Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11078
Subject:
XM_017025909.1
Aligned Length:
4197
Identities:
3706
Gaps:
480

Alignment

Query    1  ATGCCATCAGGTTCTTTCATGCTGGTGAATGCCTCTGGGAGACCTGAGGGGCAGAGAGCCCACCTGCTCTTACC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCAACTTAAAGAAAATGACACCCACTGCATCGATTTTCACTATTTTGTGTCCAGCAAGAGTAATTCTCCTCCGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGTTACTCAATGTCTACGTGAAGGTCAATAACGGGCCACTGGGGAATCCTATCTGGAATATATCTGGAGACCCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCACGTACATGGAACAGGGCAGAACTGGCCATTAGTACTTTCTGGCCTAACTTTTATCAGGTGATTTTTGAAGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GATAACTTCTGGACATCAAGGCTATCTCGCTATCGATGAGGTGAAGGTGTTAGGACATCCATGTACCAGGACTC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCACTTCCTGCGGATTCAGAATGTGGAAGTTAATGCTGGCCAGTTTGCTACCTTCCAGTGCAGTGCCATCGGC  444
                                 |||.|      ||..||          ||.|||            |||||   
Sbjct    1  ---------------------ATGGG------AACCCT----------CTCCCT------------CCATC---  22

Query  445  AGGACCGTGGCAGGAGACAGGCTCTGGTTACAGGGCATTGATGTGCGAGATGCTCCTCTGAAGGAAATCAAGGT  518
                                 ||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   23  ---------------------CT----------GGCATTGATGTGCGAGATGCTCCTCTGAAGGAAATCAAGGT  65

Query  519  GACCAGCTCCCGACGCTTCATTGCTTCATTTAATGTTGTGAATACCACCAAACGAGATGCTGGAAAGTACCGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   66  GACCAGCTCCCGACGCTTCATTGCTTCATTTAATGTTGTGAATACCACCAAACGAGATGCTGGAAAGTACCGCT  139

Query  593  GCATGATTCGCACTGAAGGAGGTGTTGGAATATCAAACTATGCAGAGTTGGTAGTTAAAGAACCACCCGTTCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  GCATGATTCGCACTGAAGGAGGTGTTGGAATATCAAACTATGCAGAGTTGGTAGTTAAAGAACCACCCGTTCCT  213

Query  667  ATTGCCCCACCTCAGCTCGCCTCTGTAGGAGCCACCTACCTGTGGATACAGCTCAACGCCAACTCCATCAATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  ATTGCCCCACCTCAGCTCGCCTCTGTAGGAGCCACCTACCTGTGGATACAGCTCAACGCCAACTCCATCAATGG  287

Query  741  GGATGGGCCCATTGTGGCCCGAGAGGTGGAGTACTGCACGGCCAGTGGGAGCTGGAATGACCGGCAGCCAGTCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  GGATGGGCCCATTGTGGCCCGAGAGGTGGAGTACTGCACGGCCAGTGGGAGCTGGAATGACCGGCAGCCAGTCG  361

Query  815  ATTCCACGAGCTATAAAATTGGACACCTTGACCCAGATACAGAATATGAGATTAGTGTGCTCCTGACCAGGCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  ATTCCACGAGCTATAAAATTGGACACCTTGACCCAGATACAGAATATGAGATTAGTGTGCTCCTGACCAGGCCA  435

Query  889  GGGGAGGGTGGCACTGGCTCTCCTGGTCCGGCTCTCAGGACAAGAACAAAGTGTGCTGATCCCATGCGAGGCCC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  GGGGAGGGTGGCACTGGCTCTCCTGGTCCAGCTCTCAGGACAAGAACAAAGTGTGCTGATCCCATGCGAGGCCC  509

