Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11015
• Subject: NM_013987.3
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1012
• Gaps: 432

Alignment

Query    1  ATGATAGTGTTTGTCAGGTTCAACTCCAGCCATGGTTTCCCAGTGGAGGTCGATTCTGACACCAGCATCTTCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAGTGTTTGTCAGGTTCAACTCCAGCCATGGTTTCCCAGTGGAGGTCGATTCTGACACCAGCATCTTCCA  74

Query   75  GCTCAAGGAGGTGGTTGCTAAGCGACAGGGGGTTCCGGCTGACCAGTTGCGTGTGATTTTCGCAGGGAAGGAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTCAAGGAGGTGGTTGCTAAGCGACAGGGGGTTCCGGCTGACCAGTTGCGTGTGATTTTCGCAGGGAAGGAGC  148

Query  149  TGAGGAATGACTGGACTGTGCAGAATTGTGACCTGGATCAGCAGAGCATTGTTCACATTGTGCAGAGACCGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAGGAATGACTGGACTGTGCAGAATTGTGACCTGGATCAGCAGAGCATTGTTCACATTGTGCAGAGACCGTGG  222

Query  223  AGAAAAGGTCAAGAAATGAATGCAACTGGAGGCGACGACCCCAGAAACGCGGCGGGAGGCTGTGAGCGGGAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAAAAGGTCAAGAAATGAATGCAACTGGAGGCGACGACCCCAGAAACGCGGCGGGAGGCTGTGAGCGGGAGCC  296

Query  297  CCAGAGCTTGACTCGGGTGGACCTCAGCAGCTCAGTCCTCCCAGGAGACTCTGTGGGGCTGGCTGTCATTCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAGAGCTTGACTCGGGTGGACCTCAGCAGCTCAGTCCTCCCAGGAGACTCTGTGGGGCTGGCTGTCATTCTGC  370

Query  371  ACACTGACAGCAGGAAGGACTCACCACCAGCTGGAAGTCCAGCAGGTAGATCAATCTACAACAGCTTTTATGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACACTGACAGCAGGAAGGACTCACCACCAGCTGGAAGTCCAGCAGGTAGATCAATCTACAACAGCTTTTATGTG  444

Query  445  TATTGTAAAGGCCCCTGTCAAAGAGTGCAGCCGGGGAAACTCAGGGTACAGTGCAGCACCTGCAGGCAGGCAAC  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATTGCAAAGGCCCCTGTCAAAGAGTGCAGCCGGGAAAACTCAGGGTACAGTGCAGCACCTGCAGGCAGGCAAC  518

Query  519  GCTCACCTTGACCCAGGGTCCATCTTGCTGGGATGATGTTTTAATTCCAAACCGGATGAGTGGTGAATGCCAAT  592
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  519  GCTCACCTTGACCCAG----------------------------------------------------------  534

Query  593  CCCCACACTGCCCTGGGACTAGTGCAGAATTTTTCTTTAAATGTGGAGCACACCCCACCTCTGACAAGGAAACA  666
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  535  --------------------------GAATTTTTCTTTAAATGTGGAGCACACCCCACCTCTGACAAGGAAACA  582

Query  667  TCAGTAGCTTTGCACCTGATCGCAACAAATAGTCGGAACATCACTTGCATTACGTGCACAGACGTCAGGAGCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  TCAGTAGCTTTGCACCTGATCGCAACAAATAGTCGGAACATCACTTGCATTACGTGCACAGACGTCAGGAGCCC  656

Query  741  CGTCCTGGTTTTCCAGTGCAACTCCCGCCACGTGATTTGCTTAGACTGTTTCCACTTATACTGTGTGACAAGAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  CGTCCTGGTTTTCCAGTGCAACTCCCGCCACGTGATTTGCTTAGACTGTTTCCACTTATACTGTGTGACAAGAC  730

Query  815  TCAATGATCGGCAGTTTGTTCACGACCCTCAACTTGGCTACTCCCTGCCTTGTGTGGGAACTGGAGACACAGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct  731  TCAATGATCGGCAGTTTGTTCACGACCCTCAACTTGGCTACTCCCTGCCTTGTGTG------------------  786

Query  889  GTGCTTAGAGGAGCTCTGGGGGGATTCAGGAGAGGAGTCGCTGGCTGTCCCAACTCCTTGATTAAAGAGCTCCA  962
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  ---------------------------------------GCTGGCTGTCCCAACTCCTTGATTAAAGAGCTCCA  821

Query  963  TCACTTCAGGATTCTGGGAGAAGAGCAGTACAACCGGTACCAGCAGTATGGTGCAGAGGAGTGTGTCCTGCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  822  TCACTTCAGGATTCTGGGAGAAGAGCAGTACAACCGGTACCAGCAGTATGGTGCAGAGGAGTGTGTCCTGCAGA  895

Query 1037  TGGGGGGCGTGTTATGCCCCCGCCCTGGCTGTGGAGCGGGGCTGCTGCCGGAGCCTGACCAGAGGAAAGTCACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  896  TGGGGGGCGTGTTATGCCCCCGCCCTGGCTGTGGAGCGGGGCTGCTGCCGGAGCCTGACCAGAGGAAAGTCACC  969

Query 1111  TGCGAAGGGGGCAATGGCCTGGGCTGTGGGTAT-----------GGA---CAACGAAG---AACAAAA------  1161
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|           |||   .||.||||   |.||..|      
Sbjct  970  TGCGAAGGGGGCAATGGCCTGGGCTGTGGGTTTGCCTTCTGCCGGGAATGTAAAGAAGCGTACCATGAAGGGGA  1043

Query 1162  --------------------------------------------------------------------------  1161
                                                                                      
Sbjct 1044  GTGCAGTGCCGTATTTGAAGCCTCAGGAACAACTACTCAGGCCTACAGAGTCGATGAAAGAGCCGCCGAGCAGG  1117

Query 1162  --------------------------------------------------------------------------  1161
                                                                                      
Sbjct 1118  CTCGTTGGGAAGCAGCCTCCAAAGAAACCATCAAGAAAACCACCAAGCCCTGTCCCCGCTGCCATGTACCAGTG  1191

Query 1162  --------------------------------------------------------------------------  1161
                                                                                      
Sbjct 1192  GAAAAAAATGGAGGCTGCATGCACATGAAGTGTCCGCAGCCCCAGTGCAGGCTCGAGTGGTGCTGGAACTGTGG  1265

Query 1162  ----------------------------------------------  1161
                                                          
Sbjct 1266  CTGCGAGTGGAACCGCGTCTGCATGGGGGACCACTGGTTCGACGTG  1311