Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_11079
Subject:
NM_001199763.2
Aligned Length:
979
Identities:
561
Gaps:
417

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MRRPRRPGGLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQARPLLQ  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  VTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPRLRPPEPRPRDRSGLAPKRPGPAGELLLQDIPTG  148

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 149  SAPAAQHRLPQPPVGKGGAGASSSLSPLQAELLPPLLEHLLLPPQPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFGSRDGSRV  222

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 223  SEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPAQLFQDSGLLYLAQELPAPSRARVPRL  296

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct 297  PEQGSSSRAEDSPEGYEKEGLGDRGEKPASPAVQPDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKG  370

Query   1  ------------------MEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVL  56
                             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGRNPGGVVNVGADIKKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVL  444

Query  57  LEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIVTDQKPLSLAAGVKLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRI  130
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||                             .||||||||||
Sbjct 445  LEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIVTDQ-----------------------------NVVGPALTFRI  489

Query 131  RHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLV  204
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490  RHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLV  563

Query 205  ALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQ  278
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564  ALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPEGAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQ  637

Query 279  ASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKNRH  352
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638  ASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKNRH  711

Query 353  PDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVE  426
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712  PDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVE  785

Query 427  DGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLL  500
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786  DGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLL  859

Query 501  DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFA  574
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860  DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFA  933

Query 575  LTAVAEEVNAILKALPQ  591
           |||||||||||||||||
Sbjct 934  LTAVAEEVNAILKALPQ  950