Query  963  AAGAAAACTAGAAGTAGTGGAGGTCAAATCTCGGCAAATCACTATCAGCTGGGAGCCATTTGGATATAATGTAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  AAGAAAACTAGAAGTAGTGGAGGTCAAATCTCGGCAAATCACTATCCGCTGGGAGCCATTTGGATATAATGTAA  583

Query 1037  CTCGTTGCCACAGTTATAATCTCACTGTCCACTACTGTTACCAAGTTGGAGGACAAGAACAAGTGCGAGAAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  CTCGTTGCCACAGTTATAATCTCACTGTCCACTACTGTTACCAAGTTGGAGGACAAGAACAAGTGCGAGAAGAA  657

Query 1111  GTAAGCTGGGATACAGAAAACTCACACCCTCAACACACGATCACTAACCTGTCACCATACACCAATGTCAGTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  GTAAGCTGGGATACAGAAAACTCACACCCTCAACACACGATCACTAACCTGTCACCATACACCAATGTCAGTGT  731

Query 1185  GAAACTGATCCTCATGAACCCAGAGGGCCGGAAGGAAAGCCAAGAACTCATAGTGCAGACAGATGAAGACCTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  GAAACTGATCCTCATGAACCCAGAGGGCCGGAAGGAAAGCCAAGAACTCATAGTGCAGACAGATGAAGACCTCC  805

Query 1259  CAGGTGCTGTTCCCACTGAATCCATACAAGGAAGTACCTTTGAAGAGAAGATATTTCTTCAGTGGAGAGAACCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  CAGGTGCTGTTCCCACTGAATCCATACAAGGAAGTACCTTTGAAGAGAAGATATTTCTTCAGTGGAGAGAACCA  879

Query 1333  ACTCAAACATATGGTGTAATCACTTTATATGAGATCACCTACAAAGCAGTCAGTTCCTTTGACCCAGAAATAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  ACTCAAACATATGGTGTAATCACTTTATATGAGATCACCTACAAAGCAGTCAGTTCCTTTGACCCAGAAATAGA  953

Query 1407  TTTATCCAATCAGAGTGGAAGAGTTTCAAAGCTGGGAAATGAAACCCATTTCCTGTTTTTTGGACTGTATCCGG  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  TTTATCCAATCAGAGTGGAAGAGTTTCAAAGCTGGGAAATGAAACCCATTTTCTGTTTTTTGGACTGTATCCGG  1027

Query 1481  GGACCACATACTCCTTTACCATCCGAGCTAGCACAGCTAAGGGTTTTGGGCCTCCAGCAACAAACCAGTTCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  GGACCACATACTCCTTTACCATCCGAGCTAGCACAGCTAAGGGTTTTGGGCCTCCAGCAACAAACCAGTTCACC  1101

Query 1555  ACCAAAATATCAGCACCCTCTATGCCAGCTTATGAACTTGAGACACCTTTGAATCAAACTGACAATACCGTGAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  ACCAAAATATCAGCACCCTCTATGCCAGCTTATGAACTTGAGACACCTTTGAATCAAACTGACAATACCGTGAC  1175

Query 1629  AGTCATGCTGAAACCTGCCCACAGCAGAGGAGCACCTGTCAGTGTCTATCAAATAGTTGTTGAGGAAGAACGTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  AGTCATGCTGAAACCTGCCCACAGCAGAGGAGCACCTGTCAGTGTCTATCAAATAGTTGTTGAGGAAGAACGTC  1249

Query 1703  CTCGAAGAACTAAAAAGACGACAGAAATCTTAAAGTGCTACCCAGTGCCAATTCACTTCCAGAATGCTTCTCTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  CTCGAAGAACTAAAAAGACGACAGAAATCTTAAAGTGCTACCCAGTGCCAATTCACTTCCAGAATGCTTCTCTG  1323

Query 1777  CTGAACTCACAGTACTACTTTGCTGCAGAATTTCCTGCAGACAGCCTCCAAGCTGCGCAGCCTTTTACAATTGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  CTGAACTCACAGTACTACTTTGCTGCAGAATTTCCTGCAGACAGCCTCCAAGCTGCGCAGCCTTTTACAATTGG  1397

