Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_11079
- Subject:
- XM_011238678.2
- Aligned Length:
- 2671
- Identities:
- 1579
- Gaps:
- 905
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTCCCAAGGCTTGTCCTGGCATGATGACCTTACCCAGCATGTGATCTCCCAGGAGATGGAACGCATCCCCAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCTTCGCCCCCCAGAGCCCCATCCAAGGGACAGGTCTGGTTTGGTGCCCAGGAAACCAGGCCCTGCAGGGGAAT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGCTAACTCAGGGCAATCCTACTGGCTCCTCTCCTGCTGCCCAGGGCTTTCCAAGGCCTGCAGGGGGTGGGGAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGAGCTGGGGCGGGCTCCCCACTGTCCTCTCTGCAGGCTGAGTTGTTACCCCCTCTCTTGGAGCATCTGCTAAT 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 GCCCCCACAGCCTCCACACCCTGCTCTGACCTATGAACCTGCACTGCTACAGCCTTACCTCTTCCACCAGTTTG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GCTCCCGAGATGGCTCCCGGGGCTCAGAGAGCTCCTCTGGGGTAGTTGGTGTTGGTCACCTGTCCAAGGCTGAA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GGTCCTGCACTCTTCAGCAGAAGTGCCTCCAAGGCCATTTTGGGGACTCACTCTGGACACTCTTTTGGGGACCT 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TACAGGTCCCTCACCTGCTCAACTTTTCCAAGATTCAGGGCTGCTCTACATGGCCCAAGAGTTGCCAGTGCCTG 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GCAGAGCCCGGGCACCAAGGTTGCCAGAGAATGGGGGCAACAGGGCAGAGGACTCTTCAGAGGGCCATGAGGAG 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GAAGTACTAGGGGGTCGTGGGGAGAAGTCCCCTCCCCAAGCAGCACAACCAGAATTGAGTCTGCAGAGATTGAC 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 TGCTGTACTGGCAGGCTATGGAGTAGAGCTGCGTCAGTTGACCCCGGAGCAGTTTTCTACCCTCTTGACCCTGC 814
Query 1 ---------------------------------------------------ATGGAGGGGCCGGTG-------- 15
.||||||.||||.||
Sbjct 815 TGCAGTTGCTGCCCAAGGGCACAGGAAGAAATCTTGAAGGGGCTGTAAATGTTGGAGGAGCCGATGTCAAGAAA 888
Query 16 -----------------GAGGGCAGAGACACAGCAG-AGCTTCCAG-CCCGCACATCCCCCATGCCTGGACACC 70
|||.| |||||.|||||| |||| |.| |||.||||.||.|..|.|||||..|||
Sbjct 889 ACAATACAACAGATGCAGAGAG--GAGACCCAGCAGAAGCT--CTGCCCCCCACACCCTCGCTTCCTGGGTACC 958
Query 71 CCACTGCCAGCCCTACCTCCAGTGAAGTCCAGCAGGTGCCAAGCCCT-GTCTCCTCTGAGCCTCCCAAAGCTGC 143
.|||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||||..|||||| ||.||| ||||.||||||.|..|..|
Sbjct 959 TCACTGCCAGCCCTGCCTCCAGCGAAGTTCAGCAGGTGCTGAGCCCTGGTTTCC-CTGAACCTCCCCACACACC 1031
Query 144 CAGACCCCCTGTGACACCT-----GTCCTGCTAGAGAAGAAAAGCCCACTGGGCCAGAGCCAGCCCACGGTGGC 212
||| |||.||| |.|.||| |||||.||.|||||||||||.||..|||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1032 CAG-CCCTCTG-GGCTCCTCCTCAGTCCTTCTGGAGAAGAAAAGTCCCTTGGGCCAGAGCCAGCCCACAGTGGT 1103
Query 213 AGGACAGCCCTCAGCCCGCCCAGCAGCAGAGGAATATGGCTACATCGTCACTGATCAGAAGCCCCTGAGCCTGG 286
