Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10950
• Subject: NM_001174146.2
• Aligned Length: 1218
• Identities: 1114
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGTT  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGGATATAGCAACAGGTCCCGAGTCGCTGGAGAGGTGCTTCCCTCGCGGGCAGACGGACTGCGCCAAGATGTT  74

Query    6  GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT  148

Query   80  GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG  222

Query  154  TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG  296

Query  228  GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC  370

Query  302  CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAGCGG  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAACGG  444

Query  376  CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA  518

Query  450  GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC  592

Query  524  CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC  666

Query  598  CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCCAAGCCTTGCCGAAA  671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCGAAGCCTTGCCGAAA  740

Query  672  GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG  814

Query  746  CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGG------------  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  815  CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGGCTGGGCCAGGGT  888

Query  808  ---------------------CTGGGCCAGGAGGTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACAC  860
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGCCGGGGCCGGGGCAGGGCCTGGGCCAGGAGGTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACAC  962

Query  861  GCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGCCATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGC  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGCCATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGC  1036

Query  935  AGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCAGGGAACGACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACC  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCAGGGAACGACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACC  1110

Query 1009  AGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCCTCAGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCG  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCCTCAGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCG  1184

Query 1083  GCTCTACTCCATGCAGAGTTCCTACTTCGCCTCC  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTCTACTCCATGCAGAGTTCCTACTTCGCCTCC  1218