Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10801
• Subject: XM_017000597.1
• Aligned Length: 2367
• Identities: 1800
• Gaps: 567

Alignment

Query    1  ATGCACTGCAAGGTTTCTTTGTTGGATGACACAGTTTATGAATGTGTTGTGGAGAAACATGCTAAGGGACAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACTGCAAGGTTTCTTTGTTGGATGACACAGTTTATGAATGTGTTGTGGAGAAACATGCTAAGGGACAAGA  74

Query   75  TTTGCTTAAACGAGTATGTGAGCATCTCAATCTTTTGGAAGAAGACTATTTTGGTCTAGCCATTTGGGATAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTTGCTTAAACGAGTATGTGAGCATCTCAATCTTTTGGAAGAAGACTATTTTGGTCTAGCCATTTGGGATAACG  148

Query  149  CAACCTCTAAGACATGGCTGGATTCCGCCAAAGAAATAAAAAAGCAGGTTCGTGGTGTCCCTTGGAATTTTACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAACCTCTAAGACATGGCTGGATTCCGCCAAAGAAATAAAAAAGCAGGTTCGTGGTGTCCCTTGGAATTTTACA  222

Query  223  TTTAATGTAAAGTTTTATCCACCTGACCCAGCACAGTTAACAGAAGACATAACAAGATATTATTTATGTCTTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTAATGTAAAGTTTTATCCACCTGACCCAGCACAGTTAACAGAAGACATAACAAGATATTATTTATGTCTTCA  296

Query  297  GCTTCGGCAGGACATAGTTGCAGGACGTCTGCCCTGTTCCTTTGCAACCTTAGCATTATTAGGTTCTTACACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTTCGGCAGGACATAGTTGCAGGACGTCTGCCCTGTTCCTTTGCAACCTTAGCATTATTAGGTTCTTACACCA  370

Query  371  TCCAGTCTGAACTGGGAGACTACGACCCAGAACTCCATGGCGTGGATTATGTTAGTGATTTTAAACTGGCCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCAGTCTGAACTGGGAGACTACGACCCAGAACTCCATGGCGTGGATTATGTTAGTGATTTTAAACTGGCCCCG  444

Query  445  AATCAGACCAAGGAACTTGAAGAGAAGGTCATGGAACTGCATAAGTCATACAGGTCCATGACTCCAGCTCAGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATCAGACCAAGGAACTTGAAGAGAAGGTCATGGAACTGCATAAGTCATACAGGTCCATGACTCCAGCTCAGGC  518

Query  519  TGACTTGGAGTTTCTTGAGAATGCCAAAAAGTTGTCTATGTATGGAGTTGATCTTCATAAAGCAAAGGACTTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACTTGGAGTTTCTTGAGAATGCCAAAAAGTTGTCTATGTATGGAGTTGATCTTCATAAAGCAAAGGACTTGG  592

Query  593  AAGGAGTAGATATCATCCTAGGTGTCTGCTCTAGTGGCCTTCTGGTTTACAAAGATAAGCTGAGAATTAACCGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGGAGTAGATATCATCCTAGGTGTCTGCTCTAGTGGCCTTCTGGTTTACAAAGATAAGCTGAGAATTAACCGC  666

Query  667  TTCCCTTGGCCCAAAGTGCTGAAGATTTCTTATAAACGTAGTAGCTTTTTCATCAAGATTCGGCCTGGAGAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCCCTTGGCCCAAAGTGCTGAAGATTTCTTATAAACGTAGTAGCTTTTTCATCAAGATTCGGCCTGGAGAGCA  740

Query  741  AGAGCAGTATGAAAGTACCATCGGATTCAAACTTCCCAGTTACCGAGCAGCTAAGAAATTATGGAAAGTCTGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGCAGTATGAAAGTACCATCGGATTCAAACTTCCCAGTTACCGAGCAGCTAAGAAATTATGGAAAGTCTGTG  814

Query  815  TAGAACATCACACGTTTTTCAGATTGACATCTACAGACACCATTCCCAAAAGCAAATTTCTTGCGCTAGGATCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGAACATCACACGTTTTTCAGATTGACATCTACAGACACCATTCCCAAAAGCAAATTTCTTGCGCTAGGATCC  888

Query  889  AAATTTCGATACAGTGGCCGGACTCAAGCTCAGACCAGGCAAGCTAGTGCTCTAATTGACAGGCCTGCCCCACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATTTCGATACAGTGGCCGGACTCAAGCTCAGACCAGGCAAGCTAGTGCTCTAATTGACAGGCCTGCCCCACA  962

Query  963  CTTCGAGCGTACAGCAAGTAAACGGGCGTCCCGGAGCCTCGATGGAGCAGCAGCTGTCGATTCGGCAGACCGAA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCGAGCGTACAGCAAGTAAACGGGCGTCCCGGAGCCTCGATGG---AGCAGCTGTCGATTCGGCAGACCGAA  1033

Query 1037  GTCCTCGGCCCACTTCTGCACCTGCCATTACTCAGGGTCAGGTTGCAGAAGGTGGCGTCCTAGATGCCTCTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  GTCCTCGGCCCACTTCTGCACCTGCCATTACTCAGGGTCAGGTTGCAGAAGGTGGCGTCCTAGATGCCTCTGCT  1107

