Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10807
• Subject: NM_001040275.1
• Aligned Length: 1485
• Identities: 964
• Gaps: 516

Alignment

Query    1  ATGGATATAAAAAACTCACCATCTAGCCTTAATTCTCCTTCCTCCTACAACTGCAGTCAATCCATCTTACCCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATATAAAAAACTCACCATCTAGCCTTAATTCTCCTTCCTCCTACAACTGCAGTCAATCCATCTTACCCCT  74

Query   75  GGAGCACGGCTCCATATACATACCTTCCTCCTATGTAGACAGCCACCATGAATATCCAGCCATGACATTCTATA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCACGGCTCCATATACATACCTTCCTCCTATGTAGACAGCCACCATGAATATCCAGCCATGACATTCTATA  148

Query  149  GCCCTGCTGTGATGAATTACAGCATTCCCAGCAATGTCACTAACTTGGAAGGTGGGCCTGGTCGGCAGACCACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCTGCTGTGATGAATTACAGCATTCCCAGCAATGTCACTAACTTGGAAGGTGGGCCTGGTCGGCAGACCACA  222

Query  223  AGCCCAAATGTGTTGTGGCCAACACCTGGGCACCTTTCTCCTTTAGTGGTCCATCGCCAGTTATCACATCTGTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCCAAATGTGTTGTGGCCAACACCTGGGCACCTTTCTCCTTTAGTGGTCCATCGCCAGTTATCACATCTGTA  296

Query  297  TGCGGAACCTCAAAAGAGTCCCTGGTGTGAAGCAAGATCGCTAGAACACACCTTACCTGTAAACAGAGAGACAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCGGAACCTCAAAAGAGTCCCTGGTGTGAAGCAAGATCGCTAGAACACACCTTACCTGTAAACAGAGAGACAC  370

Query  371  TGAAAAGGAAGGTTAGTGGGAACCGTTGCGCCAGCCCTGTTACTGGTCCAGGTTCAAAGAGGGATGCTCACTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAAAGGAAGGTTAGTGGGAACCGTTGCGCCAGCCCTGTTACTGGTCCAGGTTCAAAGAGGGATGCTCACTTC  444

Query  445  TGCGCTGTCTGCAGCGATTACGCATCGGGATATCACTATGGAGTCTGGTCGTGTGAAGGATGTAAGGCCTTTTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCGCTGTCTGCAGCGATTACGCATCGGGATATCACTATGGAGTCTGGTCGTGTGAAGGATGTAAGGCCTTTTT  518

Query  519  TAAAAGAAGCATTCAAGGACATAATGATTATATTTGTCCAGCTACAAATCAGTGTACAATCGATAAAAACCGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAAAGAAGCATTCAAGGACATAATGATTATATTTGTCCAGCTACAAATCAGTGTACAATCGATAAAAACCGGC  592

Query  593  GCAAGAGCTGCCAGGCCTGCCGACTTCGGAAGTGTTACGAAGTGGGAATGGTGAAGTGTGGCTCCCGGAGAGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGAGCTGCCAGGCCTGCCGACTTCGGAAGTGTTACGAAGTGGGAATGGTGAAGTGTGGCTCCCGGAGAGAG  666

Query  667  AGATGTGGGTACCGCCTTGTGCGGAGACAGAGAAGTGCCGACGAGCAGCTGCACTGTGCCGGCAAGGCCAAGAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGATGTGGGTACCGCCTTGTGCGGAGACAGAGAAGTGCCGACGAGCAGCTGCACTGTGCCGGCAAGGCCAAGAG  740

Query  741  AAGTGGCGGCCACGCGCCCCGAGTGCGGGAGCTGCTGCTGGACGCCCTGAGCCCCGAGCAGCTAGTGCTCACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGTGGCGGCCACGCGCCCCGAGTGCGGGAGCTGCTGCTGGACGCCCTGAGCCCCGAGCAGCTAGTGCTCACCC  814

Query  815  TCCTGGAGGCTGAGCCGCCCCATGTGCTGATCAGCCGCCCCAGTGCGCCCTTCACCGAGGCCTCCATGATGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTGGAGGCTGAGCCGCCCCATGTGCTGATCAGCCGCCCCAGTGCGCCCTTCACCGAGGCCTCCATGATGATG  888

Query  889  TCCCTGACCAAGTTGGCCGACAAGGAGTTGGTACACATGATCAGCTGGGCCAAGAAGATTCCCGG-GATGAGGG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ..||.||.
Sbjct  889  TCCCTGACCAAGTTGGCCGACAAGGAGTTGGTACACATGATCAGCTGGGCCAAGAAGATTCCCGGCTTTGTGGA  962

Query  962  G----------------AAATGCG--------------------------------------------------  969
            |                ||.||||                                                  
Sbjct  963  GCTCAGCCTGTTCGACCAAGTGCGGCTCTTGGAGAGCTGTTGGATGGAGGTGTTAATGATGGGGCTGATGTGGC  1036

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1037  GCTCAATTGACCACCCCGGCAAGCTCATCTTTGCTCCAGATCTTGTTCTGGACAGGGATGAGGGGAAATGCGTA  1110

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1111  GAAGGAATTCTGGAAATCTTTGACATGCTCCTGGCAACTACTTCAAGGTTTCGAGAGTTAAAACTCCAACACAA  1184

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1185  AGAATATCTCTGTGTCAAGGCCATGATCCTGCTCAATTCCAGTATGTACCCTCTGGTCACAGCGACCCAGGATG  1258

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1259  CTGACAGCAGCCGGAAGCTGGCTCACTTGCTGAACGCCGTGACCGATGCTTTGGTTTGGGTGATTGCCAAGAGC  1332

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1333  GGCATCTCCTCCCAGCAGCAATCCATGCGCCTGGCTAACCTCCTGATGCTCCTGTCCCACGTCAGGCATGCGAG  1406

Query  970  --------------------------------------------------------------------------  969
                                                                                      
Sbjct 1407  GGCAGAAAAGGCCTCTCAAACACTCACCTCATTTGGAATGAAGATGGAGACTCTTTTGCCTGAAGCAACGATGG  1480

Query  970  -----  969
                 
Sbjct 1481  AGCAG  1485