Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10801
• Subject: XM_011540964.1
• Aligned Length: 2466
• Identities: 1866
• Gaps: 600

Alignment

Query    1  ATGCACTGCAAGGTTTCTTTGTTGGATGACACAGTTTATGAATGTGTTGTGGAGAAACATGCTAAGGGACAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACTGCAAGGTTTCTTTGTTGGATGACACAGTTTATGAATGTGTTGTGGAGAAACATGCTAAGGGACAAGA  74

Query   75  TTTGCTTAAACGAGTATGTGAGCATCTCAATCTTTTGGAAGAAGACTATTTTGGTCTAGCCATTTGGGATAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTGCTTAAACGAGTATGTGAGCATCTCAATCTTTTGGAAGAAGACTATTTTGGTCTAGCCATTTGGGATAACG  148

Query  149  CAACCTCTAAGACATGGCTGGATTCCGCCAAAGAAATAAAAAAGCAGGTTCGTGGTGTCCCTTGGAATTTTACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAACCTCTAAGACATGGCTGGATTCCGCCAAAGAAATAAAAAAGCAGGTTCGTGGTGTCCCTTGGAATTTTACA  222

Query  223  TTTAATGTAAAGTTTTATCCACCTGACCCAGCACAGTTAACAGAAGACATAACAAGATATTATTTATGTCTTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTAATGTAAAGTTTTATCCACCTGACCCAGCACAGTTAACAGAAGACATAACAAGATATTATTTATGTCTTCA  296

Query  297  GCTTCGGCAGGACATAGTTGCAGGACGTCTGCCCTGTTCCTTTGCAACCTTAGCATTATTAGGTTCTTACACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTTCGGCAGGACATAGTTGCAGGACGTCTGCCCTGTTCCTTTGCAACCTTAGCATTATTAGGTTCTTACACCA  370

Query  371  TCCAGTCTGAACTGGGAGACTACGACCCAGAACTCCATGGCGTGGATTATGTTAGTGATTTTAAACTGGCCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCAGTCTGAACTGGGAGACTACGACCCAGAACTCCATGGCGTGGATTATGTTAGTGATTTTAAACTGGCCCCG  444

Query  445  AATCAGACCAAGGAACTTGAAGAGAAGGTCATGGAACTGCATAAGTCATACAGGTCCATGACTCCAGCTCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATCAGACCAAGGAACTTGAAGAGAAGGTCATGGAACTGCATAAGTCATACAGGTCCATGACTCCAGCTCAGGC  518

Query  519  TGACTTGGAGTTTCTTGAGAATGCCAAAAAGTTGTCTATGTATGGAGTTGATCTTCATAAAGCAAAGGACTTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACTTGGAGTTTCTTGAGAATGCCAAAAAGTTGTCTATGTATGGAGTTGATCTTCATAAAGCAAAGGACTTGG  592

Query  593  AAGGAGTAGATATCATCCTAGGTGTCTGCTCTAGTGGCCTTCTGGTTTACAAAGATAAGCTGAGAATTAACCGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGGAGTAGATATCATCCTAGGTGTCTGCTCTAGTGGCCTTCTGGTTTACAAAGATAAGCTGAGAATTAACCGC  666

Query  667  TTCCCTTGGCCCAAAGTGCTGAAGATTTCTTATAAACGTAGTAGCTTTTTCATCAAGATTCGGCCTGGAGAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCCCTTGGCCCAAAGTGCTGAAGATTTCTTATAAACGTAGTAGCTTTTTCATCAAGATTCGGCCTGGAGAGCA  740

Query  741  AGAGCAGTATGAAAGTACCATCGGATTCAAACTTCCCAGTTACCGAGCAGCTAAGAAATTATGGAAAGTCTGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGCAGTATGAAAGTACCATCGGATTCAAACTTCCCAGTTACCGAGCAGCTAAGAAATTATGGAAAGTCTGTG  814

Query  815  TAGAACATCACACGTTTTTCAGATTGACATCTACAGACACCATTCCCAAAAGCAAATTTCTTGCGCTAGGATCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGAACATCACACGTTTTTCAGATTGACATCTACAGACACCATTCCCAAAAGCAAATTTCTTGCGCTAGGATCC  888

Query  889  AAATTTCGATACAGTGGCCGGACTCAAGCTCAGACCAGGCAAGCTAGTGCTCTAATTGACAGGCCTGCCCCACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATTTCGATACAGTGGCCGGACTCAAGCTCAGACCAGGCAAGCTAGTGCTCTAATTGACAGGCCTGCCCCACA  962

Query  963  CTTCGAGCGTACAGCAAGTAAACGGGCGTCCCGGAGCCTCGATGGAGCAGCAGCTGTCGATTCGGCAGACCGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCGAGCGTACAGCAAGTAAACGGGCGTCCCGGAGCCTCGATGGAGCAGCAGCTGTCGATTCGGCAGACCGAA  1036

Query 1037  GTCCTCGGCCCACTTCTGCACCTGCCATTACTCAGGGTCAGGTTGCAGAAGGTGGCGTCCTAGATGCCTCTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCCTCGGCCCACTTCTGCACCTGCCATTACTCAGGGTCAGGTTGCAGAAGGTGGCGTCCTAGATGCCTCTGCT  1110

