Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_10950
Subject:
NM_002316.4
Aligned Length:
1185
Identities:
1114
Gaps:
69

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------------ATGTT  5
                                                                                 |||||
Sbjct    1  ATGGATATAGCAACAGGTCCCGAGTCGCTGGAGAGGTGCTTCCCTCGCGGGCAGACGGACTGCGCCAAGATGTT  74

Query    6  GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT  79
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGGTGCTGCTGGGCTCCGACT  148

Query   80  GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG  153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTGATGCGAGTCAACGAGTCG  222

Query  154  TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG  227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAGCTGCTACTTCCGGGATCG  296

Query  228  GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC  301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCTGCATGGAGAAGATCGCCC  370

Query  302  CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAGCGG  375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGCTGCTGCGTGTGTGAACGG  444

Query  376  CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA  449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGGTGACTACGAGAAGGAGAA  518

Query  450  GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC  523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATGAAGATGGGGACATGAAGC  592

Query  524  CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC  597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCGCGGAGGCCCAAGCGACCC  666

Query  598  CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCCAAGCCTTGCCGAAA  671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  CGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTCGTCGAAGCCTTGCCGAAA  740

Query  672  GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG  745
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCTGGTTTCAGAACCAAAGAG  814

Query  746  CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGGCTGGGCCAGGAG  819
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCCCAGCGGCTGGGCCAGGAG  888

Query  820  GTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACACGCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGC  893
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACACGCCGCTGGCCCCACCACAGCAGCAGATCGTGGC  962

Query  894  CATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGCAGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCAGGGAACG  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGCAGGGCCTCACGCCGCCCCAAATGCCAGGGAACG  1036

Query  968  ACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACCAGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCCTCAGAC  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCCTTAACCAGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCCTCAGAC  1110

Query 1042  GTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCGGCTCTACTCCATGCAGAGTTCCTACTTCGCCTC  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCATCGACCGGCTCTACTCCATGCAGAGTTCCTACTTCGCCTC  1184

Query 1116  C  1116
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Sbjct 1185  C  1185