Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10873
• Subject: NM_001243042.1
• Aligned Length: 1105
• Identities: 976
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCATGGCGCCCCGAACCCTCGTCCTGCTACTCTCGGGGGCCCTGGCCCTGACCCAGACCTGGGCGGG  74
            |||...|||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||||||||..|
Sbjct    1  ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGGCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG  74

Query   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCTCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCGCCGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||
Sbjct   75  CTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG  148

Query  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAG--CCAGAGGATGGAGCCGCGGGCGC  220
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |.|||||  ||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGG--GGAGCCGCGGGCGC  220

Query  221  CGTGGATAGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGAACACACGGAATGTGAAGGCCCACTCACAGACTGAC  294
            |||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||.|||....|||..|||..|||||.|||||
Sbjct  221  CGTGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAACTACAAGCGCCAGGCACAGGCTGAC  294

Query  295  CGAGAGAGCCTGCGGATCGCGCTCCGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGTTCTCACACCATCCAGAGGATGTA  368
            ||||.|||||||||||.|..||.|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct  295  CGAGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTA  368

Query  369  TGGCTGCGACGTGGGGCCGGACGGGCGCTTCCTCCGCGGGTACCAGCAGGACGCTTACGACGGCAAGGATTACA  442
            ||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||..|.|||..|||.|||||||||||||||||||
Sbjct  369  TGGCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACA  442

Query  443  TCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCTTGGACCGCGGCGGACATGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAG  516
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  443  TCGCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTTGGAG  516

Query  517  ACGGCCCATGAGGCGGAGCAGTGGAGAGCCTACCTGGAGGGCCGGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGA  590
            .||||||.||.||||||||||..|||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GCGGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGA  590

Query  591  GAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCACGGACGCCCCCAAGACGCATATGACTCACCACGCTGTCTCTGACCATG  664
            |||||||||||||||||||||||||.|.||..||||.|||||.||..||||.||||||.|..||||||||||||
Sbjct  591  GAACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCTGACCATG  664

Query  665  AGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGAGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAG  738
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  AGGCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAG  738

Query  739  GACCAGACCCAGGACACGGAGCTCGTGGAGACCAGGCCTGCAGGGGATGGGACCTTCCAGAAGTGGGCGTCTGT  812
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||..||||
Sbjct  739  GACCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGT  812

Query  813  GGTGGTGCCTTCTGGACAGGAGCAGAGATACACCTGCCATGTGCAGCATGAGGGTCTGCCCAAGCCCCTCACCC  886
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||||...||||||||||||
Sbjct  813  GGTGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCCCTCACCC  886

Query  887  TGAGATGGGAGCCGTCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCGTGGGCATCATTGCTGGCCTGGTTCTCTTTGG----  956
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.|| .|||    
Sbjct  887  TGAGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTC-CTGGTTGT  959

Query  957  ---AGCTGTGATCGCTGGAGCTGTGGTCGCTGCTGTGATGTGGAGGAGGAAGAGCTCAGATAGAAAAGGAGGGA  1027
               |||||   ||..|||||||||||||.|.|||.|||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct  960  CCTAGCTG---TCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGA  1030

Query 1028  GCTACTCTCAGGCTGCAAGCAGTGACAGTGCCCAGGGCTCTGATATGTCTCTCA-CAGCTTGTAAAGTG  1095
            |||.||||||||||||..||||..||||||||||||||||||||..|||||||| || |||||||||..
Sbjct 1031  GCTGCTCTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCA-CTTGTAAAGCC  1098