Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10871
• Subject: XM_006526700.3
• Aligned Length: 1431
• Identities: 934
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGTGCCGGCTAATCAGGGAGTTAAAACGGTTCAATGCTGATAACAAACTTCTTTTGACTGGTACTCCCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCAAAACAATTTATCAGAACTTTGGTCATTGCTAAACTTTTTGTTGCCAGATGTATTTGATGACTTGAAAAGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TTGAGTCTTGGTTTGATATCACTAGTCTTTCTGAAACTGCTGAAGATATTATAGCTAAAGAGAGAGAACAGAAT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GTTTTACATATGCTGCACCAGATTTTAACGCCTTTCCTACTGAGAAGACTGAAGTCTGATGTTGCTCTTGAAGT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CCCCCCTAAGCGAGAAGTAGTTGTTTATGCACCACTTTGCAATAAACAAGAGATCTTCTATACAGCTATTGTGA  370

Query    1  -----------------ATGTTTGGATCCAGTGAGAAAGAAACAATTGAGTTAAGTCCTACTGGTCGACCAAAA  57
                             ||||||||||||.|||||||.||||||.|||||.|||||||||||||..||||||||
Sbjct  371  ACCGCACAATTGCAAACATGTTTGGATCCTGTGAGAAGGAAACAGTTGAGCTAAGTCCTACTGGAAGACCAAAA  444

Query   58  CGACGAACTAGAAAATCAATAAATTACAGCAAAATAGATGATTTCCCTAATGAATTGGAAAAACTGATCAGTCA  131
            |||||||.||||||.|||||||||||||||.||.|||||.|.|||||||.||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  445  CGACGAAGTAGAAAGTCAATAAATTACAGCGAACTAGATCAGTTCCCTAGTGAATTAGAAAAACTAATAAGTCA  518

Query  132  AATACAGCCAGAGGTGGACCGAGAAAGAGCTGTTGTGGAAGTGAATATCCCTGTAGAATCTGAAGTTAATCTGA  205
            ||||||||||||.||..||.||||.||..||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATACAGCCAGAAGTAAACAGAGAGAGGACTGTTGTGGAAGGTAATATCCCTATAGAATCTGAAGTTAATCTGA  592

Query  206  AGCTGCAGAATATAATGATGCTACTTCGTAAATGTTGTAATCATCCATATTTGATTGAATATCCTATAGACCCT  279
            ||||||.|||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct  593  AGCTGCGGAATATAATGATGCTACTTCGAAAGTGCTGTAATCACCCATATATGATTGAATATCCTATTGACCCT  666

Query  280  GTTACACAAGAATTTAAGATCGATGAAGAATTGGTAACAAATTCTGGGAAGTTCTTGATTTTGGATCGAATGCT  353
            ||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCACACAAGAATTTAAGATTGATGAAGAGTTGGTAACAAATTCTGGGAAGTTCTTAATTTTGGATCGAATGCT  740

Query  354  GCCAGAACTAAAAAAAAGAGGTCACAAGGTGCTGCTTTTTTCACAAATGACAAGCATGTTGGACATTTTGATGG  427
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  GCCCGAACTTAAAAAAAGAGGTCACAAGGTTCTGGTGTTTTCACAAATGACAAGCATGTTGGACATCTTGATGG  814

Query  428  ATTACTGCCATCTCAGAGATTTCAACTTCAGCAGGCTTGATGGGTCCATGTCTTACTCAGAGAGAGAAAAAAAC  501
            ||||.||||||||.|||.|.||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  815  ATTATTGCCATCTTAGAAACTTCATCTTTAGCAGACTTGATGGGTCCATGTCTTATTCGGAAAGAGAAAAAAAT  888

Query  502  ATGCACAGCTTCAACACGGATCCAGAGGTGTTTATCTTCTTAGTGAGTACACGAGCTGGTGGCCTGGGCATTAA  575
            ||..||||.|||||||||||||||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||
Sbjct  889  ATATACAGTTTCAACACGGATCCAGATGTTTTTCTTTTCTTAGTGAGTACACGAGCTGGTGGTTTAGGCATAAA  962

Query  576  TCTGACTGCAGCAGATACAGTTATCATTTATGATAGTGATTGGAACCCCCAGTCGGATCTTCAGGCCCAGGATA  649
            ..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct  963  CTTGACTGCAGCAGATACAGTGATCATTTATGACAGTGATTGGAATCCTCAGTCTGATCTCCAGGCTCAAGATA  1036

Query  650  GATGTCATAGAATTGGTCAGACAAAGCCAGTTGTTGTTTATCGCCTTGTTACAGCAAATACTATCGATCAGAAA  723
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1037  GATGTCATAGAATTGGTCAGACAAAGCCAGTTGTTGTGTATCGTCTTGTAACAGCAAATACTATTGACCAGAAA  1110

Query  724  ATTGTGGAAAGAGCAGCTGCTAAAAGGAAACTGGAAAAGTTGATCATCCATAAAAATCATTTCAAAGGTGGTCA  797
            ||||||||||||||||||||||||||.||..||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTGTGGAAAGAGCAGCTGCTAAAAGAAAGTTGGAGAAGTTGATAATCCATAAAAATCATTTCAAAGGTGGTCA  1184

Query  798  GTCTGGATTAAATCTGTCTAAGAATTTCTTAGATCCTAAGGAATTAATGGAATTATTAAAATCTAGAGATTATG  871
            ||||||.||||.||..||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCTGGGTTAAGTCAATCTAAGAATTTCTTAGATGCAAAGGAATTAATGGAGTTATTAAAATCTAGAGATTATG  1258

Query  872  AAAGGGAAATAAAAGGATCAAGAGAGAAGGTCATTAGTGATAAAGATCTAGAGTTGTTGTTAGATCGAAGTGAT  945
            ||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||..||||.||||||||||||
Sbjct 1259  AAAGGGAAGTAAAAGGATCCAGAGAGAAGGTCATTAGTGACGAAGATCTAGAATTACTGTTGGATCGAAGTGAT  1332

Query  946  CTTATTGATCAAATGAATGCTTCAGGACCAATTAAAGAGAAGATGGGGATATTCAAGATATTAGAAAATTCTGA  1019
            ||.||||||||||||||.||||||.||||||||||||.|||||..|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 1333  CTCATTGATCAAATGAAGGCTTCAAGACCAATTAAAGGGAAGACAGGGATATTCAAAATACTAGAAAATTCTGA  1406

Query 1020  AGATTCCAGTCCTGAATGTTTGTTT  1044
            ||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 1407  AGATTCCAGTGCTGAATGTTTATTT  1431