Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11039
• Subject: XM_017004348.1
• Aligned Length: 2310
• Identities: 2007
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  ATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGGTCAGTGTTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAACAATTGCCTGCGGCAACAGTTCGACTCCTTTCAAGTTCTCAGATCATCACTTCGGTGGTCAGTGTTGT  74

Query   75  AAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACTGGAGAACTATGGATTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGAGCTTATTGAAAACTCCTTGGATGCTGGTGCCACAAGCGTAGATGTTAAACTGGAGAACTATGGATTTG  148

Query  149  ATAAAATTGAGGTGCGAGATAACGGGGAGGGTATCAAGGCTGTTGATGCACCTGTAATGGCAATGAAGTACTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATAAAATTGAGGTGCGAGATAACGGGGAGGGTATCAAGGCTGTTGATGCACCTGTAATGGCAATGAAGTACTAC  222

Query  223  ACCTCAAAAATAAATAGTCATGAAGATCTTGAAAATTTGACAACTTACGGTTTTCGTGGAGAAGCCTTGGGGTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCTCAAAAATAAATAGTCATGAAGATCTTGAAAATTTGACAACTTACGGTTTTCGTGGAGAAGCCTTGGGGTC  296

Query  297  AATTTGTTGTATAGCTGAGGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAGTATGTTTTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATTTGTTGTATAGCTGAGGTTTTAATTACAACAAGAACGGCTGCTGATAATTTTAGCACCCAGTATGTTTTAG  370

Query  371  ATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGGTACAACTGTAACTGCTTTAAGATTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGCAGTGGCCACATACTTTCTCAGAAACCTTCACATCTTGGTCAAGGTACAACTGTAACTGCTTTAAGATTA  444

Query  445  TTTAAGAATCTACCTGTAAGAAAGCAGTTTTACTCAACTGCAAAAAAATGTAAAGATGAAATAAAAAAGATCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTAAGAATCTACCTGTAAGAAAGCAGTTTTACTCAACTGCAAAAAAATGTAAAGATGAAATAAAAAAGATCCA  518

Query  519  AGATCTCCTCATGAGCTTTGGTATCCTTAAACCTGACTTAAGGATTGTCTTTGTACATAACAAGGCAGTTATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATCTCCTCATGAGCTTTGGTATCCTTAAACCTGACTTAAGGATTGTCTTTGTACATAACAAGGCAGTTATTT  592

Query  593  GGCAGAAAAGCAGAGTATCAGATCACAAGATGGCTCTCATGTCAGTTCTGGGGACTGCTGTTATGAACAATATG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCAGAAAAGCAGAGTATCAGATCACAAGATGGCTCTCATGTCAGTTCTGGGGACTGCTGTTATGAACAATATG  666

Query  667  GAATCCTTTCAGTACCACTCTGAAGAATCTCAGATTTATCTCAGTGGATTTCTTCCAAAGTGTGATGCAGACCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATCCTTTCAGTACCACTCTGAAGAATCTCAGATTTATCTCAGTGGATTTCTTCCAAAGTGTGATGCAGACCA  740

Query  741  CTCTTTCACTAGTCTTTCAACACCAGAAAGAAGTTTCATCTTCATAAACAGTCGACCAGTACATCAAAAAGATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTTTCACTAGTCTTTCAACACCAGAAAGAAGTTTCATCTTCATAAACAGTCGACCAGTACATCAAAAAGATA  814

Query  815  TCTTAAAGTTAATCCGACATCATTACAATCTGAAATGCCTAAAGGAATCTACTCGTTTGTATCCTGTTTTCTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTAAAGTTAATCCGACATCATTACAATCTGAAATGCCTAAAGGAATCTACTCGTTTGTATCCTGTTTTCTTT  888

Query  889  CTGAAAATCGATGTTCCTACAGCTGATGTTGATGTAAATTTAACACCAGATAAAAGCCAAGTATTATTACAAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGAAAATCGATGTTCCTACAGCTGATGTTGATGTAAATTTAACACCAGATAAAAGCCAAGTATTATTACAAAA  962

Query  963  TAAGGAATCTGTTTTAATTGCTCTTGAAAATCTGATGACGACTTGTTATGGACCATTACCTAGTACAAATTCTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAGGAATCTGTTTTAATTGCTCTTGAAAATCTGATGACGACTTGTTATGGACCATTACCTAGTACAAATTCTT  1036

Query 1037  ATGAAAATAATAAAACAGATGTTTCCGCAGCTGACATCGTTCTTAGTAAAACAGCAGAAACAGATGTGCTTTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAAAATAATAAAACAGATGTTTCCGCAGCTGACATCGTTCTTAGTAAAACAGCAGAAACAGATGTGCTTTTT  1110

Query 1111  AATAAAGTGGAATCATCTGGAAAGAATTATTCAAATGTTGATACTTCAGTCATTCCATTCCAAAATGATATGCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATAAAGTGGAATCATCTGGAAAGAATTATTCAAATGTTGATACTTCAGTCATTCCATTCCAAAATGATATGCA  1184