.||||.|||.|||||.||.|||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1104 GGGACGGCCATCAGCTCGACCATCGGCCGAGGAGTATGGCTATATCGTCACTGACCAGAAACCCCTGAGCCTGG 1177
Query 287 CTGCAGGAGTGAAGCTGCTGGAGATCCTGGCTGAGCATGTGCACATGTCCTCAGGCAGCTTCATCAACATCAGT 360
..||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1178 TGGCTGGAGTGAGGCTGCTGGAGATTCTGGCTGAGCACGTGCATATGTCCTCCGGTAGCTTTATCAACATCAGT 1251
Query 361 GTGGTGGGACCAGCCCTCACCTTCCGCATCCGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCTGATGTGACCCAACA 434
||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1252 GTGGTGGGACCAGCTGTCACCTTCCGAATCCGGCACAATGAGCAGAACCTGTCTTTGGCAGATGTGACCCAGCA 1325
Query 435 AGCAGGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGAAGCACAGACAGGGCTCCAAATCTTGCAGACAGGAGTGGGACAGAGGG 508
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1326 AGCTGGGCTGGTGAAGTCTGAACTGGAAGCGCAGACAGGGCTCCAGATTTTGCAGACAGGGGTGGGACAGAGGG 1399
Query 509 AGGAGGCAGCTGCAGTCCTTCCCCAAACTGCGCACAGCACCTCACCCATGCGCTCAGTGCTGCTCACTCTGGTG 582
||||.|||||||.|||||||||||.|...||.||..|||..||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1400 AGGAAGCAGCTGAAGTCCTTCCCCGACAAGCCCATGGCATATCTCCCATGCGCTCAGTGCTGCTTACTCTAGTG 1473
Query 583 GCCCTGGCAGGTGTGGCTGGGCTGCTGGTGGCTCTGGCTGTGGCTCTGTGTGTGCGGCAGCATGCGCGGCAGCA 656
|||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||..|||||.||||.||.|||.||.|.||||.
Sbjct 1474 GCCCTGGCAGGCGTCGCTGGGCTGCTAGTGGCTTTGGCAGTGGCCTTGTGTATGCGCCATCATTCGAGACAGCG 1547
Query 657 AGACAAGGAGCGCCTGGCAGCCCTGGGGCCTGAGGGGGCCCATGGTGACACTACCTTTGAGTACCAGGACCTGT 730
.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1548 GGATAAGGAGCGCCTGGCAGCGCTGGGGCCGGAGGGGGCCCATGGTGACACTACTTTTGAGTACCAGGACCTGT 1621
Query 731 GCCGCCAGCACATGGCCACGAAGTCCTTGTTCAACCGGGCAGAGGGTCCACCGGAGCCTTCACGGGTGAGCAGT 804
|.|||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||||..||.||||||||..|||||||||||
Sbjct 1622 GTCGCCAGCACATGGCCACAAAGTCCCTGTTTAACCGGGCGGAGGGTCAGCCAGAGCCTTCTAGGGTGAGCAGT 1695
Query 805 GTGTCCTCCCAGTTCAGCGACGCAGCCCAGGCCAGCCCCAGCTCCCACAGCAGCACCCCGTCCTGGTGCGAGGA 878
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1696 GTGTCCTCCCAGTTCAGCGACGCGGCCCAGGCCAGCCCCAGTTCCCACAGCAGCACACCATCTTGGTGCGAGGA 1769
Query 879 GCCGGCCCAAGCCAACATGGACATCTCCACGGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTGCGGAACC 952
|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1770 GCCCGCCCAGGCCAACATGGACATCTCCACAGGACACATGATTCTGGCATACATGGAGGATCACCTTCGGAACC 1843
Query 953 GGGACCGCCTTGCCAAGGAGTGGCAGGCCCTCTGTGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCACCGCGCAG 1026