Query 1851  TGATAATAAGACATATAATGGATACTGGAACACTCCCCTTCTCCCCTATAAAAGCTACAGAATTTATTTCCAAG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  TGATAATAAGACATATAATGGATACTGGAACACTCCCCTTCTCCCCTATAAAAGCTACAGAATTTATTTCCAAG  1471

Query 1925  CTGCTAGTAGAGCCAATGGGGAAACCAAAATAGACTGTGTCCAAGTGGCCACAAAAGGAGCTGCCACTCCGAAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  CTGCTAGTAGAGCCAATGGGGAAACCAAAATAGACTGTGTCCAAGTGGCCACAAAAGGAGCTGCCACTCCGAAA  1545

Query 1999  CCAGTCCCAGAACCCGAGAAACAGACAGACCATACAGTTAAAATTGCTGGAGTCATCGCGGGCATCTTGCTGTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  CCAGTCCCAGAACCCGAGAAACAGACAGACCATACAGTTAAAATTGCTGGAGTCATCGCGGGCATCTTGCTGTT  1619

Query 2073  CGTGATTATATTTCTTGGAGTTGTGTTGGTAATGAAGAAAAGGAAACTGGCCAAGAAGCGGAAAGAGACCATGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  CGTGATTATATTTCTTGGAGTTGTGTTGGTAATGAAGAAAAGGAAACTGGCCAAGAAGCGGAAAGAGACCATGA  1693

Query 2147  GCAGCACCCGACAGGAGATGACTGTGATGGTGAACTCAATGGACAAGAGCTATGCTGAGCAGGGCACAAACTGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  GCAGCACCCGACAGGAGATGACTGTGATGGTGAACTCAATGGACAAGAGCTATGCTGAGCAGGGCACAAACTGC  1767

Query 2221  GACGAGGCTTTCTCATTCATGGACACGCACAATCTGAATGGGAGATCTGTGTCTTCACCATCGTCCTTCACAAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  GACGAGGCTTTCTCATTCATGGACACGCACAATCTGAATGGGAGATCTGTGTCTTCACCATCGTCCTTCACAAT  1841

Query 2295  GAAAACAAATACACTGAGCACATCGGTGCCTAATTCCTATTACCC---------------------------AG  2341
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           ||
Sbjct 1842  GAAAACAAATACACTGAGCACATCGGTGCCTAATTCCTATTACCCAGACCCATTTGTGCCAACTGCAATTTTAG  1915

Query 2342  ATGAAACCCACACAATGGCCAGCGATACCAGCAGCCTGGTGCAGTCCCATACTTACAAGAAGCGAGAGCCGGCC  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916  ATGAAACCCACACAATGGCCAGCGATACCAGCAGCCTGGTGCAGTCCCATACTTACAAGAAGCGAGAGCCGGCC  1989

Query 2416  GACGTGCCCTATCAGACTGGGCAGCTCCACCCCGCCATCCGGGTGGCAGACCTCCTTCAGCACATCACACAGAT  2489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990  GACGTGCCCTATCAGACTGGGCAGCTCCACCCCGCCATCCGGGTGGCAGACCTCCTTCAGCACATCACACAGAT  2063

Query 2490  GAAGTGTGCGGAGGGCTACGGCTTCAAGGAGGAATACGAGAGCTTCTTTGAAGGGCAGTCTGCACCATGGGACT  2563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2064  GAAGTGTGCGGAGGGCTACGGCTTCAAGGAGGAATACGAGAGCTTCTTTGAAGGGCAGTCTGCACCATGGGACT  2137

Query 2564  CGGCTAAGAAAGGTGAGAACAGAATGAAGAACAGATACGGGAATATCATTGCATACGATCATTCCCGAGTGAGG  2637
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2138  CGGCTAAGAAAGATGAGAACAGAATGAAGAACAGATACGGGAATATCATTGCATACGATCATTCCCGAGTGAGG  2211

