Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10959
• Subject: XM_017017758.1
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1452
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGGTTCATGAGACCAGCTACAGTGCTCAGTTCAAAGGAGAGGCCAGCAAGCCAACAACAGCTGACAATAAGGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTCATGAGACCAGCTACAGTGCTCAGTTCAAAGGAGAGGCCAGCAAGCCAACAACAGCTGACAATAAGGT  74

Query   75  CATTGATCGCAGAAGAATACGCAGCCTCTACAGCGAACCCTTCAAGGAACCCCCAAA-----------------  131
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct   75  CATTGATCGCAGAAGAATACGCAGCCTCTACAGCGAACCCTTCAAGGAACCCCCAAAGTCTTGCACTTCAGTGG  148

Query  132  -------------------------------GGTGGAAAAACCTAGTGTTCAGAGTTCCAAACCAAAAAAGACC  174
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGTTTCCTATTTGGCCCAGGACCAGTTTATGGGTGGAAAAACCTAGTGTTCAGAGTTCCAAACCAAAAAAGACC  222

Query  175  TCAGCGAGCCATAAGCCCACGAGGAAGGCCAAAGACAAGCAGGCGGTGTCAGGCCAGGCTGCCAAGAAAAAGAG  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGCGAGCCATAAGCCCACGAGGAAGGCCAAAGACAAGCAGGCGGTGTCAGGCCAGGCTGCCAAGAAAAAGAG  296

Query  249  CGCGGAGGGCCCGAGTACCACCAAGCCAGACGACAAGGAGCAAAGCAAAGAGATGAACAATAAACTGGCTGAGG  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCGGAGGGCCCGAGTACCACCAAGCCAGACGACAAGGAGCAAAGCAAAGAGATGAACAATAAACTGGCTGAGG  370

Query  323  CGAAAGAGAGCCTGGCTCAACCCGTCAGTGATTCAAGTAAGACTCAAGGTCCTGTAGCCACAGAGCCAGACAAG  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGAAAGAGAGCCTGGCTCAACCCGTCAGTGATTCAAGTAAGACTCAAGGTCCTGTAGCCACAGAGCCAGACAAG  444

Query  397  GATCAAGGTTCTGTGGTCCCAGGCCTTCTGAAAGGTCAAGGTCCTATGGTGCAAGAGCCTCTGAAGAAGCAAGG  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCAAGGTTCTGTGGTCCCAGGCCTTCTGAAAGGTCAAGGTCCTATGGTGCAAGAGCCTCTGAAGAAGCAAGG  518

Query  471  TTCTGTGGTCCCAGGGCCTCCAAAGGATCTAGGTCCCATGATCCCATTACCAGTCAAGGATCAAGATCACACGG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCTGTGGTCCCAGGGCCTCCAAAGGATCTAGGTCCCATGATCCCATTACCAGTCAAGGATCAAGATCACACGG  592

Query  545  TCCCTGAGCCTTTAAAGAATGAAAGCCCTGTTATCTCAGCACCAGTCAAGGACCAAGGTCCCTCGGTCCCAGTT  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCCTGAGCCTTTAAAGAATGAAAGCCCTGTTATCTCAGCACCAGTCAAGGACCAAGGTCCCTCGGTCCCAGTT  666

Query  619  CCTCCAAAGAATCAAAGTCCTATGGTTCCAGCAAAAGTTAAGGATCAAGGCTCTGTGGTACCAGAGTCTCTAAA  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCTCCAAAGAATCAAAGTCCTATGGTTCCAGCAAAAGTTAAGGATCAAGGCTCTGTGGTACCAGAGTCTCTAAA  740

Query  693  GGATCAAGGTCCTAGGATTCCTGAGCCTGTGAAGAATCAAGCTCCTATGGTCCCAGCACCTGTCAAGGATGAAG  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATCAAGGTCCTAGGATTCCTGAGCCTGTGAAGAATCAAGCTCCTATGGTCCCAGCACCTGTCAAGGATGAAG  814

Query  767  GTCCCATGGTCTCAGCATCTGTCAAGGATCAAGGTCCCATGGTCTCAGCACCTGTCAAGGATCAAGGTCCCATA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCCCATGGTCTCAGCATCTGTCAAGGATCAAGGTCCCATGGTCTCAGCACCTGTCAAGGATCAAGGTCCCATA  888

Query  841  GTCCCAGCACCTGTCAAGGGTGAAGGTCCCATAGTCCCAGCACCTGTCAAGGATGAAGGTCCCATGGTCTCAGC  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCCCAGCACCTGTCAAGGGTGAAGGTCCCATAGTCCCAGCACCTGTCAAGGATGAAGGTCCCATGGTCTCAGC  962

Query  915  ACCTATCAAGGATCAAGATCCCATGGTCCCAGAGCATCCGAAGGATGAAAGTGCCATGGCCACAGCACCCATAA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCTATCAAGGATCAAGATCCCATGGTCCCAGAGCATCCGAAGGATGAAAGTGCCATGGCCACAGCACCCATAA  1036

Query  989  AGAATCAAGGTTCCATGGTCTCTGAGCCTGTAAAGAATCAAGGTTTAGTGGTCTCAGGGCCAGTCAAGGATCAA  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATCAAGGTTCCATGGTCTCTGAGCCTGTAAAGAATCAAGGTTTAGTGGTCTCAGGGCCAGTCAAGGATCAA  1110

Query 1063  GATGTTGTAGTCCCAGAGCATGCAAAGGTTCACGATTCTGCAGTTGTGGCACCTGTAAAGAATCAAGGTCCTGT  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATGTTGTAGTCCCAGAGCATGCAAAGGTTCACGATTCTGCAGTTGTGGCACCTGTAAAGAATCAAGGTCCTGT  1184

Query 1137  GGTCCCCGAGTCCGTGAAGAATCAAGACCCCATTCTCCCAGTACTAGTTAAGGATCAAGGCCCCACAGTCCTAC  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTCCCCGAGTCCGTGAAGAATCAAGACCCCATTCTCCCAGTACTAGTTAAGGATCAAGGCCCCACAGTCCTAC  1258

Query 1211  AGCCTCCAAAGAATCAAGGTCGTATAGTCCCTGAACCTCTGAAGAATCAAGTTCCTATAGTCCCAGTGCCTCTG  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCTCCAAAGAATCAAGGTCGTATAGTCCCTGAACCTCTGAAGAATCAAGTTCCTATAGTCCCAGTGCCTCTG  1332

Query 1285  AAGGATCAAGATCCTCTGGTGCCAGTACCAGCAAAGGACCAAGGTCCTGCAGTCCCTGAACCTCTGAAGACTCA  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGATCAAGATCCTCTGGTGCCAGTACCAGCAAAGGACCAAGGTCCTGCAGTCCCTGAACCTCTGAAGACTCA  1406

Query 1359  AGGTCCCAGGGACCCTCAGCTACCTACTGTCTCACCTCTACCCCGAGTCATGATCCCAACTGCCCCCCATACGG  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGTCCCAGGGACCCTCAGCTACCTACTGTCTCACCTCTACCCCGAGTCATGATCCCAACTGCCCCCCATACGG  1480

Query 1433  AATACATTGAGAGCTCCCCT  1452
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AATACATTGAGAGCTCCCCT  1500