Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11079
• Subject: NM_001199764.2
• Aligned Length: 2667
• Identities: 1773
• Gaps: 894

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCCCAAGGATTGTCCTGGCACGATGACCTCACCCAGTATGTGATCTCTCAGGAGATGGAGCGCATCCCCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCTTCGCCCCCCAGAGCCCCGTCCAAGGGACAGGTCTGGCTTGGCACCCAAGAGACCTGGTCCTGCTGGAGAGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCTTTTACAGGACATCCCCACTGGCTCCGCCCCTGCTGCCCAGCATCGGCTTCCACAACCACCAGTGGGCAAA  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  GGTGGAGCTGGGGCCAGCTCCTCTCTGTCCCCTCTGCAGGCTGAGCTGCTCCCGCCTCTCTTGGAGCACCTGCT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GCTGCCCCCACAGCCTCCCCACCCTTCACTGAGTTACGAACCTGCCTTGCTGCAGCCCTACCTGTTCCACCAGT  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  TTGGCTCCCGTGATGGCTCCAGGGTCTCAGAGGGCTCCCCAGGGATGGTCAGTGTCGGCCCCCTGCCCAAGGCT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  GAAGCCCCTGCCCTCTTCAGCAGAACTGCCTCCAAGGGCATATTTGGGGACCACCCTGGCCACTCCTACGGGGA  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  CCTTCCAGGGCCTTCACCTGCCCAGCTTTTTCAAGACTCTGGGCTGCTCTATCTGGCCCAGGAGTTGCCAGCAC  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  CCAGCAGGGCCAGGGTGCCAAGGCTGCCAGAGCAAGGGAGCAGCAGCCGGGCAGAGGACTCCCCAGAGGGCTAT  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  GAGAAGGAAGGACTAGGGGATCGTGGAGAGAAGCCTGCTTCCCCAGCTGTGCAGCCAGATGCGGCTCTGCAGAG  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  GCTGGCCGCTGTGCTGGCGGGCTATGGGGTAGAGCTGCGTCAGCTGACCCCTGAGCAGCTCTCCACACTCCTGA  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  CCCTGCTGCAGCTACTGCCCAAGGGTGCAGGAAGAAATCCGGGAGGGGTTGTAAATGTTGGAGCTGATATCAAG  888

Query    1  ------ATGGAGGGGCCGGTGGAGGGCAGAGACACAGCAGAGCTTCCAGCCCGCACATCCCCCATGCCTGGACA  68
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAACAATGGAGGGGCCGGTGGAGGGCAGAGACACAGCAGAGCTTCCAGCCCGCACATCCCCCATGCCTGGACA  962

Query   69  CCCCACTGCCAGCCCTACCTCCAGTGAAGTCCAGCAGGTGCCAAGCCCTGTCTCCTCTGAGCCTCCCAAAGCTG  142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCCACTGCCAGCCCTACCTCCAGTGAAGTCCAGCAGGTGCCAAGCCCTGTCTCCTCTGAGCCTCCCAAAGCTG  1036

Query  143  CCAGACCCCCTGTGACACCTGTCCTGCTAGAGAAGAAAAGCCCACTGGGCCAGAGCCAGCCCACGGTGGCAGGA  216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCAGACCCCCTGTGACACCTGTCCTGCTAGAGAAGAAAAGCCCACTGGGCCAGAGCCAGCCCACGGTGGCAGGA  1110

Query  217  CAGCCCTCAGCCCGCCCAGCAGCAGAGGAATATGGCTACATCGTCACTGATCAGAAGCCCCTGAGCCTGGCTGC  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGCCCTCAGCCCGCCCAGCAGCAGAGGAATATGGCTACATCGTCACTGATCAGAAGCCCCTGAGCCTGGCTGC  1184

Query  291  AGGAGTGAAGCTGCTGGAGATCCTGGCTGAGCATGTGCACATGTCCTCAGGCAGCTTCATCAACATCAGTGTGG  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGAGTGAAGCTGCTGGAGATCCTGGCTGAGCATGTGCACATGTCCTCAGGCAGCTTCATCAACATCAGTGTGG  1258

Query  365  TGGGACCAGCCCTCACCTTCCGCATCCGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCTGATGTGACCCAACAAGCA  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGGACCAGCCCTCACCTTCCGCATCCGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCTGATGTGACCCAACAAGCA  1332

Query  439  GGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGAAGCACAGACAGGGCTCCAAATCTTGCAGACAGGAGTGGGACAGAGGGAGGA  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGAAGCACAGACAGGGCTCCAAATCTTGCAGACAGGAGTGGGACAGAGGGAGGA  1406

Query  513  GGCAGCTGCAGTCCTTCCCCAAACTGCGCACAGCACCTCACCCATGCGCTCAGTGCTGCTCACTCTGGTGGCCC  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCAGCTGCAGTCCTTCCCCAAACTGCGCACAGCACCTCACCCATGCGCTCAGTGCTGCTCACTCTGGTGGCCC  1480

