTGGTCGGGGCAGCTGCGCTGGCAGGAG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCATACGGACAGCAGCACCTACCGGATTGTGCCTGGGGGCTACGCTGTGGTCGGGGCAGCTGCGCTGGCAGGAG 370
Query 101 CGGTGACACACACAGTGTCCACGGCTGTGATCGTGTTCGAGCTCACAGGCCAGATTGCCCACATCCTGCCTGTC 174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGGTGACACACACAGTGTCCACGGCTGTGATCGTGTTCGAGCTCACAGGCCAGATTGCCCACATCCTGCCTGTC 444
Query 175 ATGATCGTCGTCATCCTGGCCAACGCTGTCGCCCAGAGTCTGCAGCCCTCCCTCTATGACAGCATCATCCGAAT 248
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGATCGCCGTCATCCTGGCCAACGCTGTCGCCCAGAGTCTGCAGCCCTCCCTCTATGACAGCATCATCCGAAT 518
Query 249 CAAGAAACTGCCCTACCTGCCTGAGCTCGGCTGGGGCCGCCACCAGCAGTACCGGGTGCGTGTGGAGGACATCA 322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAGAAACTGCCCTACCTGCCTGAGCTCGGCTGGGGCCGCCACCAGCAGTACCGGGTGCGTGTGGAGGACATCA 592
Query 323 TGGTGCGGGATGTTCCCCATGTGGCCCTCAGCTGCACCTTCCGGGACCTGCGTTTGGCACTGCACAGGACCAAG 396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGTGCGGGATGTTCCCCATGTGGCCCTCAGCTGCACCTTCCGGGACCTGCGTTTGGCACTGCACAGGACCAAG 666
Query 397 GGCCGAATGCTGGCCCTAGTGGAGTCCCCTGAGTCCATGATTCTGCTGGGCTCCATCGAGCGTTCACAGGTGGT 470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCCGAATGCTGGCCCTAGTGGAGTCCCCTGAGTCCATGATTCTGCTGGGCTCCATCGAGCGTTCACAGGTGGT 740
Query 471 GGCATTGTTGGGGGCCCAGCTGAGCCCAGCCCGCCGGCGGCAGCACATGCAGGAGCGCAGAGCCACCCAGACCT 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCATTGTTGGGGGCCCAGCTGAGCCCAGCCCGCCGGCGGCAGCACATGCAGGAGCGCAGAGCCACCCAGACCT 814
Query 545 CTCCACTATCTGATCAGGAGGGTCCCCCTACCCCTGAGGCTTCTGTCTGCTTCCAGGTGAACACAGAAGACTCA 618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCCACTATCTGATCAGGAGGGTCCCCCTACCCCTGAGGCTTCTGTCTGCTTCCAGGTGAACACAGAAGACTCA 888
Query 619 GCCTTCCCAGCAGCCCGGGGGGAGACCCACAAGCCCCTAAAGCCTGCACTCAAGAGGGGGCCCAGTGTCACCAG 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCTTCCCAGCAGCCCGGGGGGAGACCCACAAGCCCCTAAAGCCTGCACTCAAGAGGGGGCCCAGTGTCACCAG 962
Query 693 GAACCTCGGAGAGAGTCCCACAGGGAGCGCAGAGTCGGCAGGCATCGCCCTCCGGAGCCTCTTCTGTGGCAGTC 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAACCTCGGAGAGAGTCCCACAGGGAGCGCAGAGTCGGCAGGCATCGCCCTCCGGAGCCTCTTCTGTGGCAGTC 1036
Query 767 CACCCCCTGAGGCTGCTTCGGAGAAGTTGGAATCCTGTGAGAAGCGCAAGCTGAAGCGTGTCCGAATCTCCCTG 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CACCCCCTGAGGCTGCTTCGGAGAAGTTGGAATCCTGTGAGAAGCGCAAGCTGAAGCGTGTCCGAATCTCCCTG 1110
Query 841 GCAAGTGACGCGGACCTGGAAGGCGAGATGAGCCCTGAAG---------------------------------- 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCAAGTGACGCGGACCTGGAAGGCGAGATGAGCCCTGAAGAGATTCTGGAGTGGGAGGAGCAGCAACTAGATGA 1184
Query 881 -----------------------------------------------------------------------AGA 883
|||
Sbjct 1185 ACCTGTCAACTTCAGTGACTGCAAAATTGATCCTGCTCCCTTCCAGCTGGTGGAGCGGACCTCTTTGCACAAGA 1258
Query 884 CTCACACTATCTTCTCACTGCTGGGAGTGGACCATGCTTATGTCACCAGTATTGGCAGACTCATTGGAATCGTT 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCACACTATCTTCTCACTGCTGGGAGTGGACCATGCTTATGTCACCAGTATTGGCAGACTCATTGGAATCGTT 1332
Query 958 ACTCTAAAGGAGCTCCGGAAGGCCATCGAGGGCTCTGTCACAGCACAGGGTGTGAAAGTCCGGCCGCCCCTCGC 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTCTAAAGGAGCTCCGGAAGGCCATCGAGGGCTCTGTCACAGCACAGGGTGTGAAAGTCCGGCCGCCCCTCGC 1406
Query 1032 CAGCTTCCGAGACAGTGCCACCAGCAGCAGTGACACGGAGACCACTGAGGTGCATGCACTCTGGGGGCCCCACT 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAGCTTCCGAGACAGTGCCACCAGCAGCAGTGACACGGAGACCACTGAGGTGCATGCACTCTGGGGGCCCCACT 1480
Query 1106 CCCGTCATGGCCTCCCCCGGGAGGGCAGCCCTTCCGACAGCGACGACAAATGCCAA 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCCGTCATGGCCTCCCCCGGGAGGGCAGCCCTTCCGACAGCGACGACAAATGCCAA 1536