Query 2638  CTGCAGACAATAGAAGGAGACACAAACTCAGACTATATCAATGGCAATTATATCGATGGTTATCATCGACCCAA  2711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2212  CTGCAGACAATAGAAGGAGACACAAACTCAGACTATATCAATGGCAATTATATCGATGGTTATCATCGACCCAA  2285

Query 2712  TCATTACATTGCTACCCAAGGGCCAATGCAGGAAACCATCTATGACTTCTGGAGGATGGTGTGGCACGAAAACA  2785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2286  TCATTACATTGCTACCCAAGGGCCAATGCAGGAAACCATCTATGACTTCTGGAGGATGGTGTGGCACGAAAACA  2359

Query 2786  CTGCAAGTATCATCATGGTGACCAATCTTGTGGAAGTGGGAAGGGTCAAATGCTGCAAATACTGGCCAGATGAC  2859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360  CTGCAAGTATCATCATGGTGACCAATCTTGTGGAAGTGGGAAGGGTCAAATGCTGCAAATACTGGCCAGATGAC  2433

Query 2860  ACAGAGATATATAAAGACATTAAAGTTACCCTAATAGAAACAGAACTACTGGCAGAATATGTGATAAGAACATT  2933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434  ACAGAGATATATAAAGACATTAAAGTTACCCTAATAGAAACAGAACTACTGGCAGAATATGTGATAAGAACATT  2507

Query 2934  TGCTGTTGAAAAGAGAGGTGTGCATGAAATCCGAGAGATCAGACAGTTTCACTTCACTGGCTGGCCGGATCGTG  3007
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2508  TGCTGTTGAAAAGAGAGGTGTGCATGAAATCCGAGAGATCAGACAGTTTCACTTCACTGGCTGGCCGGATCATG  2581

Query 3008  GGGTCCCCTACCATGCCACCGGCCTGCTGGGATTCGTGCGGCAAGTCAAGTCCAAGAGCCCGCCCAGTGCAGGC  3081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2582  GGGTCCCCTACCATGCCACCGGCCTGCTGGGATTCGTGCGGCAAGTCAAGTCCAAGAGCCCGCCCAGTGCAGGC  2655

Query 3082  CCACTGGTGGTGCACTGCAGTGCTGGTGCAGGGAGGACTGGCTGTTTCATCGTCATTGATATCATGTTGGACAT  3155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2656  CCACTGGTGGTGCACTGCAGTGCTGGTGCAGGGAGGACTGGCTGTTTCATCGTCATTGATATCATGTTGGACAT  2729

Query 3156  GGCCGAAAGGGAAGGGGTCGTAGACATCTACAACTGCGTCAGGGAGCTGCGGTCACGGAGGGTGAACATGGTGC  3229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2730  GGCCGAAAGGGAAGGGGTCGTAGACATCTACAACTGCGTCAGGGAGCTGCGGTCACGGAGGGTGAACATGGTGC  2803

Query 3230  AAACAGAGGAGCAGTATGTGTTTATCCACGATGCGATCCTGGAAGCCTGTCTTTGTGGGGACACCTCTGTGCCT  3303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2804  AAACAGAGGAGCAGTATGTGTTTATCCACGATGCGATCCTGGAAGCCTGTCTTTGTGGGGACACCTCTGTGCCT  2877

Query 3304  GCTTCCCAAGTTAGGTCTCTGTATTATGACATGAACAAACTGGATCCACAGACAAACTCAAGCCAGATTAAAGA  3377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2878  GCTTCCCAAGTTAGGTCTCTGTATTATGACATGAACAAACTGGATCCACAGACAAACTCAAGCCAGATTAAAGA  2951