Query 1185  TAATGATGAATCTGGAAAAAACACTGATGATTGTTTAAATCACCAGATAAGTATTGGTGACTTTGGTTATGGTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAATGATGAATCTGGAAAAAACACTGATGATTGTTTAAATCACCAGATAAGTATTGGTGACTTTGGTTATGGTC  1258

Query 1259  ATTGTAGTAGTGAAATTTCTAACATTGATAAAAACACTAAGAATGCATTTCAGGACATTTCAATGAGTAATGTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATTGTAGTAGTGAAATTTCTAACATTGATAAAAACACTAAGAATGCATTTCAGGACATTTCAATGAGTAATGTA  1332

Query 1333  TCATGGGAGAACTCTCAGACGGAATATAGTAAAACTTGTTTTATAAGTTCCGTTAAGCACACCCAGTCAGAAAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCATGGGAGAACTCTCAGACGGAATATAGTAAAACTTGTTTTATAAGTTCCGTTAAGCACACCCAGTCAGAAAA  1406

Query 1407  TGGCAATAAAGACCATATAGATGAGAGTGGGGAAAATGAGGAAGAAGCAGGTCTTGAAAACTCTTCGGAAATTT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGGCAATAAAGACCATATAGATGAGAGTGGGGAAAATGAGGAAGAAGCAGGTCTTGAAAACTCTTCGGAAATTT  1480

Query 1481  CTGCAGATGAGTGGAGCAGGGGAAATATACTTAAAAATTCAGTGGGAGAGAATATTGAACCTGTGAAAATTTTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCAGATGAGTGGAGCAGGGGAAATATACTTAAAAATTCAGTGGGAGAGAATATTGAACCTGTGAAAATTTTA  1554

Query 1555  GTGCCTGAAAAAAGTTTACCATGTAAAGTAAGTAATAATAATTATCCAATCCCTGAACAAATGAATCTTAATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGCCTGAAAAAAGTTTACCATGTAAAGTAAGTAATAATAATTATCCAATCCCTGAACAAATGAATCTTAATGA  1628

Query 1629  AGATTCATGTAACAAAAAATCAAATGTAATAGATAATAAATCTGGAAAAGTTACAGCTTATGATTTACTTAGCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGATTCATGTAACAAAAAATCAAATGTAATAGATAATAAATCTGGAAAAGTTACAGCTTATGATTTACTTAGCA  1702

Query 1703  ATCGAGTAATCAAGAAACCCATGTCAGCAAGTGCTCTTTTTGTTCAAGATCATCGTCCTCAGTTTCTCATAGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATCGAGTAATCAAGAAACCCATGTCAGCAAGTGCTCTTTTTGTTCAAGATCATCGTCCTCAGTTTCTCATAGAA  1776

Query 1777  AATCCTAAGACTAGTTTAGAGGATGCAACACTACAAATTGAAGAACTGTGGAAGACATTGAGTGAAGAGGAAAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AATCCTAAGACTAGTTTAGAGGATGCAACACTACAAATTGAAGAACTGTGGAAGACATTGAGTGAAGAGGAAAA  1850

Query 1851  ACTGAATCTTTTTAATGGATCTCATTATTTAGACGTTTTATATAAAATGACAGCAGATGACCAAAGATACAGTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACTGAATCTTTTTAATGGATCTCATTATTTAGACGTTTTATATAAAATGACAGCAGATGACCAAAGATACAGTG  1924

Query 1925  GATCAACTTACCTGTCTGATCCTCGTCTTACAGCGAATGGTTTCAAGATAAAATTGATACCAGGAGTTTCAATT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GATCAACTTACCTGTCTGATCCTCGTCTTACAGCGAATGGTTTCAAGATAAAATTGATACCAGGAGTTTCAATT  1998

Query 1999  ACTGAAAAT-----------------------------------------------------------------  2007
            |||||||||                                                                 
Sbjct 1999  ACTGAAAATTACTTGGAAATAGAAGGAATGGCTAATTGTCTCCCATTCTATGGAGTAGCAGATTTAAAAGAAAT  2072

Query 2008  --------------------------------------------------------------------------  2007
                                                                                      
Sbjct 2073  TCTTAATGCTATATTAAACAGAAATGCAAAGGAAGTTTATGAATGTAGACCTCGCAAAGTGATAAGTTATTTAG  2146

Query 2008  --------------------------------------------------------------------------  2007
                                                                                      
Sbjct 2147  AGGGAGAAGCAGTGCGTCTATCCAGACAATTACCCATGTACTTATCAAAAGAGGACATCCAAGACATTATCTAC  2220

Query 2008  --------------------------------------------------------------------------  2007
                                                                                      
Sbjct 2221  AGAATGAAGCACCAGTTTGGAAATGAAATTAAAGAGTGTGTTCATGGTCGCCCATTTTTTCATCATTTAACCTA  2294

Query 2008  ----------------  2007
                            
Sbjct 2295  TCTTCCAGAAACTACA  2310