Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10801
• Subject: XM_005245770.1
• Aligned Length: 2493
• Identities: 1800
• Gaps: 693

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACAACAGAGAAGAGTTTAGTGACTGAGGCCGAAAATTCACAGCACCAACAGAAGGAAGAGGGTGAGGAAGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CATAAACTCAGGCCAACAAGAACCTCAGCAGGAGGAATCTTGTCAAACAGCAGCTGAAGGAGATAATTGGTGTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AACAGAAGCTGAAAGCTTCTAATGGAGACACTCCTACACATGAAGACTTGACCAAGAACAAGGAGCGGACATCA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GAAAGCAGAGGACTTTCACGACTATTCTCCTCGTTTCTCAAAAGGCCCAAATCTCAGGTGTCCGAGGAAGAAGG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CAAAGAAGTAGAGTCAGATAAAGAAAAAGGTGAAGGAGGTCAGAAAGAGATAGAATTTGGAACCAGTCTTGATG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  AAGAGATCATTTTAAAGGCCCCAATTGCAGCTCCTGAACCGGAACTCAAAACAGACCCATCTTTGGATCTTCAT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  TCATTAAGCAGTGCAGAAACACAGCCTGCTCAGGAAGAACTCAGAGAAGATCCAGATTTTGAAATTAAGGAAGG  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  AGAAGGACTTGAAGAGTGCTCCAAAATAGAAGTAAAAGAAGAAAGCCCTCAATCAAAAGCAGAAACAGAATTAA  592

Query    1  -----------------------------------ATGCACTGCAAGGTTTCTTTGTTGGATGACACAGTTTAT  39
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGCTTCCCAAAAACCAATCAGAAAACACAGGAACATGCACTGCAAGGTTTCTTTGTTGGATGACACAGTTTAT  666

Query   40  GAATGTGTTGTGGAGAAACATGCTAAGGGACAAGATTTGCTTAAACGAGTATGTGAGCATCTCAATCTTTTGGA  113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATGTGTTGTGGAGAAACATGCTAAGGGACAAGATTTGCTTAAACGAGTATGTGAGCATCTCAATCTTTTGGA  740

Query  114  AGAAGACTATTTTGGTCTAGCCATTTGGGATAACGCAACCTCTAAGACATGGCTGGATTCCGCCAAAGAAATAA  187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAAGACTATTTTGGTCTAGCCATTTGGGATAACGCAACCTCTAAGACATGGCTGGATTCCGCCAAAGAAATAA  814

Query  188  AAAAGCAGGTTCGTGGTGTCCCTTGGAATTTTACATTTAATGTAAAGTTTTATCCACCTGACCCAGCACAGTTA  261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAAGCAGGTTCGTGGTGTCCCTTGGAATTTTACATTTAATGTAAAGTTTTATCCACCTGACCCAGCACAGTTA  888

Query  262  ACAGAAGACATAACAAGATATTATTTATGTCTTCAGCTTCGGCAGGACATAGTTGCAGGACGTCTGCCCTGTTC  335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGAAGACATAACAAGATATTATTTATGTCTTCAGCTTCGGCAGGACATAGTTGCAGGACGTCTGCCCTGTTC  962

Query  336  CTTTGCAACCTTAGCATTATTAGGTTCTTACACCATCCAGTCTGAACTGGGAGACTACGACCCAGAACTCCATG  409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGCAACCTTAGCATTATTAGGTTCTTACACCATCCAGTCTGAACTGGGAGACTACGACCCAGAACTCCATG  1036

Query  410  GCGTGGATTATGTTAGTGATTTTAAACTGGCCCCGAATCAGACCAAGGAACTTGAAGAGAAGGTCATGGAACTG  483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGTGGATTATGTTAGTGATTTTAAACTGGCCCCGAATCAGACCAAGGAACTTGAAGAGAAGGTCATGGAACTG  1110

Query  484  CATAAGTCATACAGGTCCATGACTCCAGCTCAGGCTGACTTGGAGTTTCTTGAGAATGCCAAAAAGTTGTCTAT  557
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATAAGTCATACAGGTCCATGACTCCAGCTCAGGCTGACTTGGAGTTTCTTGAGAATGCCAAAAAGTTGTCTAT  1184

Query  558  GTATGGAGTTGATCTTCATAAAGCAAAGGACTTGGAAGGAGTAGATATCATCCTAGGTGTCTGCTCTAGTGGCC  631
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTATGGAGTTGATCTTCATAAAGCAAAGGACTTGGAAGGAGTAGATATCATCCTAGGTGTCTGCTCTAGTGGCC  1258

Query  632  TTCTGGTTTACAAAGATAAGCTGAGAATTAACCGCTTCCCTTGGCCCAAAGTGCTGAAGATTTCTTATAAACGT  705
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTCTGGTTTACAAAGATAAGCTGAGAATTAACCGCTTCCCTTGGCCCAAAGTGCTGAAGATTTCTTATAAACGT  1332

Query  706  AGTAGCTTTTTCATCAAGATTCGGCCTGGAGAGCAAGAGCAGTATGAAAGTACCATCGGATTCAAACTTCCCAG  779
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTAGCTTTTTCATCAAGATTCGGCCTGGAGAGCAAGAGCAGTATGAAAGTACCATCGGATTCAAACTTCCCAG  1406

