Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11063
• Subject: XM_017027001.2
• Aligned Length: 1282
• Identities: 939
• Gaps: 308

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||...||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATGGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||..|||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.||...|||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||                
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACA----------------  428

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
                                                                                      
Sbjct  429  --------------------------------------------------------------------------  428

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  -----------------------------------------CCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  461

Query  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  462  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTAAGAACTACACCTACA  535

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  609

Query  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  683

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTG---ACTGGATATTAC  1255
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.|||||    |
Sbjct  906  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGAT----C  975

Query 1256  CC----------------------  1257
            ||                      
Sbjct  976  CCAGCATCCTTGGCAATAGGGATT  999