Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10747
• Subject: NM_001145134.2
• Aligned Length: 2214
• Identities: 1700
• Gaps: 513

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG  444

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGGAGTTGCT  11
                                                                           |||||||||||
Sbjct  445  ACCAGGATCTGGGCTTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATGATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCT  518

Query   12  GGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATACCTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTA  85
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATACCTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTA  592

Query   86  ACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAGGAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTAT  159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAGGAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTAT  666

Query  160  TATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAGCCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCAT  233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAGCCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCAT  740

Query  234  GATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTGATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCT  307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTGATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCT  814

Query  308  CCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAAGGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCA  381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAAGGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCA  888

Query  382  GACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGCTGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCT  455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGCTGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCT  962

Query  456  CAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGACCCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGA  529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGACCCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGA  1036

Query  530  AGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGCACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAG  603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGCACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAG  1110

Query  604  AATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGGCCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGA  677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGGCCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGA  1184

Query  678  CCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTACATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTG  751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTACATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTG  1258

Query  752  ACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCTCAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCT  825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCTCAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCT  1332

Query  826  CCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCTTCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCA  899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCTTCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCA  1406

Query  900  CTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTGCAGTGGGACATTCCAAAA------CAGG  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||
Sbjct 1407  CTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTGCAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGG  1480

Query  968  CGGTCATCAAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGACGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTG  1041
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGACGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTG  1554

Query 1042  CCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATGCCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGC  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATGCCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGC  1628

Query 1116  TCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCAATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGA  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCAATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGA  1702

Query 1190  CTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCAGGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAA  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCAGGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAA  1776

Query 1264  GCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGAATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGC  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGAATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGC  1850

Query 1338  AGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTACCTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTG  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTACCTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTG  1924

Query 1412  AGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCAATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAG  1485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCAATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAG  1998

Query 1486  CAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAGCAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACAT  1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAGCAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACAT  2072

Query 1560  GATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTCTCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCT  1633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTCTCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCT  2146

Query 1634  TTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTTCCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTTCCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC  2214