Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11062
• Subject: NM_001303414.1
• Aligned Length: 783
• Identities: 681
• Gaps: 42

Alignment

Query   1  ATGAATCCATTCCTGATCCTTGCCTTTGTGGGAGCTGCTGTTGCTGTCCCCTTTGACGATGATGACAAGATTGT  74
           |||||||.|.|.|||||||||.|||||||.|.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct   1  ATGAATCTACTTCTGATCCTTACCTTTGTTGCAGCTGCTGTTGCTGCCCCCTTTGATGATGATGACAAGATCGT  74

Query  75  TGGGGGCTACACCTGTGAGGAGAATTCTCTCCCCTACCAGGTGTCCCTGAATTCTGGCTCCCACTTCTGCGGTG  148
           |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  75  TGGGGGCTACATCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTACCACTTCTGCGGTG  148

Query 149  GCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTATCAGCAGCTCACTGCTACAAGAC----------------------  200
           ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||.|                      
Sbjct 149  GCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGTCGGCAATTAACTCAAAATTATCA  222

Query 201  --------------------CCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCAAAGTCCTGGAGGGGAATGA  254
                               ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGAAGAGGGTGTGAATATCACCGCATCCAGGTGAGACTGGGAGAGCACAACATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGA  296

Query 255  GCAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCACCCCCAATACGACAGGAAGACTCTGAACAATGACATCATGT  328
           .||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||...|||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 297  ACAGTTCATCAATGCGGCCAAGATCATCCGCCACCCCAAATACAACAGCCGGACTCTGGACAATGACATCCTGC  370

Query 329  TAATCAAGCTCTCCTCACGTGCAGTAATCAACGCCCGCGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACCGCCCCTCCAGCC  402
           |.||||||||||||||||.|||.||.|||||..|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 371  TGATCAAGCTCTCCTCACCTGCCGTCATCAATTCCCGCGTGTCCGCCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCT  444

Query 403  ACTGGCACGAAGTGCCTCATCTCTGGCTGGGGCAACACTGCGAGCTCTGGCGCCGACTACCCAGACGAGCTGCA  476
           .|||||||..|||.|||||||||.|||||||||||||||..|||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCTGGCACCGAGTCCCTCATCTCCGGCTGGGGCAACACTCTGAGTTCTGGTGCCGACTACCCAGACGAGCTGCA  518

Query 477  GTGCCTGGACGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTAAGTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAGCAACATGT  550
           |||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 519  GTGCCTGGATGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTGAGTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAACAACATGT  592

Query 551  TCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATTCATGTCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTGCAATGGA  624
           ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 593  TCTGTGTGGGCTTCCTCGAGGGAGGCAAGGATTCCTGCCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTCCAATGGA  666

Query 625  CAGCTCCAAGGAGTTGTCTCCTGGGGTGATGGCTGTGCCCAGAAGAACAAGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTA  698
           .|||||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GAGCTCCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGCTGTGCCCAGAAGAACAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTA  740

Query 699  CAACTATGTGAAATGGATTAAGAACACCATAGCTGCCAACAGC  741
           ||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 741  CAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGCTGCCAACAGC  783