Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11062
• Subject: NR_001296.3
• Aligned Length: 863
• Identities: 686
• Gaps: 122

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  CTCACCTCACAGACACTCCTCTCTGGATCCTCCAGAGCTATAAAGACGGGCCTTCCACCACCAGACAGGCGCAC  74

Query   1  ---------ATGAATCCATTCCTGATCCTTGCCTTTGTGGGAGCTGCTGTTGCTGTCCCCTTTGACGATGATGA  65
                    |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  75  TCTACCACCATGAATCCACTCCTGATCCTTGCCTTTGTGGGAGCTGCTGTTGCTGTCCCCTTTGATGATGATGA  148

Query  66  CAAGATTGTTGGGGGCTACACCTGTGAGGAGAATTCTCTCCCCTACCAGGTGTCCCTGAATTCTGGCTCCCACT  139
           ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149  CAAGATCGTTGGGGGCTACACCTGTGAGGAGAATTCTGTCCCCTACCAGGTGTCCTTGAATTCTGGCTCCCACT  222

Query 140  TCTGCGGTGGCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTATCAGCAGCTCACTGCTACAAGACCCGCATCCAGGTG  213
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct 223  TCTGCGGTGGCTCCCTCATCAGCGAACAGTGGGTGGTGTCAGCAGGTCACTGCTACAAGCCCCACATCCAGGTG  296

Query 214  AGACTGGGAGAGCACAACATCAAAGTCCTGGAGGGGAATGAGCAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCA  287
           |||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGACTGGGAGAGCACAATATCGAAGTCCTGGAGGGGAATGAGCAGTTCATCAATGCAGCCAAGATCATCCGCCA  370

Query 288  CCCCCAATACGACAGGAAGACTCTGAACAATGACATCATGTTAATCAAGCTCTCCTCACGTGCAGTAATCAACG  361
           ||||.|||||.||||||..|.|||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|||.|||.||.|||||.|
Sbjct 371  CCCCAAATACAACAGGATTATTCTGAACAATGACATCATGCTGATCAAGCTCTCCACACCTGCCGTCATCAATG  444

Query 362  CCCGCGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACCGCCCCTCCAGCCACTGGCACGAAGTGCCTCATCTCTGGCTGGGGC  435
           |||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||..|||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 445  CCCATGTGTCCACCATCTCTCTGCCCACTGCCCCTCCAGCTGCTGGCACCGAGTGCCTTATCTCCGGCTGGGGC  518

Query 436  AACACTGCGAGCTCTGGCGCCGACTACCCAGACGAGCTGCAGTGCCTGGACGCTCCTGTGCTGAGCCAGGCTAA  509
           ||.||...|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 519  AATACCCTGAGCTCTGGGGCCGACTACCCAGATGAGCTGCAGTGCCTGGACGCTCCTGTGCTGACCCAGGCTAA  592

Query 510  GTGTGAAGCCTCCTACCCTGGAAAGATTACCAGCAACATGTTCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATT  583
           ||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GTGTAAAGCCTCCTACCCTTTAAAGATTACCAGCAACATGTTCTGTGTGGGCTTCCTTGAGGGAGGCAAGGATT  666

Query 584  CATGTCAGGGTGATTCTGGTGGCCCTGTGGTCTGCAATGGACAGCTCCAAGGAGTTGTCTCCTGGGGTGATGGC  657
           |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||..|||||
Sbjct 667  CCTGCCAGGGTGACTCTGGTGGCCCTGTGGTCTGCAATGGACAGCTTCAAGGAATTGTCTCCTGGGGCTATGGC  740

Query 658  TGTGCCCAGAAGAACAAGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTACAACTATGTGAAATGGATTAAGAACACCATAGC  731
           |||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||
Sbjct 741  TGTGCCCAGAAGAGAAGGCCTGGAGTCTACACCAAGGTCTACAACTATGTGGACTGGATTAAGGACACCATAGC  814

Query 732  TGCCAACAGC---------------------------------------  741
           ||||||||||                                       
Sbjct 815  TGCCAACAGCTAAAGCCCCTGGTCACTCTGCAGTCTCTATACCAATAAA  863