Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11033
• Subject: NM_001201564.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1513
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTCGAGGAGGTACAGAAACATTCTGTACACACCCTTGTGTTCAGGTCGTTGAAGAGGACCCATGACATGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCGAGGAGGTACAGAAACATTCTGTACACACCCTTGTGTTCAGGTCGTTGAAGAGGACCCATGACATGTT  74

Query   75  TGTAGCTGATAATGGAAAACCTGTGCCTTTAGATGAAGAGAGTCACAAACGAAAAATGGCAATCAAGCTTCGTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTAGCTGATAATGGAAAACCTGTGCCTTTAGATGAAGAGAGTCACAAACGAAAAATGGCAATCAAGCTTCGTA  148

Query  149  ATGAGTATGGTCCTGTGTTGCATATGCCTACTTCAAAAGAAAATCTTAAAGAGAAGGGTCCTCAGAATGCAACG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGAGTATGGTCCTGTGTTGCATATGCCTACTTCAAAAGAAAATCTTAAAGAGAAGGGTCCTCAGAATGCAACG  222

Query  223  GATTCATATGTTCATAAACAGTACCCTGCCAATCAAGGACAAGAAGTTGAATACTTTGTGGCAGGGGTTGCTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATTCATATGTTCATAAACAGTACCCTGCCAATCAAGGACAAGAAGTTGAATACTTTGTGGCAGGGGTTGCTTT  296

Query  297  GACAGCAGATACTAAGATCCAGAGAATGCCAAGTGAATCAGCTGCACAGTCCTTAGCGGTGGCATTACCTTTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACAGCAGATACTAAGATCCAGAGAATGCCAAGTGAATCAGCTGCACAGTCCTTAGCGGTGGCATTACCTTTGC  370

Query  371  AGACCAAGGCTGATGCAAATCGTACTGCCCCTAGTGGAAGTGAATACCGACATCCTGGGGCTTCTGACCGTCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACCAAGGCTGATGCAAATCGTACTGCCCCTAGTGGAAGTGAATACCGACATCCTGGGGCTTCTGACCGTCCA  444

Query  445  CAGCCTACAGCGATGAATTCAATTGTCATGGAGACTGGCAATACCAAGAACTCTGCACTGATGGCTAAAAAAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGCCTACAGCGATGAATTCAATTGTCATGGAGACTGGCAATACCAAGAACTCTGCACTGATGGCTAAAAAAGC  518

Query  519  CCCTACAATGCCAAAACCCCAGTGGCACCCACCGTGGAAACTCTACAGGGTTATCAGTGGGCATCTTGGCTGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCTACAATGCCAAAACCCCAGTGGCACCCACCGTGGAAACTCTACAGGGTTATCAGTGGGCATCTTGGCTGGG  592

Query  593  TTCGATGTATTGCTGTGGAACCTGGAAATCAGTGGTTTGTTACTGGATCTGCTGACAGAACTATAAAGATCTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCGATGTATTGCTGTGGAACCTGGAAATCAGTGGTTTGTTACTGGATCTGCTGACAGAACTATAAAGATCTGG  666

Query  667  GACTTGGCTAGTGGCAAATTAAAACTGTCATTGACTGGGCATATTAGTACTGTGCGGGGCGTGATAGTAAGCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACTTGGCTAGTGGCAAATTAAAACTGTCATTGACTGGGCATATTAGTACTGTGCGGGGCGTGATAGTAAGCAC  740

Query  741  AAGGAGCCCATATCTGTTCTCTTGTGGAGAAGACAAACAAGTGAAATGCTGGGATCTCGAATACAATAAGGTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGGAGCCCATATCTGTTCTCTTGTGGAGAAGACAAACAAGTGAAATGCTGGGATCTCGAATACAATAAGGTTA  814

Query  815  TACGGCATTATCATGGACATTTAAGTGCAGTGTATGGTTTGGATTTGCACCCGACAATCGATGTGTTGGTAACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TACGGCATTATCATGGACATTTAAGTGCAGTGTATGGTTTGGATTTGCACCCGACAATCGATGTGTTGGTAACC  888

Query  889  TGTAGTCGAGATTCAACTGCACGGATTTGGGATGTGAGAACTAAAGCCAGTGTACACACATTATCTGGACATAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTAGTCGAGATTCAACTGCACGGATTTGGGATGTGAGAACTAAAGCCAGTGTACACACATTATCTGGACATAC  962

Query  963  AAATGCAGTTGCTACAGTGAGATGTCAGGCTGCAGAACCACAGATTATTACAGGAAGCCATGATACTACAATTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAATGCAGTTGCTACAGTGAGATGTCAGGCTGCAGAACCACAAATTATTACAGGAAGCCATGATACTACAATTC  1036

Query 1037  GATTATGGGATCTGGTGGCTGGAAAAACAAGAGTGACATTAACAAATCACAAAAAATCAGTTAGGGCTGTGGTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATTATGGGATCTGGTGGCTGGAAAAACAAGAGTGACATTAACAAATCACAAAAAATCAGTTAGGGCTGTGGTT  1110

Query 1111  TTACATCCAAGACATTACACATTTGCATCTGGTTCTCCAGATAACATAAAGCAGTGGAAATTCCCTGATGGAAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTACATCCAAGACATTACACATTTGCATCTGGTTCTCCAGATAACATAAAGCAGTGGAAATTCCCTGATGGAAG  1184

Query 1185  TTTCATACAAAATCTTTCCGGTCATAATGCTATTATTAACACATTGACGGTAAATTCTGATGGAGTGCTTGTAT  1258
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTCATTCAAAATCTTTCCGGTCATAATGCTATTATTAACACATTGACGGTAAATTCTGATGGAGTGCTTGTAT  1258

Query 1259  CTGGAGCTGACAATGGCACCATGCATCTTTGGGACTGGAGAACTGGCTACAATTTTCAGAGAGTTCACGCAGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGAGCTGACAATGGCACCATGCATCTTTGGGACTGGAGAACTGGCTACAATTTTCAGAGAGTTCACGCAGCT  1332

Query 1333  GTGCAACCTGGGTCTTTGGACAGTGAATCAGGAATATTTGCTTGTGCTTTTGATCAGTCTGAAAGTCGATTACT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGCAACCTGGGTCTTTGGACAGTGAATCAGGAATATTTGCTTGTGCTTTTGATCAGTCTGAAAGTCGATTACT  1406

Query 1407  AACAGCTGAAGCTGATAAAACCATTAAAGTATACAGAGAGGATGACACAGCCACAGAAGAAACTCATCCAGTCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AACAGCTGAAGCTGATAAAACCATTAAAGTATACAGAGAGGATGACACAGCCACAGAAGAAACTCATCCAGTCA  1480

Query 1481  GCTGGAAACCAGAAATTATCAAGAGAAAGAGATTT  1515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCTGGAAACCAGAAATTATCAAGAGAAAGAGATTT  1515