Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10808
• Subject: XM_017000630.1
• Aligned Length: 1341
• Identities: 1326
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ---------------ATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACC  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCTCTGCAGAATGTCAAACAAAGATCGACACATTGATTCCAGCTGTTCGTCCTTCATCAAGACGGAACC  74

Query   60  TTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCT  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCCAGCCCAGCCTCCCTGACGGACAGCGTCAACCACCACAGCCCTGGTGGCTCTTCAGACGCCAGTGGGAGCT  148

Query  134  ACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGA  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAGTTCAACCATGAATGGCCATCAGAACGGACTTGACTCGCCACCTCTCTACCCTTCTGCTCCTATCCTGGGA  222

Query  208  GGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGA  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTAGTGGGCCTGTCAGGAAACTGTATGATGACTGCTCCAGCACCATTGTTGAAGATCCCCAGACCAAGTGTGA  296

Query  282  ATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATACATGCTCAACTCGATGCCCAAGAGACTGTGTTTAGTGTGTGGTGACATCGCTTCTGGGTACCACTATGGGG  370

Query  356  TAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCC  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGCATCATGTGAAGCCTGCAAGGCATTCTTCAAGAGGACAATTCAAGGCAATATAGAATACAGCTGCCCTGCC  444

Query  430  ACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGT  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACGAATGAATGTGAAATCACAAAGCGCAGACGTAAATCCTGCCAGGCTTGCCGCTTCATGAAGTGTTTAAAAGT  518

Query  504  GGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATG  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCATGCTGAAAGAAGGGGTGCGTCTTGACAGAGTACGTGGAGGTCGGCAGAAGTACAAGCGCAGGATAGATG  592

Query  578  CGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCA  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGAGAACAGCCCATACCTGAACCCTCAGCTGGTTCAGCCAGCCAAAAAGCCATTGCTCTGGTCTGATCCTGCA  666

Query  652  GATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCC  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATAACAAGATTGTCTCACATTTGTTGGTGGCTGAACCGGAGAAGATCTATGCCATGCCTGACCCTACTGTCCC  740

Query  726  CGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGG  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGACAGTGACATCAAAGCCCTCACTACACTGTGTGACTTGGCCGACCGAGAGTTGGTGGTTATCATTGGATGGG  814

Query  800  CGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAA  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAAGCATATTCCAGGCTTCTCCACGCTGTCCCTGGCGGACCAGATGAGCCTTCTGCAGAGTGCTTGGATGGAA  888

Query  874  ATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAAT  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTTTGATCCTTGGTGTCGTATACCGGTCTCTTTCGTTTGAGGATGAACTTGTCTATGCAGACGATTATATAAT  962

Query  948  GGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACGAAGACCAGTCCAAATTAGCAGGCCTTCTTGATCTAAATAATGCTATCCTGCAGCTGGTAAAGAAATACA  1036

Query 1022  AGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCAC  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGCATGAAGCTGGAAAAAGAAGAATTTGTCACCCTCAAAGCTATAGCTCTTGCTAATTCAGACTCCATGCAC  1110

Query 1096  ATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCA  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATAGAAGATGTTGAAGCCGTTCAGAAGCTTCAGGATGTCTTACATGAAGCGCTGCAGGATTATGAAGCTGGCCA  1184

Query 1170  GCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGG  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCACATGGAAGACCCTCGTCGAGCTGGCAAGATGCTGATGACACTGCCACTCCTGAGGCAGACCTCTACCAAGG  1258

Query 1244  CCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAG  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCGTGCAGCATTTCTACAACATCAAACTAGAAGGCAAAGTCCCAATGCACAAACTTTTTTTGGAAATGTTGGAG  1332

Query 1318  GCCAAGGTC  1326
            |||||||||
Sbjct 1333  GCCAAGGTC  1341