Query  587  TGGCAGGTGTGGCTGGGCTGCTGGTGGCTCTGGCTGTGGCTCTGTGTGTGCGGCAGCATGCGCGGCAGCAAGAC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGCAGGTGTGGCTGGGCTGCTGGTGGCTCTGGCTGTGGCTCTGTGTGTGCGGCAGCATGCGCGGCAGCAAGAC  1554

Query  661  AAGGAGCGCCTGGCAGCCCTGGGGCCTGAGGGGGCCCATGGTGACACTACCTTTGAGTACCAGGACCTGTGCCG  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGGAGCGCCTGGCAGCCCTGGGGCCTGAGGGGGCCCATGGTGACACTACCTTTGAGTACCAGGACCTGTGCCG  1628

Query  735  CCAGCACATGGCCACGAAGTCCTTGTTCAACCGGGCAGAGGGTCCACCGGAGCCTTCACGGGTGAGCAGTGTGT  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGCACATGGCCACGAAGTCCTTGTTCAACCGGGCAGAGGGTCCACCGGAGCCTTCACGGGTGAGCAGTGTGT  1702

Query  809  CCTCCCAGTTCAGCGACGCAGCCCAGGCCAGCCCCAGCTCCCACAGCAGCACCCCGTCCTGGTGCGAGGAGCCG  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCTCCCAGTTCAGCGACGCAGCCCAGGCCAGCCCCAGCTCCCACAGCAGCACCCCGTCCTGGTGCGAGGAGCCG  1776

Query  883  GCCCAAGCCAACATGGACATCTCCACGGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTGCGGAACCGGGA  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCCAAGCCAACATGGACATCTCCACGGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTGCGGAACCGGGA  1850

Query  957  CCGCCTTGCCAAGGAGTGGCAGGCCCTCTGTGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCACCGCGCAGGGGG  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCGCCTTGCCAAGGAGTGGCAGGCCCTCTGTGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCACCGCGCAGGGGG  1924

Query 1031  AGGGCAACATCAAAAAGAACCGGCATCCTGACTTCCTGCCCTATGACCATGCCCGCATAAAACTGAAGGTGGAG  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGGCAACATCAAAAAGAACCGGCATCCTGACTTCCTGCCCTATGACCATGCCCGCATAAAACTGAAGGTGGAG  1998

Query 1105  AGCAGCCCTTCTCGGAGCGATTACATCAACGCCAGCCCCATTATTGAGCATGACCCTCGGATGCCAGCCTACAT  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCAGCCCTTCTCGGAGCGATTACATCAACGCCAGCCCCATTATTGAGCATGACCCTCGGATGCCAGCCTACAT  2072

Query 1179  AGCCACGCAGGGCCCGCTGTCCCATACCATCGCAGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGCGGCTGCACCGTCA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGCCACGCAGGGCCCGCTGTCCCATACCATCGCAGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGCGGCTGCACCGTCA  2146

Query 1253  TCGTCATGCTGACCCCGCTGGTGGAGGATGGTGTCAAGCAGTGTGACCGCTACTGGCCAGATGAGGGTGCCTCC  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCGTCATGCTGACCCCGCTGGTGGAGGATGGTGTCAAGCAGTGTGACCGCTACTGGCCAGATGAGGGTGCCTCC  2220

Query 1327  CTCTACCACGTATATGAGGTGAACCTGGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTTCTGGTGCGGAGCTTCTA  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTCTACCACGTATATGAGGTGAACCTGGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTTCTGGTGCGGAGCTTCTA  2294

Query 1401  CCTGAAGAACGTGCAGACCCAGGAGACGCGCACGCTCACGCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAGGGCA  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCTGAAGAACGTGCAGACCCAGGAGACGCGCACGCTCACGCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAGGGCA  2368

Query 1475  CACCGGCCTCCACGCGGCCCCTGCTGGACTTCCGCAGGAAGGTGAACAAGTGCTACCGGGGCCGCTCCTGCCCC  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CACCGGCCTCCACGCGGCCCCTGCTGGACTTCCGCAGGAAGGTGAACAAGTGCTACCGGGGCCGCTCCTGCCCC  2442

Query 1549  ATCATCGTGCACTGCAGTGATGGTGCGGGGAGGACCGGCACCTACATCCTCATCGACATGGTCCTGAACCGCAT  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATCATCGTGCACTGCAGTGATGGTGCGGGGAGGACCGGCACCTACATCCTCATCGACATGGTCCTGAACCGCAT  2516

Query 1623  GGCAAAAGGAGTGAAGGAGATTGACATCGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGCCTTGTCC  1696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGCAAAAGGAGTGAAGGAGATTGACATCGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGCCTTGTCC  2590

Query 1697  GCTCTAAGGACCAGTTTGAATTTGCCCTGACAGCCGTGGCGGAGGAAGTGAATGCCATCCTCAAGGCCCTGCCC  1770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GCTCTAAGGACCAGTTTGAATTTGCCCTGACAGCCGTGGCGGAGGAAGTGAATGCCATCCTCAAGGCCCTGCCC  2664

Query 1771  CAG  1773
            |||
Sbjct 2665  CAG  2667