Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10814
- Subject:
- NM_172110.3
- Aligned Length:
- 1614
- Identities:
- 1304
- Gaps:
- 309
Alignment
Query 1 ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC 74
Query 75 TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT 148
Query 149 TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC 222
Query 223 AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTC--- 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTCCTA 296
Query 294 ---------------------------------------------------------------------CTTCA 298
|||||
Sbjct 297 CAGCATCAAGACAGAAGACAGCTTGAACCATTCCCCTGGCCAGAGTGGATTCCTCAGCTATGGCTCCAGCTTCA 370
Query 299 GCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCTACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTATCAAGGAGGAAAT 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCTACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTATCAAGGAGGAAAT 444
Query 373 GGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCTTCCCCCAGAGCCA 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCTTCCCCCAGAGCCA 518
Query 447 GTACCCCCAGTATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGCCCTTCGCCCCTCT 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTACCCCCAGTATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGCCCTTCGCCCCTCT 592
Query 521 CCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTCACTTGCTGGTGAA 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTCACTTGCTGGTGAA 666
Query 595 TACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCGCACCGGGCCTCCGACGG 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCGCACCGGGCCTCCGACGG 740
Query 669 GAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGCGTGTGTTCG 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGCGTGTGTTCG 814
Query 743 TGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGATACGGGAAG 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGATACGGGAAG 888
Query 817 GACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATACACATCTGTT 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATACACATCTGTT 962
Query 891 CTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCCAAGATTTAA 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCCAAGATTTAA 1036
Query 965 GCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGCAGCCAACCTGTGCCTGGGCTCTGGCGTG 1038
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGGAGCCAACCTGTGCCTGGGCTCTGGCGTG 1110
Query 1039 CACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAATACCTACAA 1112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAATACCTACAA 1184
Query 1113 GAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGCTGGAAGCTC 1186
|||||||||||||
Sbjct 1185 GAACAACGTTGGT------------------------------------------------------------- 1197
Query 1187 TCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGTGTCAATGTG 1260
Sbjct 1198 -------------------------------------------------------------------------- 1197
Query 1261 CTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGTGTTTCCTAT 1334
Sbjct 1198 -------------------------------------------------------------------------- 1197
Query 1335 TGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGATTCGGCAGAA 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1198 ----------------------------GGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGATTCGGCAGAA 1243
Query 1409 AAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATGCCTTTCTGG 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 AAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATGCCTTTCTGG 1317
Query 1483 CGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATTTA 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 CGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATTTA 1377