|||||||..|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 1844 GGGACCGGTTGGCCAAGGAGTGGCAGGCTCTGTGCGCCTACCAAGCAGAGCCAAACACCTGTGCCGCCGCACAG 1917
Query 1027 GGGGAGGGCAACATCAAAAAGAACCGGCATCCTGACTTCCTGCCCTATGACCATGCCCGCATAAAACTGAAGGT 1100
|..|||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1918 GATGAGAGCAACATCAAGAAGAACCGCCATCCTGACTTCCTACCCTATGACCATGCCCGAATCAAGCTGAAAGT 1991
Query 1101 GGAGAGCAGCCCTTCTCGGAGCGATTACATCAACGCCAGCCCCATTATTGAGCATGACCCTCGGATGCCAGCCT 1174
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1992 GGAGAGCAGCCCTTCTCGGAGTGATTACATCAACGCCAGCCCCATCATCGAGCATGACCCTCGGATGCCGGCCT 2065
Query 1175 ACATAGCCACGCAGGGCCCGCTGTCCCATACCATCGCAGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGCGGCTGCACC 1248
||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 2066 ACATAGCCACACAGGGACCACTGTCCCACACCATCGCGGACTTCTGGCAGATGGTGTGGGAGAGTGGCTGCACT 2139
Query 1249 GTCATCGTCATGCTGACCCCGCTGGTGGAGGATGGTGTCAAGCAGTGTGACCGCTACTGGCCAGATGAGGGTGC 1322
||||||||.||||||||||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||..|
Sbjct 2140 GTCATCGTTATGCTGACCCCGTTGGTGGAGGACGGTGTCAAACAGTGTGACCGCTACTGGCCGGATGAAGGATC 2213
Query 1323 CTCCCTCTACCACGTATATGAGGTGAACCTGGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTTCTGGTGCGGAGCT 1396
.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2214 TTCCCTCTACCACGTCTATGAGGTGAACCTGGTGTCGGAGCACATCTGGTGCGAGGACTTCCTGGTGCGGAGCT 2287
Query 1397 TCTACCTGAAGAACGTGCAGACCCAGGAGACGCGCACGCTCACGCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAG 1470
|||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288 TCTACCTTAAGAACCTGCAGACCCAGGAGACGCGCACGCTCACTCAGTTCCACTTCCTCAGCTGGCCGGCAGAG 2361
Query 1471 GGCACACCGGCCTCCACGCGGCCCCTGCTGGACTTCCGCAGGAAGGTGAACAAGTGCTACCGGGGCCGCTCCTG 1544
|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 2362 GGCACTCCGGCCTCCACCCGGCCGCTGCTGGACTTCCGCAGGAAAGTGAACAAGTGCTACAGAGGCCGCTCCTG 2435
Query 1545 CCCCATCATCGTGCACTGCAGTGATGGTGCGGGGAGGACCGGCACCTACATCCTCATCGACATGGTCCTGAACC 1618
|||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2436 CCCCATCATAGTGCACTGCAGTGACGGTGCAGGGAGGACAGGCACCTACATCCTTATTGACATGGTCCTGAATC 2509
Query 1619 GCATGGCAAAAGGAGTGAAGGAGATTGACATCGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGCCTT 1692
|||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2510 GCATGGCCAAAGGAGTGAAGGAGATTGATATTGCTGCCACCCTGGAGCATGTCCGTGACCAGCGGCCTGGACTT 2583
Query 1693 GTCCGCTCTAAGGACCAGTTTGAATTTGCCCTGACAGCCGTGGCGGAGGAAGTGAATGCCATCCTCAAGGCCCT 1766
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2584 GTCCGTTCTAAGGACCAGTTTGAGTTTGCGCTGACAGCCGTGGCAGAGGAGGTGAATGCTATCCTCAAGGCCCT 2657
Query 1767 GCCCCAG 1773
|||||||
Sbjct 2658 GCCCCAG 2664
