Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10874
- Subject:
- NM_002117.6
- Aligned Length:
- 1102
- Identities:
- 1010
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGCGGGTCACGGCGCCCCGAACCGTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGCCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCGG 74
||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGCGGGTCATGGCGCCCCGAGCCCTCCTCCTGCTGCTCTCGGGAGGCCTGGCCCTGACCGAGACCTGGGCCTG 74
Query 75 CTCCCACTCCATGAGGTATTTCTACACCGCCATGTCCCGGCCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG 148
||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTCCCACTCCATGAGGTATTTCGACACCGCCGTGTCCCGGCCCGGCCGCGGAGAGCCCCGCTTCATCTCAGTGG 148
Query 149 GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGAGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGAGGAGCCGCGGGCGCCG 222
||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTACGTGGACGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCGAGAGGGGAGCCGCGGGCGCCG 222
Query 223 TGGATAGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGAACACACAGATCTGCAAGACCAACACACAGACTTACCG 296
|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||..|.||||..|.|..|||||.||.||||
Sbjct 223 TGGGTGGAGCAGGAGGGGCCGGAGTATTGGGACCGGGAGACACAGAAGTACAAGCGCCAGGCACAGGCTGACCG 296
Query 297 AGAGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGCCGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTACG 370
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 297 AGTGAGCCTGCGGAACCTGCGCGGCTACTACAACCAGAGCGAGGACGGGTCTCACACCCTCCAGAGGATGTCTG 370
Query 371 GCTGCGACGTGGGGCCGGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGCATGACCAGTACGCCTACGACGGCAAGGATTACATC 444
||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTGCGACCTGGGGCCCGACGGGCGCCTCCTCCGCGGGTATGACCAGTCCGCCTACGACGGCAAGGATTACATC 444
Query 445 GCCCTGAACGAGGACCTGAGCTCCTGGACCGCGGCGGACACGGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTGGGAGGC 518
||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 445 GCCCTGAACGAGGACCTGCGCTCCTGGACCGCCGCGGACACCGCGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTTGGAGGC 518
Query 519 GGCCCGTGAGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCCTGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA 592
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCCCGTGCGGCGGAGCAGCTGAGAGCCTACCTGGAGGGCACGTGCGTGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGA 592
Query 593 ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCGGACCCCCCAAAGACACATGTGACCCACCACCCCATCTCTGACCATGAG 666
|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 593 ACGGGAAGGAGACGCTGCAGCGCGCAGAACCCCCAAAGACACACGTGACCCACCACCCCCTCTCTGACCATGAG 666
Query 667 GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGCGAGGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 GCCACCCTGAGGTGCTGGGCCCTGGGCTTCTACCCTGCGGAGATCACACTGACCTGGCAGCGGGATGGGGAGGA 740
Query 741 CCAAACTCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGACCAGCAGGAGATAGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG 814
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCAGACCCAGGACACCGAGCTTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGAACCTTCCAGAAGTGGGCAGCTGTGG 814
Query 815 TGGTGCCTTCTGGAGAAGAGCAGAGATACACATGCCATGTACAGCATGAGGGGCTGCCGAAGCCCCTCACCCTG 888
||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||...||||||||||||||
Sbjct 815 TGGTGCCTTCTGGACAAGAGCAGAGATACACGTGCCATATGCAGCACGAGGGGCTGCAAGAGCCCCTCACCCTG 888
Query 889 AGATGGGAGCCATCTTCCCAGTCCACCATCCCCATCGTGGGCATTGTTGCTGGCCTGGCTGTCCTAGCAGTTGT 962
||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||| .|||||
Sbjct 889 AGCTGGGAGCCATCTTCCCAGCCCACCATCCCCATCATGGGCATCGTTGCTGGCCTGGCTGTCCT---GGTTGT 959
Query 963 ------GGTCATCGGAGCTGTGGTCGCTACTGTGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCT 1030
.|||.|.||||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CCTAGCTGTCCTTGGAGCTGTGGTCACCGCTATGATGTGTAGGAGGAAGAGCTCAGGTGGAAAAGGAGGGAGCT 1033
Query 1031 ACTCTCAGGCTGCGTCCAGCGACAGTGCCCAGGGCTCTGATGTGTCTCTCA-CAGCT--------- 1086
.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||| || ||
Sbjct 1034 GCTCTCAGGCTGCGTGCAGCAACAGTGCCCAGGGCTCTGATGAGTCTCTCATCA-CTTGTAAAGCC 1098