Query  780  TTACCGAGCAGCTAAGAAATTATGGAAAGTCTGTGTAGAACATCACACGTTTTTCAGATTGACATCTACAGACA  853
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTACCGAGCAGCTAAGAAATTATGGAAAGTCTGTGTAGAACATCACACGTTTTTCAGATTGACATCTACAGACA  1480

Query  854  CCATTCCCAAAAGCAAATTTCTTGCGCTAGGATCCAAATTTCGATACAGTGGCCGGACTCAAGCTCAGACCAGG  927
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCATTCCCAAAAGCAAATTTCTTGCGCTAGGATCCAAATTTCGATACAGTGGCCGGACTCAAGCTCAGACCAGG  1554

Query  928  CAAGCTAGTGCTCTAATTGACAGGCCTGCCCCACACTTCGAGCGTACAGCAAGTAAACGGGCGTCCCGGAGCCT  1001
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAAGCTAGTGCTCTAATTGACAGGCCTGCCCCACACTTCGAGCGTACAGCAAGTAAACGGGCGTCCCGGAGCCT  1628

Query 1002  CGATGGAGCAGCAGCTGTCGATTCGGCAGACCGAAGTCCTCGGCCCACTTCTGCACCTGCCATTACTCAGGGTC  1075
            ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGATGG---AGCAGCTGTCGATTCGGCAGACCGAAGTCCTCGGCCCACTTCTGCACCTGCCATTACTCAGGGTC  1699

Query 1076  AGGTTGCAGAAGGTGGCGTCCTAGATGCCTCTGCTAAAAAAACAGTGGTCCCTAAAGCACAGAAGGAAACAGTG  1149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  AGGTTGCAGAAGGTGGCGTCCTAGATGCCTCTGCTAAAAAAACAGTGGTCCCTAAAGCACAGAAGGAAACAGTG  1773

Query 1150  AAGGCTGAAGTGAAAAAGGAAGACGAGCCACCTGAGCAAGCTGAGCCAGAGCCCACAGAAGCATGGAAGAAAAA  1223
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 1774  AAGGCTGAAGTGAAAAAGGAAGACGAGCCACCTGAGCAAGCTGAGCCAGAGCCCACAGAAGCATGGA-------  1840

Query 1224  GAGAGAAAGACTAGATGGTGAAAACATTTATATCAGACATAGCAATTTAATGTTGGAGGATTTAGACAAGAGTC  1297
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 1841  --------------------------------------------------------AGGATTTAGACAAGAGTC  1858

Query 1298  AAGAGGAGATCAAAAAACATCATGCCAGCATCAGTGAGCTGAAAAAGAACTTCATGGAGTCTGTACCAGAACCA  1371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859  AAGAGGAGATCAAAAAACATCATGCCAGCATCAGTGAGCTGAAAAAGAACTTCATGGAGTCTGTACCAGAACCA  1932

Query 1372  CGGCCTAGTGAATGGGATAAACGCTTATCCACTCACTCACCCTTCCGAACTCTTAACATCAATGGGCAAATCCC  1445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933  CGGCCTAGTGAATGGGATAAACGCTTATCCACTCACTCACCCTTCCGAACTCTTAACATCAATGGGCAAATCCC  2006

Query 1446  CACAGGAGAAGGACCTCCCCTGGTGAAGACACAAACTGTCACCATCTCAGATAATGCCAATGCTGTGAAAAGTG  1519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007  CACAGGAGAAGGACCTCCCCTGGTGAAGACACAAACTGTCACCATCTCAGATAATGCCAATGCTGTGAAAAGTG  2080

Query 1520  AAATCCCAACCAAAGACGTCCCTATTGTCCACACTGAGACCAAGACCATCACTTATGAGGCTGCCCAGACTGAC  1593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081  AAATCCCAACCAAAGACGTCCCTATTGTCCACACTGAGACCAAGACCATCACTTATGAGGCTGCCCAGACTGAC  2154

Query 1594  GACAACAGTGGAGACTTGGACCCAGGAGTCTTGCTGACAGCTCAAACTATCACATCTGAGACCCCAAGCAGCAC  1667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155  GACAACAGTGGAGACTTGGACCCAGGAGTCTTGCTGACAGCTCAAACTATCACATCTGAGACCCCAAGCAGCAC  2228

Query 1668  CACCACAACTCAAATTACCAAGACTGTAAAAGGTGGGATTTCAGAGACACGTATTGAAAAGAGAATTGTGATCA  1741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229  CACCACAACTCAAATTACCAAGACTGTAAAAGGTGGGATTTCAGAGACACGTATTGAAAAGAGAATTGTGATCA  2302

Query 1742  CAGGAGATGCTGATATTGACCATGATCAGGTCCTTGTACAAGCCATCAAGGAGGCAAAGGAGCAGCACCCAGAC  1815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2303  CAGGAGATGCTGATATTGACCATGATCAGGTCCTTGTACAAGCCATCAAGGAGGCAAAGGAGCAGCACCCAGAC  2376

Query 1816  ATGTCAGTGACCAAGGTGGTCGTCCACCAGGAGACCGAGATTGCTGATGAG  1866
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377  ATGTCAGTGACCAAGGTGGTCGTCCACCAGGAGACCGAGATTGCTGATGAG  2427