Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10962
- Subject:
- XM_006540685.3
- Aligned Length:
- 1528
- Identities:
- 1101
- Gaps:
- 302
Alignment
Query 1 ---------------------------------ATGGATGAAAGGAACCGACAG---ACTTTAAGAAA--GAAA 36
||||||||.|||||||||||| |||||.|.||| ||||
Sbjct 1 ATGGGGCGAAAGAAGATACAAATCACACGCATAATGGATGAGAGGAACCGACAGGTTACTTTTACAAAGCGAAA 74
Query 37 G------------------GCCTTAATG------GT------TGTG--------AGAGCCCTGAT--------- 63
| |||| ||| || |||| |.|||.||.||
Sbjct 75 GTTTGGATTGATGAAGAAAGCCT--ATGAACTCAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAA 146
Query 64 ------------GCTG-------ACG------ATTACTTTGAGCACAGTC-----------CACT--------- 92
|||| ||| .|.||.|.|| ||.|||| ||||
Sbjct 147 CAGCTCTAATAAGCTGTTTCAGTACGCTAGCACTGACATGGA-CAAAGTCCTTCTCAAATACACTGAGTATAAC 219
Query 93 -----------------------CTCG---------GAGG------------------ACAGA----------- 105
|||| |||| |||||
Sbjct 220 GAGCCTCATGAAAGCAGGACGAACTCGGATATCGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAACACAGAGGGTGCGACAG 293
Query 106 ---------------TTCA-----GCAAACT--AAAT---GAAGA---------------TAGTG----ATTTT 135
|||| ||.|||| |.|| ||||| ||.|| ||||.
Sbjct 294 CCCAGACCCTGATACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGAATTTG 367
Query 136 ATTTTCAA-ACGAGG--------------CCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGT 194
|| || |.||.| |.|.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 368 AT----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGCTTGCCACCTCAGAACTTCTCAATGTCTGTCACAGT 437
Query 195 TCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCA 268
.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 438 CCCTGTGACCAGCCCTAATGCTTTGTCGTACACTAACCCAGGGAGTTCACTCGTGTCACCGTCTTTGGCAGCCA 511
Query 269 GCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCT 342
|||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||.|.|.||||..||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 512 GCTCAACATTAGCAGATTCGAGCATGCTGTCTCCACCCCCAGCCACGCTACATAGAAATGTGTCCCCAGGAGCT 585
Query 343 CCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGC 416
||.|||||||||||||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 586 CCGCAGAGACCACCAAGTACCGGCAGTGCAAGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACGGTGCCAAATGGAGC 659
Query 417 TGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAA 490
|||||..|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 660 TGGAAATAGTCCTGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGGGCCTCTCCAAATTTGATTGGAAATACTGGTGCAA 733
Query 491 ATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGG 564
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||
Sbjct 734 ATAGTTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCGCCACCAGGTGGTGGCAGTCTTGGAATGAACAGTCGG 807
Query 565 AAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCAC------------------- 619
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 808 AAACCAGATCTACGAGTTGTCATTCCCCCATCAAGCAAGGGCATGATGCCCCCACTTTCGGAGGAAGAGGAATT 881
Query 620 -----TAAACACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAA 688
|.||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 882 GGAGTTGAATGCCCAAAGGATAAGCAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCCACGCCTGTAGTGTCTGTGACAA 955
Query 689 CCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACC 762
|.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 956 CTCCGAGCTTGCCTCCACAGGGACTAGTGTACTCAGCAATGCCGACAGCCTACAACACTGATTACTCACTGACC 1029
Query 763 AGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCA 836
||||||||||||||.|||||.||||||||.|..||.||.|||||||||||.|||||.||||..||.||||||||
Sbjct 1030 AGCGCTGACCTGTCTGCCCTGCAAGGCTTTACTTCCCCTGGAATGCTGTCTCTGGGGCAGGCTTCAGCCTGGCA 1103
Query 837 GCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTAT 910
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1104 GCAGCACCATCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTGGTGGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCAAATTTGT 1177
Query 911 CCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCG 984
|||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1178 CCATTAACACCAACCAGAACATCAACATTAAGTCAGAGCCAATTTCACCTCCCCGTGATAGAATGACCCCATCA 1251
Query 985 GGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCC 1058
||||||||.|||||||||||||| |||||.||.||||||.|.|||||||||.||
Sbjct 1252 GGCTTCCAACAGCAGCAGCAGCA---------------------GCCACAACAGCAGCCACCGCCACAACCTCC 1304
Query 1059 GCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATG 1132
.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1305 ACAGCCCCAACCCCGGCAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCCAGCAGCTCCTATGATG 1378
Query 1133 GCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGAC 1206
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1379 GCAGTGACCGGGAGGATCCACGGGGTGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCTCCAAATACTGAGGAC 1452
Query 1207 AGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC 1254
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1453 AGAGAAAGCCCTTCTGTAAAACGCATGAGGATGGACACATGGGTGACC 1500