Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11063
• Subject: XM_011526987.3
• Aligned Length: 1269
• Identities: 841
• Gaps: 363

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATGGTGGACGAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTC----ACCCGGGAGGACGCAG-GATCCTACACCTT  365
                                               |||||    .|..||||.|..|||| ||....|.|||||
Sbjct    1  -----------------------------------ATGTCCTTGGCAAGGGAAGCTGCAGAGAAAACATACCTT  39

Query  366  ACACATCATAAAGGGAGA-TGATGGGACT-AGAGGAGT----AACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGG  433
            ...|..|  ||||..||| |||   .||| |||.||.|    .||||.|.|.|.||              .|||
Sbjct   40  GGGCGGC--AAAGTAAGACTGA---AACTAAGAAGATTCCAGCACTGCATGCTCCA--------------ATGG  94

Query  434  AGACTCCTAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGT  507
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   95  AGACTCCCAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGT  168

Query  508  GACCCTGAGACTCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAA  581
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|
Sbjct  169  GATCCTGAGACTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCA  242

Query  582  GCTGTCCGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAA  655
            |.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  243  GTTGTCTGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAA  316

Query  656  TACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTAC  729
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  317  TACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTAC  390

Query  730  ATCACAATCAACAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAA  803
            |||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  391  ATCACCATCAACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAA  464

Query  804  CTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACA  877
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  465  CTACACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACA  538

Query  878  GGATCCTCATTCTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGT  951
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct  539  GGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGT  612

Query  952  GGCATCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCAC  1025
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  613  GGCATCCGCAGTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCAC  686

Query 1026  CTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTC-GCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGG  1098
            |||||||||||||||||||..||||||||||||||| ||| ||.||.||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct  687  CTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGG  759

Query 1099  ACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCT  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  760  ACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCT  833

Query 1173  CTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGACT  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  834  CTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGACT  907

Query 1247  GGATATTACCC  1257
            |||.|||||||
Sbjct  908  GGACATTACCC  918