Query 3378  GGAATTCCGGACGCTAAACATGGTGACACCAACGCTGCGAGTAGAGGACTGCAGCATCGCACTGTTGCCCCGGA  3451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2952  GGAATTCCGGACGCTAAACATGGTGACACCAACGCTGCGAGTAGAGGACTGCAGCATCGCACTGTTGCCCCGGA  3025

Query 3452  ACCATGAGAAAAACCGGTGCATGGACATCCTGCCCCCAGACCGCTGCCTGCCCTTCCTCATCACCATCGATGGG  3525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3026  ACCATGAGAAAAACCGGTGCATGGACATCCTGCCCCCAGACCGCTGCCTGCCCTTCCTCATCACCATCGATGGG  3099

Query 3526  GAGAGCAGCAACTACATCAATGCTGCCCTCATGGACAGCTATAAACAGCCTTCAGCTTTTATAGTCACCCAGCA  3599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3100  GAGAGCAGCAACTACATCAATGCTGCCCTCATGGACAGCTATAAACAGCCTTCAGCTTTTATAGTCACCCAGCA  3173

Query 3600  TCCTTTGCCAAACACAGTGAAAGACTTTTGGAGACTGGTCCTGGATTATCACTGCACATCCGTAGTTATGCTAA  3673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3174  TCCTTTGCCAAACACAGTGAAAGACTTTTGGAGACTGGTCCTGGATTATCACTGCACATCCGTAGTTATGCTAA  3247

Query 3674  ATGATGTGGATCCTGCCCAGTTGTGTCCACAGTACTGGCCAGAAAACGGAGTACACAGACACGGCCCCATCCAG  3747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3248  ATGATGTGGATCCTGCCCAGTTGTGTCCACAGTACTGGCCAGAAAACGGAGTACACAGACACGGCCCCATCCAG  3321

Query 3748  GTGGAATTTGTCTCTGCTGACCTGGAAGAGGACATCATCAGCAGGATATTCCGCATTTACAATGCCGCCAGACC  3821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3322  GTGGAATTTGTCTCTGCTGACCTGGAAGAGGACATCATCAGCAGGATATTCCGCATTTACAATGCCGCCAGACC  3395

Query 3822  CCAAGATGGATATCGGATGGTGCAGCAATTCCAGTTCCTGGGCTGGCCGATGTACAGGGACACACCAGTGTCTA  3895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3396  CCAAGATGGATATCGGATGGTGCAGCAATTCCAGTTCCTGGGCTGGCCGATGTACAGGGACACACCAGTGTCTA  3469

Query 3896  AGCGCTCCTTCTTGAAGCTCATTCGCCAGGTGGACAAGTGGCAAGAGGAATACAATGGCGGGGAAGGCCGCACC  3969
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3470  AGCGCTCCTTCTTGAAGCTCATTCGCCAGGTGGACAAGTGGCAAGAGGAGTACAATGGCGGGGAAGGCCGCACG  3543

Query 3970  GTTGTGCACTGCTTGAACGGGGGAGGCCGCAGTGGGACGTTCTGCGCCATCAGCATCGTATGTGAGATGCTCCG  4043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3544  GTTGTGCACTGCTTGAACGGGGGAGGCCGCAGTGGGACGTTCTGCGCCATCAGCATCGTATGTGAGATGCTCCG  3617

Query 4044  GCACCAGAGAACCGTGGATGTCTTTCACGCTGTGAAGACACTGAGGAACAACAAGCCCAACATGGTCGACCTCC  4117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3618  GCACCAGAGAACCGTGGATGTCTTTCACGCTGTGAAGACACTGAGGAACAACAAGCCCAACATGGTCGACCTCC  3691

Query 4118  TGGATCAGTACAAGTTCTGCTACGAGGTGGCCCTGGAATACTTGAATTCTGGC  4170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3692  TGGATCAGTACAAGTTCTGCTACGAGGTGGCCCTGGAATACTTGAATTCTGGC  3744