Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10959
• Subject: XM_017017756.1
• Aligned Length: 1584
• Identities: 1452
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAATGAATTCAGGGCATGGACGGACATCAAGCCTGTGAAACCAATAAAGGCCAAGCCCCAGTACAAGCCCCC  74

Query    1  ----------ATGGTTCATGAGACCAGCTACAGTGCTCAGTTCAAAGGAGAGGCCAGCAAGCCAACAACAGCTG  64
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGATGATAAGATGGTTCATGAGACCAGCTACAGTGCTCAGTTCAAAGGAGAGGCCAGCAAGCCAACAACAGCTG  148

Query   65  ACAATAAGGTCATTGATCGCAGAAGAATACGCAGCCTCTACAGCGAACCCTTCAAGGAACCCCCAAA-------  131
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  149  ACAATAAGGTCATTGATCGCAGAAGAATACGCAGCCTCTACAGCGAACCCTTCAAGGAACCCCCAAAGTCTTGC  222

Query  132  -----------------------------------------GGTGGAAAAACCTAGTGTTCAGAGTTCCAAACC  164
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTTCAGTGGAGTTTCCTATTTGGCCCAGGACCAGTTTATGGGTGGAAAAACCTAGTGTTCAGAGTTCCAAACC  296

Query  165  AAAAAAGACCTCAGCGAGCCATAAGCCCACGAGGAAGGCCAAAGACAAGCAGGCGGTGTCAGGCCAGGCTGCCA  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAAAAGACCTCAGCGAGCCATAAGCCCACGAGGAAGGCCAAAGACAAGCAGGCGGTGTCAGGCCAGGCTGCCA  370

Query  239  AGAAAAAGAGCGCGGAGGGCCCGAGTACCACCAAGCCAGACGACAAGGAGCAAAGCAAAGAGATGAACAATAAA  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAAAAGAGCGCGGAGGGCCCGAGTACCACCAAGCCAGACGACAAGGAGCAAAGCAAAGAGATGAACAATAAA  444

Query  313  CTGGCTGAGGCGAAAGAGAGCCTGGCTCAACCCGTCAGTGATTCAAGTAAGACTCAAGGTCCTGTAGCCACAGA  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGCTGAGGCGAAAGAGAGCCTGGCTCAACCCGTCAGTGATTCAAGTAAGACTCAAGGTCCTGTAGCCACAGA  518

Query  387  GCCAGACAAGGATCAAGGTTCTGTGGTCCCAGGCCTTCTGAAAGGTCAAGGTCCTATGGTGCAAGAGCCTCTGA  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCAGACAAGGATCAAGGTTCTGTGGTCCCAGGCCTTCTGAAAGGTCAAGGTCCTATGGTGCAAGAGCCTCTGA  592

Query  461  AGAAGCAAGGTTCTGTGGTCCCAGGGCCTCCAAAGGATCTAGGTCCCATGATCCCATTACCAGTCAAGGATCAA  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGCAAGGTTCTGTGGTCCCAGGGCCTCCAAAGGATCTAGGTCCCATGATCCCATTACCAGTCAAGGATCAA  666

Query  535  GATCACACGGTCCCTGAGCCTTTAAAGAATGAAAGCCCTGTTATCTCAGCACCAGTCAAGGACCAAGGTCCCTC  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCACACGGTCCCTGAGCCTTTAAAGAATGAAAGCCCTGTTATCTCAGCACCAGTCAAGGACCAAGGTCCCTC  740

Query  609  GGTCCCAGTTCCTCCAAAGAATCAAAGTCCTATGGTTCCAGCAAAAGTTAAGGATCAAGGCTCTGTGGTACCAG  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTCCCAGTTCCTCCAAAGAATCAAAGTCCTATGGTTCCAGCAAAAGTTAAGGATCAAGGCTCTGTGGTACCAG  814

Query  683  AGTCTCTAAAGGATCAAGGTCCTAGGATTCCTGAGCCTGTGAAGAATCAAGCTCCTATGGTCCCAGCACCTGTC  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTCTCTAAAGGATCAAGGTCCTAGGATTCCTGAGCCTGTGAAGAATCAAGCTCCTATGGTCCCAGCACCTGTC  888

Query  757  AAGGATGAAGGTCCCATGGTCTCAGCATCTGTCAAGGATCAAGGTCCCATGGTCTCAGCACCTGTCAAGGATCA  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGATGAAGGTCCCATGGTCTCAGCATCTGTCAAGGATCAAGGTCCCATGGTCTCAGCACCTGTCAAGGATCA  962

Query  831  AGGTCCCATAGTCCCAGCACCTGTCAAGGGTGAAGGTCCCATAGTCCCAGCACCTGTCAAGGATGAAGGTCCCA  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGTCCCATAGTCCCAGCACCTGTCAAGGGTGAAGGTCCCATAGTCCCAGCACCTGTCAAGGATGAAGGTCCCA  1036

Query  905  TGGTCTCAGCACCTATCAAGGATCAAGATCCCATGGTCCCAGAGCATCCGAAGGATGAAAGTGCCATGGCCACA  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGTCTCAGCACCTATCAAGGATCAAGATCCCATGGTCCCAGAGCATCCGAAGGATGAAAGTGCCATGGCCACA  1110

Query  979  GCACCCATAAAGAATCAAGGTTCCATGGTCTCTGAGCCTGTAAAGAATCAAGGTTTAGTGGTCTCAGGGCCAGT  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACCCATAAAGAATCAAGGTTCCATGGTCTCTGAGCCTGTAAAGAATCAAGGTTTAGTGGTCTCAGGGCCAGT  1184

Query 1053  CAAGGATCAAGATGTTGTAGTCCCAGAGCATGCAAAGGTTCACGATTCTGCAGTTGTGGCACCTGTAAAGAATC  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGGATCAAGATGTTGTAGTCCCAGAGCATGCAAAGGTTCACGATTCTGCAGTTGTGGCACCTGTAAAGAATC  1258

Query 1127  AAGGTCCTGTGGTCCCCGAGTCCGTGAAGAATCAAGACCCCATTCTCCCAGTACTAGTTAAGGATCAAGGCCCC  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGGTCCTGTGGTCCCCGAGTCCGTGAAGAATCAAGACCCCATTCTCCCAGTACTAGTTAAGGATCAAGGCCCC  1332

Query 1201  ACAGTCCTACAGCCTCCAAAGAATCAAGGTCGTATAGTCCCTGAACCTCTGAAGAATCAAGTTCCTATAGTCCC  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACAGTCCTACAGCCTCCAAAGAATCAAGGTCGTATAGTCCCTGAACCTCTGAAGAATCAAGTTCCTATAGTCCC  1406

Query 1275  AGTGCCTCTGAAGGATCAAGATCCTCTGGTGCCAGTACCAGCAAAGGACCAAGGTCCTGCAGTCCCTGAACCTC  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTGCCTCTGAAGGATCAAGATCCTCTGGTGCCAGTACCAGCAAAGGACCAAGGTCCTGCAGTCCCTGAACCTC  1480

Query 1349  TGAAGACTCAAGGTCCCAGGGACCCTCAGCTACCTACTGTCTCACCTCTACCCCGAGTCATGATCCCAACTGCC  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAAGACTCAAGGTCCCAGGGACCCTCAGCTACCTACTGTCTCACCTCTACCCCGAGTCATGATCCCAACTGCC  1554

Query 1423  CCCCATACGGAATACATTGAGAGCTCCCCT  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCCATACGGAATACATTGAGAGCTCCCCT  1584