Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10808
- Subject:
- XM_017000625.1
- Aligned Length:
- 1431
- Identities:
- 1326
- Gaps:
- 105
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCTGGGGTGGTTCAAAGAACAGGAAAAAAAAAAGGCAACATGACTGGAGCCTAGTGAATGAAGGAGTGTC 74
Query 1 -------------------------------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCT 43
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGACTTGAGGCTGGCAGGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCT 148
Query 44 TCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCA 117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCATCAAGACGGAACCTTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCA 222
Query 118 GACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTC 191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACGCCAGTGGGAGCTACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTC 296
Query 192 TGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATC 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCTCCTATCCTGGGAGGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATC 370
Query 266 CCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCT 339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCAGACCAAGTGTGAATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCT 444
Query 340 GGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGA 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGTACCACTATGGGGTAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGA 518
Query 414 ATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCA 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATACAGCTGCCCTGCCACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCA 592
Query 488 TGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTAC 561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAAGTGTTTAAAAGTGGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTAC 666
Query 562 AAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCT 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGCGCAGGATAGATGCGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCT 740
Query 636 CTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGC 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGGTCTGATCCTGCAGATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGC 814
Query 710 CTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTG 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGACCCTACTGTCCCCGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTG 888
Query 784 GTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCA 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTTATCATTGGATGGGCGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCA 962
Query 858 GAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATG 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GAGTGCTTGGATGGAAATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATG 1036
Query 932 CAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAG 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGACGATTATATAATGGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAG 1110
Query 1006 CTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAA 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGGTAAAGAAATACAAGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAA 1184
Query 1080 TTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGG 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCAGACTCCATGCACATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGG 1258
Query 1154 ATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGG 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTATGAAGCTGGCCAGCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGG 1332
Query 1228 CAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTT 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGACCTCTACCAAGGCCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTT 1406
Query 1302 TTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC 1326
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTTGGAAATGTTGGAGGCCAAGGTC 1431