Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11057
- Subject:
- XM_017008441.2
- Aligned Length:
- 1283
- Identities:
- 754
- Gaps:
- 529
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCTCAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTTCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGA 296
Query 1 -------------------------ATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTGATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAG 370
Query 50 ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAATGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATT 444
Query 124 CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGC 518
Query 198 CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCC 592
Query 272 TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATGGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAA 345
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGGGATGGGCTACAAGGAGAACG-------------------------------------------------- 616
Query 346 ATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGA 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 617 ----------------------ATATTGACCAGTGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGA 668
Query 420 ATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCC 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 669 ATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAACTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCC 742
Query 494 CCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGAC 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 743 CCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGAC 816
Query 568 TTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACAT 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 817 TTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAAAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACAT 890
Query 642 CAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAG 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 891 CAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCGCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAG 964
Query 716 AACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGT 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 965 AACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGT 1038
Query 790 GTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTT-----CAGGTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCG 858
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct 1039 GTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGCACAGGTGCAGCAG-------------------------------- 1080
Query 859 TCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTC 932
Sbjct 1081 -------------------------------------------------------------------------- 1080
Query 933 GGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 957
Sbjct 1081 ------------------------- 1080