Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10962
• Subject: XM_017022202.1
• Aligned Length: 1278
• Identities: 1072
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ATGGATGAAAGGAACCGACAGACTTTAAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGAGCCCTGATGCTGACGATTA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTTGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGATAGTGATTTTATTTTCAAACGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCC  222
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATGTCTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCC  42

Query  223  TACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   43  TACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCTTTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCT  116

Query  297  CTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  117  CTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTCTCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATG  190

Query  371  CAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  CAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGCCAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTT  264

Query  445  GTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  GTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCTACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAA  338

Query  519  GTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  GTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAATGAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCC  412

Query  593  CTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTA------------------------AACACCCAAAGGATCAGTAGT  642
            |||||||||||||||||||||||||||||                        ||.|||||.||||||||||||
Sbjct  413  CTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTATCGGAGGAAGAGGAATTGGAGTTGAATACCCAGAGGATCAGTAGT  486

Query  643  TCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGT  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  TCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTGTCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGT  560

Query  717  GTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCT  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  GTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTATTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCT  634

Query  791  TCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  TCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGTCGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTC  708

Query  865  AGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCAT  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  AGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGTTCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCAT  782

Query  939  CAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  CAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTATGACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC  856

Query 1013  AGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGG  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  AGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGCCACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGG  930

Query 1087  CGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGA  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  CGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGCTCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGA  1004

Query 1161  CTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGA  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005  CTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAACACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGA  1078

Query 1235  GGATGGACGCGTGGGTGACC  1254
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1079  GGATGGACGCGTGGGTGACC  1098