Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10808
- Subject:
- XM_011238917.2
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 1216
- Gaps:
- 57
Alignment
Query 1 ------------------------------------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTC 38
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTGGACCGTAACCCACAATTGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTC 74
Query 39 GTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCT 112
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 GTCCTTCATCAAGACGGAACCCTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGGT 148
Query 113 CTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTAC 186
||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTTCCGACGCCAGTGGGAGTTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTGGACTCGCCACCTCTCTAC 222
Query 187 CCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGA 260
||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 223 CCCTCTGCTCCGATCCTGGGAGGCAGCGGGCCTGTCCGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATCGTAGA 296
Query 261 AGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCG 334
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 297 GGATCCCCAGACCAAGTGTGAATATATGCTCAACTCCATGCCCAAGAGACTGTGCTTAGTGTGTGGCGACATCG 370
Query 335 CTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAAT 408
|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 371 CCTCTGGGTACCACTATGGGGTTGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACGATTCAAGGTAAC 444
Query 409 ATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCG 482
|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 ATAGAGTACAGCTGCCCAGCCACGAATGAATGTGAGATCACAAAGCGCAGACGCAAATCCTGCCAGGCCTGCCG 518
Query 483 CTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGA 556
|||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 519 CTTCATGAAGTGTCTCAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTCCGTCTTGACAGAGTGCGTGGAGGTCGGCAGA 592
Query 557 AGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCA 630
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGTACAAGCGCAGAATAGATGCTGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTGCAGCCAGCCAAAAAGCCA 666
Query 631 TTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGC 704
| ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 667 T---------------------ATAACAAGATTGTCTCGCATTTGTTGGTGGCTGAACCAGAGAAGATCTATGC 719
Query 705 CATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGT 778
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 720 CATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACCACACTCTGTGACTTGGCTGACCGAGAGT 793
Query 779 TGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTT 852
||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 794 TGGTGGTTATCATTGGATGGGCAAAACATATTCCAGGCTTCTCCACACTGTCCCTGGCAGACCAGATGAGCCTC 867
Query 853 CTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGT 926
||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 868 CTCCAGAGTGCATGGATGGAGATTCTGATCCTCGGCGTTGTGTACCGATCGCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGT 941
Query 927 CTATGCAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCC 1000
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 942 CTATGCAGACGATTATATAATGGATGAAGACCAGTCTAAATTAGCAGGCCTTCTTGACCTAAATAATGCTATCC 1015
Query 1001 TGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTT 1074
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1016 TGCAGCTGGTGAAGAAGTACAAGAGCATGAAGCTAGAGAAGGAAGAATTCGTCACCCTCAAAGCAATAGCTCTT 1089
Query 1075 GCTAATTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCT 1148
|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1090 GCTAATTCAGATTCCATGCATATAGAAGATGTGGAAGCTGTGCAGAAACTTCAGGATGTGTTACATGAGGCCCT 1163
Query 1149 GCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCC 1222
|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1164 GCAGGATTACGAGGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGCCGTGCAGGCAAGATGCTGATGACGCTGCCGCTGC 1237
Query 1223 TGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAA 1296
|||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1238 TGAGGCAGACCTCCACCAAGGCAGTCCAGCACTTCTACAACATCAAACTCGAAGGCAAAGTGCCCATGCACAAA 1311
Query 1297 CTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC 1326
|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1312 CTTTTTTTGGAAATGCTGGAGGCCAAGGTC 1341