Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10808
• Subject: XM_017000626.1
• Aligned Length: 1410
• Identities: 1305
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGGCGAGAATGTGATTGGGGTCTTGGAGCAGTCAAGTCTGATCTGGCCTGTGTTCCTTCAGCTAAAAGGCT  74

Query    1  ----------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCA  64
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACCTTCCA  148

Query   65  GCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGT  138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCTACAGT  222

Query  139  TCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAG  212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGAGGTAG  296

Query  213  TGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACA  286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGAATACA  370

Query  287  TGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCA  360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGGTAGCA  444

Query  361  TCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAA  434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCCACGAA  518

Query  435  TGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCA  508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGTGGGCA  592

Query  509  TGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAG  582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATGCGGAG  666

Query  583  AACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCAGATAA  656
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||
Sbjct  667  AACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCAT---------------------ATAA  719

Query  657  CAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACA  730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  CAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCCCGACA  793

Query  731  GTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAG  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  GTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGGCGAAG  867

Query  805  CATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTT  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  CATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAAATTTT  941

Query  879  GATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACG  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAATGGACG  1015

Query  953  AAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGC  1026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  AAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACAAGAGC  1089

Query 1027  ATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGA  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  ATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCACATAGA  1163

Query 1101  AGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACA  1174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  AGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCAGCACA  1237

Query 1175  TGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTG  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  TGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGGCCGTG  1311

Query 1249  CAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAA  1322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  CAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAGGCCAA  1385

Query 1323  GGTC  1326
            ||||
Sbjct 1386  GGTC  1389