Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10950
• Subject: XM_006497746.3
• Aligned Length: 1224
• Identities: 1044
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATATAGCAACAGGTCCCGAGTCGCTGGAGAGGTGCTTCCCTCGCGGGCAGACGGACTGCGCCAAGATGTT  74

Query    1  -------------ATGTTGGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTGCGCCCCGGGCCCGCCACTCTGGGGG  61
                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GGACGGCATCAAGATGTTGGACGGCATCAAGATGGAGGAGCACGCCCTTCGCCCCGGGCCCGCCACCCTGGGGG  148

Query   62  TGCTGCTGGGCTCCGACTGCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTG  135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCTGCTGGGCTCCGACTGCCCGCATCCCGCCGTCTGCGAGGGCTGCCAGCGGCCCATCTCCGACCGCTTCCTG  222

Query  136  ATGCGAGTCAACGAGTCGTCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCGTGTCAGCAAGCCCTCACCACCAG  209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCGAGTCAACGAGTCGTCCTGGCACGAGGAGTGTTTGCAGTGCGCGGCATGTCAGCAAGCCCTCACCACCAG  296

Query  210  CTGCTACTTCCGGGATCGGAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCCAAGTGCAGCGGCT  283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CTGCTACTTCCGGGATCGGAAACTGTACTGCAAACAAGACTACCAACAGCTCTTCGCGGCAAAGTGCAGCGGCT  370

Query  284  GCATGGAGAAGATCGCCCCCACCGAGTTCGTGATGCGGGCGCTGGAGTGCGTGTACCACCTGGGCTGCTTCTGC  357
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||
Sbjct  371  GCATGGAGAAGATCGCCCCTACCGAGTTCGTCATGCGGGCGCTGGAGTGTGTGTACCACTTGGGCTGTTTCTGC  444

Query  358  TGCTGCGTGTGTGAGCGGCAGCTACGCAAGGGCGACGAATTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGG  431
            |||||.|||||.|||.||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTGTGTGTGCGAGAGGCAACTGCGCAAGGGGGACGAGTTCGTGCTCAAGGAGGGCCAGCTGCTGTGCAAGGG  518

Query  432  TGACTACGAGAAGGAGAAGGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCCGACGAGTCCGACTCCGTGAAGAGCGAGGATG  505
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  519  TGACTATGAGAAGGAGAAAGACCTGCTCAGCTCCGTGAGCCCGGACGAGTCTGACTCTGTGAAGAGTGAGGATG  592

Query  506  AAGATGGGGACATGAAGCCGGCCAAGGGGCAGGGCAGTCAGAGCAAGGGCAGCGGGGATGACGGGAAGGACCCG  579
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  AAGATGGAGACATGAAGCCGGCCAAGGGGCAGGGCAGCCAGAGTAAAGGCAGTGGAGATGACGGGAAAGACCCG  666

Query  580  CGGAGGCCCAAGCGACCCCGGACCATCCTCACCACGCAGCAGCGAAGAGCCTTCAAGGCCTCCTTCGAGGTCTC  653
            .|.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  667  AGAAGGCCCAAACGGCCCCGAACCATCCTCACCACACAGCAGCGAAGAGCTTTCAAGGCATCCTTTGAGGTCTC  740

Query  654  GTCCAAGCCTTGCCGAAAGGTCCGAGAGACACTGGCAGCTGAGACGGGCCTCAGTGTGCGCGTGGTCCAGGTCT  727
            .||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAAGCCCTGTCGGAAGGTCCGAGAGACATTGGCAGCAGAGACAGGCCTCAGCGTGCGTGTGGTCCAGGTCT  814

Query  728  GGTTTCAGAACCAAAGAGCAAAGATGAAGAAGCTGGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGGAGCAGCAGAACTCC  801
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTTTCAGAACCAAAGAGCAAAGATGAAGAAGCTGGCCCGGAGACACCAGCAACAGCAGGAGCAGCAGAACTCC  888

Query  802  CAGCGGCTGGGCCAGGAGGTCCTGTCCAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCTTCCTACACGCCGCTGGCCCCACC  875
            ||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CAGCGGCTGGGCCAAGAGGTTCTGTCAAGCCGCATGGAGGGCATGATGGCCTCCTACACGCCGCTGGCCCCTCC  962

Query  876  ACAGCAGCAGATCGTGGCCATGGAACAGAGCCCCTACGGCAGCAGCGACCCCTTCCAGCAGGGCCTCACGCCGC  949
            .|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGCAGCAGATCGTGGCCATGGAGCAGAGCCCCTACGGAAGTAGCGACCCCTTCCAACAGGGCCTCACGCCGC  1036

Query  950  CCCAAATGCCA---------------------GGGAACGACTCCATCTTCCATGACATCGACAGCGATACCTCC  1002
            |||||||||||                     ||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1037  CCCAAATGCCAGGTGACCACATGAACCCCTATGGGAACGACTCCATCTTCCACGATATCGATAGTGATACCTCC  1110

Query 1003  TTAACCAGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCCTCAGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCAT  1076
            .|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCACCAGCCTCAGCGACTGCTTCCTCGGCTCTTCCGACGTGGGCTCCCTGCAGGCCCGCGTGGGGAACCCCAT  1184

Query 1077  CGACCGGCTCTACTCCATGCAGAGTTCCTACTTCGCCTCC  1116
            .|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1185  TGACCGGCTCTACTCCATGCAGAGCTCCTACTTTGCCTCC  1224