Query 1111  AAAAAAACAGTGGTCCCTAAAGCACAGAAGGAAACAGTGAAGGCTGAAGTGAAAAAGGAAGACGAGCCACCTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAAAACAGTGGTCCCTAAAGCACAGAAGGAAACAGTGAAGGCTGAAGTGAAAAAGGAAGACGAGCCACCTGA  1184

Query 1185  GCAAGCTGAGCCAGAGCCCACAGAAGCAT---------------------------------------------  1213
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct 1185  GCAAGCTGAGCCAGAGCCCACAGAAGCATGGAAGGTGGAAAAAACCCACATCGAGGTGACAGTACCCACCTCAA  1258

Query 1214  ------------------------------------------------------GGAAGAAAAAGAGAGAAAGA  1233
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGTGACCAAACACAGAAGCTTGCAGAAAAAACTGAAGATCTGATAAGAATGAGGAAGAAAAAGAGAGAAAGA  1332

Query 1234  CTAGATGGTGAAAACATTTATATCAGACATAGCAATTTAATGTTGGAGGATTTAGACAAGAGTCAAGAGGAGAT  1307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTAGATGGTGAAAACATTTATATCAGACATAGCAATTTAATGTTGGAGGATTTAGACAAGAGTCAAGAGGAGAT  1406

Query 1308  CAAAAAACATCATGCCAGCATCAGTGAGCTGAAAAAGAACTTCATGGAGTCTGTACCAGAACCACGGCCTAGTG  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAAAAACATCATGCCAGCATCAGTGAGCTGAAAAAGAACTTCATGGAGTCTGTACCAGAACCACGGCCTAGTG  1480

Query 1382  AATGGGATAAACGCTTATCCACTCACTCACCCTTCCGAACTCTTAACATCAATGGGCAAATCCCCACAGGAGAA  1455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATGGGATAAACGCTTATCCACTCACTCACCCTTCCGAACTCTTAACATCAATGGGCAAATCCCCACAGGAGAA  1554

Query 1456  GGA-----------------------------------------------------------------------  1458
            |||                                                                       
Sbjct 1555  GGAGTGAAGAAAACTTCTGTCCTACCCTCGGAAAGAAAGGTTGGTGGGCCAGAGAGTATAAATGGCATTCGCAC  1628

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1629  AGAGGAGGTGGCTGTCGTGACAAAGGGGCCATCTACTAACCCTGACTCTGAATGGGAGGGTCCCAAGCATTCGG  1702

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1703  TAGTTCCTAGTAAAAGCCAGATGACCACCTCGTCGGAGTCTCTGCAAAGCTTTGCCTTTGGCTCCCTCTCCATA  1776

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1777  AGCAGCAAGGAGACAGAAGAGAAGGAGGAGGGGGCAGCTGGCTATCTTGATATTAAGGAGATGCCAAGAGGCCC  1850

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1851  AACTGGGGGATGTATAGGAGTGGAGGAACAGGCCAGTGCCTTAAAGTTCTCAGTAACACCAGCTTCCTGTCAGC  1924

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1925  TGCAACCTGGTGTAAAAAAGGCAGAGAGTAGTGAAGAACATGTTACACCAGGAGAGCCACCTGGAAAACAAAAT  1998

Query 1459  ------------------------------------------------------------CCTCCCCTGGTGAA  1472
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct 1999  GGATCATTTCTTGACTTTCATGTGGGTAACCAGTTCCCCACCCTCATTCGAAGTTTCCAGCCTCCCCTGGTGAA  2072

Query 1473  GACACAAACTGTCACCATCTCAGATAATGCCAATGCTGTGAAAAGTGAAATCCCAACCAAAGACGTCCCTATTG  1546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GACACAAACTGTCACCATCTCAGATAATGCCAATGCTGTGAAAAGTGAAATCCCAACCAAAGACGTCCCTATTG  2146

Query 1547  TCCACACTGAGACCAAGACCATCACTTATGAGGCTGCCCAGACTGACGACAACAGTGGAGACTTGGACCCAGGA  1620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCCACACTGAGACCAAGACCATCACTTATGAGGCTGCCCAGACTGACGACAACAGTGGAGACTTGGACCCAGGA  2220

Query 1621  GTCTTGCTGACAGCTCAAACTATCACATCTGAGACCCCAAGCAGCACCACCACAACTCAAATTACCAAGACTGT  1694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTCTTGCTGACAGCTCAAACTATCACATCTGAGACCCCAAGCAGCACCACCACAACTCAAATTACCAAGACTGT  2294

Query 1695  AAAAGGTGGGATTTCAGAGACACGTATTGAAAAGAGAATTGTGATCACAGGAGATGCTGATATTGACCATGATC  1768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AAAAGGTGGGATTTCAGAGACACGTATTGAAAAGAGAATTGTGATCACAGGAGATGCTGATATTGACCATGATC  2368

Query 1769  AGGTCCTTGTACAAGCCATCAAGGAGGCAAAGGAGCAGCACCCAGACATGTCAGTGACCAAGGTGGTCGTCCAC  1842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGGTCCTTGTACAAGCCATCAAGGAGGCAAAGGAGCAGCACCCAGACATGTCAGTGACCAAGGTGGTCGTCCAC  2442

Query 1843  CAGGAGACCGAGATTGCTGATGAG  1866
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CAGGAGACCGAGATTGCTGATGAG  2466