Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11054
• Subject: NM_008924.2
• Aligned Length: 1234
• Identities: 1007
• Gaps: 116

Alignment

Query    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA  74
            ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCCGCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACCGTGGAGGTGCTTCGGCAGCA  74

Query   75  GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCA-GCCTCAGTC  147
            ||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||| |.||| |..||||.|
Sbjct   75  GCCGCCCGACCTCGTCGACTTCGCGGTGGAGTACTTCACACGCCTGCGCGAGGCCCGC-CGCCAGGAATCAGAC  147

Query  148  -----------CTGCCCGCCGCCAC----CCCACGCCAGAG-CCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGG  205
                       ||.||||.||  ||    |.|||||..||| ||.|.| ||..|||||.||             
Sbjct  148  ACGTTCATCGTCTCCCCGACG--ACCTTTCACACGCAGGAGTCCAGCG-CAGTCCCCGTCA-------------  205

Query  206  ACCGTGTCGCCGACGCCAAAGGGGACAGCGAGTCGGA---GGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGC  276
                  |||..||.|   |.|||||.||.||.|||||   |||.||.|..||..||||||||||.|||||||||
Sbjct  206  ------TCGAGGAGG---ACGGGGAGAGTGACTCGGACTCGGAAGATGCCGATCTGGAAGTTCCGGTTCCTAGC  270

Query  277  AGATTTAATAGACGAGTATCAGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAG  350
            |.|||||.|||||||||||||||||||||.||.||.|.||||||||||||.||||||||.||||..||||||||
Sbjct  271  AAATTTACTAGACGAGTATCAGTCTGTGCAGAAACGTTTAACCCTGATGAAGAAGAGGAGGATAACGATCCAAG  344

Query  351  GGTGATTCATCCTAAAACTGATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAA  424
            ||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  345  GGTGGTTCATCCCAAAACTGATGAGCAGAGATGCCGGCTTCAGGAAGCTTGTAAAGATATTCTTCTTTTCAAAA  418

Query  425  ATCTTGATCAGGAACAGCTTTCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTC  498
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||.||||.|||||||||
Sbjct  419  ACCTTGATCAGGAACAGCTTTCTCAAGTTCTGGATGCCATGTTTGAAAAGATTGTCAAAACTGACGAGCATGTC  492

Query  499  ATTGACCAAGGAGATGATGGAGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGA  572
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  493  ATTGACCAAGGCGACGACGGGGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACCTATGACATTTTAGTAACGAAAGA  566

Query  573  TAATCAAACCCGCTCTGTTGGTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCC  646
            |||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  567  TAATCAAACACGTTCTGTTGGTCAGTATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAATACCC  640

Query  647  CGAGAGCTGCTACCATTGTTGCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATC  720
            ||||||||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  641  CGAGAGCTGCTACCATCATCGCCACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGATTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATC  714

Query  721  ATAGTGAAAAATAATGCAAAGAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACT  794
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.|||||
Sbjct  715  ATAGTGAAAAACAATGCAAAGAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTTCCACTCTTTAAGTCACT  788

Query  795  AGAGGTGTCAGAACGAATGAAGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCA  868
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.
Sbjct  789  AGAGATGTCAGAACGAATGAAGATTGTGGATGTGATCGGGGAAAAGATCTATAAGGACGGAGAGCGAATAATCG  862

Query  869  CTC------------------------------------------------------------------AGACT  876
            |.|                                                                  ||||.
Sbjct  863  CACAGGGTGAAAAGGCCGACAGCTTCTATATCATAGAGTCTGGGGAAGTGAGCATCTTGATTAGAAGCAAGACC  936

Query  877  AAATCAAACAAGGATGGTGGGAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCT  950
            ||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  937  AAGTCAAACAAGAATGGAGGGAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCATTGCCATAAGGGGCAGTACTTCGGAGAACT  1010

Query  951  TGCCCTGGTCACCAACAAACCCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATG  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  TGCCCTGGTCACCAACAAACCCAGAGCTGCTTCCGCTTACGCGGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATG  1084

Query 1025  TACAAGCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAG  1098
            |.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1085  TTCAAGCATTTGAGAGGCTTCTGGGCCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACATTACGAAGAACAG  1158

Query 1099  CTGGTGAAGATGTTTGGCTCCAGCGTGGATCTG--GGCAACCTCGGGCAG  1146
            ||||||||||||||||||||||.|.||||||||  ||  |||.|||||||
Sbjct 1159  CTGGTGAAGATGTTTGGCTCCAACTTGGATCTGATGG--ACCCCGGGCAG  1206