Query 1111  AAAAAAACAGTGGTCCCTAAAGCACAGAAGGAAACAGTGAAGGCTGAAGTGAAAAAGGAAGACGAGCCACCTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  AAAAAAACAGTGGTCCCTAAAGCACAGAAGGAAACAGTGAAGGCTGAAGTGAAAAAGGAAGACGAGCCACCTGA  1181

Query 1185  GCAAGCTGAGCCAGAGCCCACAGAAGCATGGAAGAAAAAGAGAGAAAGACTAGATGGTGAAAACATTTATATCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct 1182  GCAAGCTGAGCCAGAGCCCACAGAAGCATGGA------------------------------------------  1213

Query 1259  GACATAGCAATTTAATGTTGGAGGATTTAGACAAGAGTCAAGAGGAGATCAAAAAACATCATGCCAGCATCAGT  1332
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214  ---------------------AGGATTTAGACAAGAGTCAAGAGGAGATCAAAAAACATCATGCCAGCATCAGT  1266

Query 1333  GAGCTGAAAAAGAACTTCATGGAGTCTGTACCAGAACCACGGCCTAGTGAATGGGATAAACGCTTATCCACTCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  GAGCTGAAAAAGAACTTCATGGAGTCTGTACCAGAACCACGGCCTAGTGAATGGGATAAACGCTTATCCACTCA  1340

Query 1407  CTCACCCTTCCGAACTCTTAACATCAATGGGCAAATCCCCACAGGAGAAGGA----------------------  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1341  CTCACCCTTCCGAACTCTTAACATCAATGGGCAAATCCCCACAGGAGAAGGAGTGAAGAAAACTTCTGTCCTAC  1414

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1415  CCTCGGAAAGAAAGGTTGGTGGGCCAGAGAGTATAAATGGCATTCGCACAGAGGAGGTGGCTGTCGTGACAAAG  1488

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1489  GGGCCATCTACTAACCCTGACTCTGAATGGGAGGGTCCCAAGCATTCGGTAGTTCCTAGTAAAAGCCAGATGAC  1562

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1563  CACCTCGTCGGAGTCTCTGCAAAGCTTTGCCTTTGGCTCCCTCTCCATAAGCAGCAAGGAGACAGAAGAGAAGG  1636

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1637  AGGAGGGGGCAGCTGGCTATCTTGATATTAAGGAGATGCCAAGAGGCCCAACTGGGGGATGTATAGGAGTGGAG  1710

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1711  GAACAGGCCAGTGCCTTAAAGTTCTCAGTAACACCAGCTTCCTGTCAGCTGCAACCTGGTGTAAAAAAGGCAGA  1784

Query 1459  --------------------------------------------------------------------------  1458
                                                                                      
Sbjct 1785  GAGTAGTGAAGAACATGTTACACCAGGAGAGCCACCTGGAAAACAAAATGGATCATTTCTTGACTTTCATGTGG  1858

Query 1459  -----------------------------------CCTCCCCTGGTGAAGACACAAACTGTCACCATCTCAGAT  1497
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859  GTAACCAGTTCCCCACCCTCATTCGAAGTTTCCAGCCTCCCCTGGTGAAGACACAAACTGTCACCATCTCAGAT  1932

Query 1498  AATGCCAATGCTGTGAAAAGTGAAATCCCAACCAAAGACGTCCCTATTGTCCACACTGAGACCAAGACCATCAC  1571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933  AATGCCAATGCTGTGAAAAGTGAAATCCCAACCAAAGACGTCCCTATTGTCCACACTGAGACCAAGACCATCAC  2006

Query 1572  TTATGAGGCTGCCCAGACTGACGACAACAGTGGAGACTTGGACCCAGGAGTCTTGCTGACAGCTCAAACTATCA  1645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007  TTATGAGGCTGCCCAGACTGACGACAACAGTGGAGACTTGGACCCAGGAGTCTTGCTGACAGCTCAAACTATCA  2080

Query 1646  CATCTGAGACCCCAAGCAGCACCACCACAACTCAAATTACCAAGACTGTAAAAGGTGGGATTTCAGAGACACGT  1719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081  CATCTGAGACCCCAAGCAGCACCACCACAACTCAAATTACCAAGACTGTAAAAGGTGGGATTTCAGAGACACGT  2154

Query 1720  ATTGAAAAGAGAATTGTGATCACAGGAGATGCTGATATTGACCATGATCAGGTCCTTGTACAAGCCATCAAGGA  1793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155  ATTGAAAAGAGAATTGTGATCACAGGAGATGCTGATATTGACCATGATCAGGTCCTTGTACAAGCCATCAAGGA  2228

Query 1794  GGCAAAGGAGCAGCACCCAGACATGTCAGTGACCAAGGTGGTCGTCCACCAGGAGACCGAGATTGCTGATGAG  1866
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229  GGCAAAGGAGCAGCACCCAGACATGTCAGTGACCAAGGTGGTCGTCCACCAGGAGACCGAGATTGCTGATGAG  2301